虎耳草科（Saxifragaceae）為虎耳草目多年生草本植物,共含有30多個(gè)屬600多個(gè)種且主要分布在北半球,其多樣性中心位于喜馬拉雅、亞洲東部和北美西部。該科可分為虎耳草類群和礬根類群,而在礬根類群中又由9個(gè)屬構(gòu)成了礬根組,由于礬根組內(nèi)廣泛存在多個(gè)屬的屬間和屬內(nèi)雜交,使其成為研究雜交事件對系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系重建影響的理想模型。黃水枝屬（Tiarella L.）為礬根組中的一個(gè)小屬,共含有三個(gè)物種（黃水枝、心葉黃水枝和三葉黃水枝）,具有獨(dú)特的東亞-北美西部-北美東部間斷分布模式（在三地區(qū)各分布1種）。前人研究已確定該屬在整個(gè)科的系統(tǒng)位置并揭示其起源于北美西部,但屬下種間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系及分化歷史尚未得到解決。本研究基于二代高通量測序中的基因組淺層測序技術(shù)（genome skimming）對礬根組3個(gè)屬7個(gè)物種共11個(gè)個(gè)體進(jìn)行了測序,結(jié)合虎耳草科已經(jīng)發(fā)表的葉綠體基因組和礬根組部分發(fā)表的核ETS和ITS序列對該科的葉綠體基因組進(jìn)化模式、黃水枝屬系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系以及與近緣屬是否存在由古老雜交導(dǎo)致的葉綠體捕獲事件及捕獲方向進(jìn)行了研究。主要得到了以下結(jié)果:（1）葉綠體基因組測序及分析對測序得到的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行... 

【文章來源】：河南大學(xué)河南省

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
1 緒論
    1.1 被子植物分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展
    1.2 被子植物分子系統(tǒng)學(xué)中常遇到的挑戰(zhàn)
    1.3 黃水枝屬研究進(jìn)展及存在問題
    1.4 本研究的目的及意義
2 資源調(diào)查及野外采樣
    2.1 資源調(diào)查及采樣方法
    2.2 野外調(diào)查及采集結(jié)果
        2.2.1 野外調(diào)查及形態(tài)特征描述
        2.2.2 樣品采集結(jié)果
3 實(shí)驗(yàn)材料與方法
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
        3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑及配制方法
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器及耗材
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 植物樣品DNA的提取及檢測
        3.2.2 DNA文庫構(gòu)建與測序
        3.2.3 葉綠體基因組組裝與注釋
        3.2.4 虎耳草科葉綠體基因組的比較分析
        3.2.5 ETS與 ITS序列獲取
        3.2.6 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
        3.2.7 黃水枝屬基因組遺傳資源開發(fā)
4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    4.1 樣品DNA的提取及檢測
    4.2 葉綠體基因組拼接與組裝
    4.3 葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)特征
    4.4 虎耳草科的葉綠體基因組比較分析
    4.5 黃水枝屬系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系重建
    4.6 黃水枝屬基因組遺傳資源開發(fā)
5 討論
    5.1 基因組淺層測序技術(shù)(Genome skimming)的應(yīng)用
    5.2 黃水枝屬多次捕獲礬根屬葉綠體基因組
6 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
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本文編號：3642123