文冠果WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及非生物脅迫響應(yīng)模式分析
發(fā)布時間:2022-06-03 22:18
文冠果是中國特有的一種優(yōu)良的木本糧油植物,雖然文冠果作為一種比較重要的經(jīng)濟林木,但以往對文冠果的研究較少,而且主要集中在植物育種研究方面。WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族在植物生長發(fā)育、環(huán)境適應(yīng)等生物學(xué)方面發(fā)揮著重要作用。最近公布的文冠果基因組序列為鑒定和描述整個文冠果WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族提供了機會。鑒定成員,探索文冠果WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族的組成和進化,研究XsWRKY在鹽脅迫、ABA、寒冷脅迫下的表達模式,分析差異表達的基因的功能,有利于進一步了解木本植物中XsWRKY轉(zhuǎn)錄因子家族的演化以及文冠果抗逆及其調(diào)控機制,為文冠果的抗逆品種改良方面提供基因資源和理論基礎(chǔ)。本研究得出以下結(jié)論:(1)在文冠果中鑒定了 65個XsWRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員。(2)文冠果XsWRKY轉(zhuǎn)錄因子家族主要分成7個亞家族,其中Ⅱa亞家族成員數(shù)量最少,Ⅲ亞家族成員WRKY結(jié)構(gòu)域保守性最弱,Ⅱ亞家族成員最為廣泛。(3)各亞家族XsWRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員的保守基序和基因結(jié)構(gòu)組成與家族分類具有較高一致性,但不同亞家族間也存在各自特異性的保守基序和基因結(jié)構(gòu)。(4)XsWRKY基因家族可能對ABA、IAA、GA、MeJA、SA激素...
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 文冠果概述
1.1.1 文冠果簡介
1.1.2 文冠果價值
1.2 WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族在植物中的功能
1.2.1 WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族概述
1.2.2 WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族的生物學(xué)功能
1.2.3 林木物種WRKY研究
1.3 研究的目的和意義
2 文冠果WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定和分析
2.1 引言
2.2 實驗材料
2.3 實驗方法
2.3.1 文冠果中WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員鑒定
2.3.2 WRKY家族的分類
2.3.3 WRKY家族成員的基因結(jié)構(gòu)和保守Motif
2.3.4 WRKY基因家族啟動子區(qū)域順式作用元件分析
2.3.5 WRKY基因家族共線性分析
2.4 結(jié)果與分析
2.4.1 XsWRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員
2.4.2 XsWRKY家族組成及系統(tǒng)發(fā)育樹
2.4.3 XsWRKY家族的保守結(jié)構(gòu)
2.4.4 XsWRKY基因家族啟動子區(qū)域的順式作用元件組成
2.4.5 WRKY基因家族共線性
2.5 本章小結(jié)
3 文冠果WRKY基因家族的表達分析
3.1 引言
3.2 實驗材料
3.2.1 植物材料
3.3 實驗方法
3.3.1 植物材料的處理
3.3.2 RNA-seq數(shù)據(jù)分析
3.3.3 文冠果幼苗葉片總RNA提取
3.3.4 XsWRKY基因cDNA合成
3.3.5 XsWRKY基因?qū)崟r熒光定量PCR (qRT-PCR)檢測
3.4 結(jié)果與分析
3.4.1 XsWRKY基因在NaCl脅迫下的表達模式
3.4.2 XsWRKY基因在冷脅迫下的表達模式
3.4.3 XsWRKY基因在ABA脅迫下的表達模式
3.5 本章小結(jié)
討論
結(jié)論
參考文獻
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鹽堿脅迫對文冠果幼苗水力學(xué)特征和碳素分配的影響[J]. 張蕓香,王林,田吉,樊興路,郭晉平. 水土保持學(xué)報. 2019(06)
[2]張掖市文冠果產(chǎn)業(yè)發(fā)展探討[J]. 王藝林,趙玉紅,李小燕,劉建海,張虎. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2019(18)
[3]文冠果茶營養(yǎng)價值與功效淺析[J]. 潘曉梅,丁福斌. 食品安全導(dǎo)刊. 2019(21)
[4]文冠果油成分及加工工藝的研究進展[J]. 劉金鳳,張倩茹,尹蓉,韓彥龍,高忠東,殷龍龍,孫慧英,王賢萍. 農(nóng)產(chǎn)品加工. 2018(16)
[5]ThERF1 from Tamarix hispida confers decreased tolerance to oxidative and drought stresses and is regulated by a WRKY protein[J]. Liuqiang Wang,Chao Wang,Liping Qin,Ping Hu,Yucheng Wang. Journal of Forestry Research. 2016(04)
[6]文冠果研究進展[J]. 敖妍,段劼,于海燕,姜常玉,馬履一. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(06)
[7]文冠果營養(yǎng)成分分析及食用價值研究[J]. 吳麗清,鄭戰(zhàn)偉,付鳳奇,鄧紅,曹立強,劉偉. 農(nóng)產(chǎn)品加工(學(xué)刊). 2010(11)
[8]文冠果地理分布和生物生態(tài)學(xué)特性[J]. 萬群芳,何景峰,張文輝. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2010(09)
[9]擬南芥AtWRKY25、AtWRKY26和AtWRKY33在非生物脅迫條件下的表達分析[J]. 付乾堂,余迪求. 遺傳. 2010(08)
[10]文冠果開花座果研究進展[J]. 丁明秀,敖妍. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2008(10)
碩士論文
[1]文冠果油的提取及其生物柴油制備工藝研究[D]. 孫俊.陜西師范大學(xué) 2008
本文編號:3653578
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 文冠果概述
1.1.1 文冠果簡介
1.1.2 文冠果價值
1.2 WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族在植物中的功能
1.2.1 WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族概述
1.2.2 WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族的生物學(xué)功能
1.2.3 林木物種WRKY研究
1.3 研究的目的和意義
2 文冠果WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定和分析
2.1 引言
2.2 實驗材料
2.3 實驗方法
2.3.1 文冠果中WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員鑒定
2.3.2 WRKY家族的分類
2.3.3 WRKY家族成員的基因結(jié)構(gòu)和保守Motif
2.3.4 WRKY基因家族啟動子區(qū)域順式作用元件分析
2.3.5 WRKY基因家族共線性分析
2.4 結(jié)果與分析
2.4.1 XsWRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員
2.4.2 XsWRKY家族組成及系統(tǒng)發(fā)育樹
2.4.3 XsWRKY家族的保守結(jié)構(gòu)
2.4.4 XsWRKY基因家族啟動子區(qū)域的順式作用元件組成
2.4.5 WRKY基因家族共線性
2.5 本章小結(jié)
3 文冠果WRKY基因家族的表達分析
3.1 引言
3.2 實驗材料
3.2.1 植物材料
3.3 實驗方法
3.3.1 植物材料的處理
3.3.2 RNA-seq數(shù)據(jù)分析
3.3.3 文冠果幼苗葉片總RNA提取
3.3.4 XsWRKY基因cDNA合成
3.3.5 XsWRKY基因?qū)崟r熒光定量PCR (qRT-PCR)檢測
3.4 結(jié)果與分析
3.4.1 XsWRKY基因在NaCl脅迫下的表達模式
3.4.2 XsWRKY基因在冷脅迫下的表達模式
3.4.3 XsWRKY基因在ABA脅迫下的表達模式
3.5 本章小結(jié)
討論
結(jié)論
參考文獻
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鹽堿脅迫對文冠果幼苗水力學(xué)特征和碳素分配的影響[J]. 張蕓香,王林,田吉,樊興路,郭晉平. 水土保持學(xué)報. 2019(06)
[2]張掖市文冠果產(chǎn)業(yè)發(fā)展探討[J]. 王藝林,趙玉紅,李小燕,劉建海,張虎. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2019(18)
[3]文冠果茶營養(yǎng)價值與功效淺析[J]. 潘曉梅,丁福斌. 食品安全導(dǎo)刊. 2019(21)
[4]文冠果油成分及加工工藝的研究進展[J]. 劉金鳳,張倩茹,尹蓉,韓彥龍,高忠東,殷龍龍,孫慧英,王賢萍. 農(nóng)產(chǎn)品加工. 2018(16)
[5]ThERF1 from Tamarix hispida confers decreased tolerance to oxidative and drought stresses and is regulated by a WRKY protein[J]. Liuqiang Wang,Chao Wang,Liping Qin,Ping Hu,Yucheng Wang. Journal of Forestry Research. 2016(04)
[6]文冠果研究進展[J]. 敖妍,段劼,于海燕,姜常玉,馬履一. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(06)
[7]文冠果營養(yǎng)成分分析及食用價值研究[J]. 吳麗清,鄭戰(zhàn)偉,付鳳奇,鄧紅,曹立強,劉偉. 農(nóng)產(chǎn)品加工(學(xué)刊). 2010(11)
[8]文冠果地理分布和生物生態(tài)學(xué)特性[J]. 萬群芳,何景峰,張文輝. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2010(09)
[9]擬南芥AtWRKY25、AtWRKY26和AtWRKY33在非生物脅迫條件下的表達分析[J]. 付乾堂,余迪求. 遺傳. 2010(08)
[10]文冠果開花座果研究進展[J]. 丁明秀,敖妍. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2008(10)
碩士論文
[1]文冠果油的提取及其生物柴油制備工藝研究[D]. 孫俊.陜西師范大學(xué) 2008
本文編號:3653578
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