三種植物線粒體基因低溫差異表達(dá)比較分析
發(fā)布時(shí)間:2022-07-04 21:01
線粒體作為植物細(xì)胞的能量代謝中心,在植物響應(yīng)逆境脅迫中有重要的作用。該研究基于雪蓮(Saussurea involucrata)、番茄(Lycopersicon esculentum)和擬南芥(Arabidopsis thaliana)三種不同低溫耐受性植物的低溫轉(zhuǎn)錄組。通過(guò)blast比對(duì)和數(shù)據(jù)庫(kù)檢索篩選相關(guān)物種的線粒體基因,使用PlantCARE在線網(wǎng)站分析啟動(dòng)子,使用mega7軟件對(duì)系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建分析。結(jié)果表明:通過(guò)差異表達(dá)基因篩選,分別在雪蓮、擬南芥、番茄中篩選出2、24、15個(gè)顯著差異表達(dá)基因,主要包括線粒體核糖體亞基和電子傳遞鏈各復(fù)合體亞基,其中部分基因的低溫差異表達(dá)情況如NAD1和NAD5,可能與植物的低溫適應(yīng)性有關(guān);通過(guò)表達(dá)模式的聚類分析,雪蓮與擬南芥在基因的表達(dá)模式上相對(duì)于番茄更為相近,且不同類別的基因表達(dá)模式在不同物種間差異較大;雪蓮與其他菊科植物的呼吸鏈相關(guān)基因的蛋白序列具有很大差異,與萬(wàn)年蘚(Climacium dendroides)、牛舌蘚(Anomodon minor)等高山植物的進(jìn)化距離較近。在整體上擬南芥、番茄和雪蓮三種植物線粒體基因在低溫響應(yīng)上具有很大差...
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 雪蓮、番茄、擬南芥線粒體低溫差異表達(dá)基因的抽取
1.2 三種植物線粒體基因低溫差異表達(dá)對(duì)比
1.3 三種植物線粒體低溫差異表達(dá)基因的驗(yàn)證
1.4 三種植物的線粒體呼吸鏈基因的啟動(dòng)子分析
1.5 多種植物線粒體低溫差異表達(dá)基因的進(jìn)化關(guān)系分析
2 結(jié)果與分析
2.1 三種植物低溫差異表達(dá)線粒體基因篩選
2.2 三種植物線粒體低溫差異基因相對(duì)表達(dá)量分析通過(guò)三種植物低溫差異表達(dá)熱圖,雪蓮與擬
2.3 三種植物的線粒體基因低溫差異表達(dá)情況的驗(yàn)證
2.4 三種植物的線粒體呼吸鏈基因的啟動(dòng)子分析
2.5 不同溫度適應(yīng)性植物線粒體基因序列分析與對(duì)比
3 討論與結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新疆天山雪蓮轉(zhuǎn)錄組注解知識(shí)庫(kù)[J]. 李錦,嚴(yán)潘瑤,錢飛箭,邱寶義,夏雯雯,牟曉威,邱麗娟,林忠平,陳銘,祝建波,陳賢豐. 植物學(xué)報(bào). 2017(04)
[2]植物線粒體呼吸狀態(tài)的研究方法及其在植物生物學(xué)中的應(yīng)用[J]. 劉美君,孫學(xué)娟,張子山,劉玉亭,高輝遠(yuǎn). 植物生理學(xué)報(bào). 2014(01)
[3]干旱脅迫對(duì)持綠性高粱葉片滲透調(diào)節(jié)及葉綠體超微結(jié)構(gòu)的影響[J]. 周宇飛,王德權(quán),陸樟鑣,王娜,王藝陶,李豐先,許文娟,黃瑞冬. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2013(09)
[4]線粒體復(fù)合體及其對(duì)活性氧的調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 馬曉蕾,周麗娟,孫孟超,任靜,宋興舜. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(19)
博士論文
[1]高山離子芥線粒體交替途徑介導(dǎo)的抗寒特征研究[D]. 常建鋒.蘭州大學(xué) 2007
本文編號(hào):3655916
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 雪蓮、番茄、擬南芥線粒體低溫差異表達(dá)基因的抽取
1.2 三種植物線粒體基因低溫差異表達(dá)對(duì)比
1.3 三種植物線粒體低溫差異表達(dá)基因的驗(yàn)證
1.4 三種植物的線粒體呼吸鏈基因的啟動(dòng)子分析
1.5 多種植物線粒體低溫差異表達(dá)基因的進(jìn)化關(guān)系分析
2 結(jié)果與分析
2.1 三種植物低溫差異表達(dá)線粒體基因篩選
2.2 三種植物線粒體低溫差異基因相對(duì)表達(dá)量分析通過(guò)三種植物低溫差異表達(dá)熱圖,雪蓮與擬
2.3 三種植物的線粒體基因低溫差異表達(dá)情況的驗(yàn)證
2.4 三種植物的線粒體呼吸鏈基因的啟動(dòng)子分析
2.5 不同溫度適應(yīng)性植物線粒體基因序列分析與對(duì)比
3 討論與結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新疆天山雪蓮轉(zhuǎn)錄組注解知識(shí)庫(kù)[J]. 李錦,嚴(yán)潘瑤,錢飛箭,邱寶義,夏雯雯,牟曉威,邱麗娟,林忠平,陳銘,祝建波,陳賢豐. 植物學(xué)報(bào). 2017(04)
[2]植物線粒體呼吸狀態(tài)的研究方法及其在植物生物學(xué)中的應(yīng)用[J]. 劉美君,孫學(xué)娟,張子山,劉玉亭,高輝遠(yuǎn). 植物生理學(xué)報(bào). 2014(01)
[3]干旱脅迫對(duì)持綠性高粱葉片滲透調(diào)節(jié)及葉綠體超微結(jié)構(gòu)的影響[J]. 周宇飛,王德權(quán),陸樟鑣,王娜,王藝陶,李豐先,許文娟,黃瑞冬. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2013(09)
[4]線粒體復(fù)合體及其對(duì)活性氧的調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 馬曉蕾,周麗娟,孫孟超,任靜,宋興舜. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(19)
博士論文
[1]高山離子芥線粒體交替途徑介導(dǎo)的抗寒特征研究[D]. 常建鋒.蘭州大學(xué) 2007
本文編號(hào):3655916
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