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基因組學(xué)技術(shù)在病毒鑒定與宿主溯源中的應(yīng)用

發(fā)布時間:2022-02-24 06:48
  基因組學(xué)技術(shù),特別是宏基因組測序在未知病毒的鑒定與溯源中起到了重要作用。相較于傳統(tǒng)的病毒分離培養(yǎng)方法,宏基因組技術(shù)可以從混合樣本中獲得病毒的核酸序列,極大加速了未知病毒的鑒定與溯源,在針對高流行性、高致病性的病毒研究中發(fā)揮了重要作用。基于宏基因組技術(shù)對未知病毒進行鑒定和溯源,其準(zhǔn)確性很大程度上依賴于取樣及已知宿主的病毒庫的完整性。然而,當(dāng)前病毒多樣性的基礎(chǔ)研究相對薄弱,病毒的宿主信息則更加匱乏。野生動物和畜禽是人畜共患病致病病毒的重要中間宿主,構(gòu)建廣泛的動物–病毒關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫對于準(zhǔn)確、快速地鑒定和預(yù)防致病性病毒具有重要意義。本綜述以SARS-CoV-2為例,總結(jié)了基因組學(xué)技術(shù)在病毒的鑒定與溯源上的應(yīng)用,并針對當(dāng)前動物病毒庫完整性低的現(xiàn)狀,對構(gòu)建野生和家養(yǎng)動物攜帶病毒的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫的可行性提出依據(jù)與建議。 

【文章來源】:生物多樣性. 2020,28(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:9 頁

【文章目錄】:
1 基于宏基因組方法鑒定病毒種類
2 構(gòu)建基因組系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,分析病毒進化歷史并推測其宿主來源
3 利用基因組學(xué)方法構(gòu)建完善的病毒基因數(shù)據(jù)庫及“宿主–病毒”關(guān)聯(lián)信息庫
4 問題與展望


【參考文獻】:
期刊論文
[1]On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2[J]. Xiaolu Tang,Changcheng Wu,Xiang Li,Yuhe Song,Xinmin Yao,Xinkai Wu,Yuange Duan,Hong Zhang,Yirong Wang,Zhaohui Qian,Jie Cui,Jian Lu.  National Science Review. 2020(06)
[2]Decoding the evolution and transmissions of the novel pneumonia coronavirus(SARS-CoV-2/HCoV-19)using whole genomic data[J]. Wen-Bin Yu,Guang-Da Tang,Li Zhang,Richard T.Corlett.  Zoological Research. 2020(03)



本文編號:3642192

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