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擬南芥生態(tài)型Tor-1根系響應鎘的轉錄組學與可變剪接分析

發(fā)布時間:2022-02-09 08:53
  【目的】研究擬南芥生態(tài)型根系對鎘(Cd)的適應性機制,挖掘耐Cd基因,為培育修復型植物提供生理基礎和理論指導。【方法】本研究以高Cd積累同時高耐受性的擬南芥生態(tài)型Tor-1為試驗材料,測定Cd處理后根系的生理變化、氧化應激反應、抗氧化酶活性,結合轉錄組學和可變剪接分析,以期從分子水平上解析Tor-1根系對Cd的適應性機制!窘Y果】Cd處理后,擬南芥生態(tài)型Tor-1的主根長度和根尖數(shù)沒有明顯差異,但根系總體積、總表面積顯著降低,總根長極顯著下降,表明根系受到損傷;根系丙二醛濃度較對照有所增加,但變化不顯著;脯氨酸濃度顯著下降;超氧化物歧化酶(SOD)和過氧化氫酶(CAT)活性顯著增加。基因本位論(GO)富集分析顯示,在生物過程中,差異表達基因(DEGs)在代謝過程和對化學物質的反應功能富集最為顯著;在細胞組分中,DEGs在細胞外組分功能顯著富集;在核酸功能中,DEGs在氧化應激活性和血紅素結合功能顯著富集。京都基因和基因組百科全書(KEGG)通路表明,高比例誘導的DEGs富集于7條KEGG途徑,分別為苯丙素生物合成(4.49%)、次生代謝物的生物合成(14.45%)、代謝途徑(20.57... 

【文章來源】:植物營養(yǎng)與肥料學報. 2020,26(08)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:13 頁

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3616724

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