基于葉綠體基因組的香青屬分子系統(tǒng)學(xué)研究
發(fā)布時間:2022-01-25 06:26
香青屬(Anaphalis DC)是菊科(Asteraceae/Compositae)鼠麴草族(Gnaphalieae)的一個大屬,約有110余種。主要分布于亞洲熱帶和亞熱帶地區(qū),以泛喜馬拉雅地區(qū)為分布中心,少數(shù)分布于歐洲和北美。香青屬屬下類群多,葉形、頭狀花序、小花等形態(tài)性狀變異非常復(fù)雜,在屬下種間以及與近緣屬之間性狀存在交叉現(xiàn)象,且多數(shù)種類在形態(tài)上表現(xiàn)出多型性現(xiàn)象,存在雜交以及多倍化現(xiàn)象,其屬內(nèi)種間以及與近緣屬間的系統(tǒng)學(xué)關(guān)系一直備受爭議。植物葉綠體具有基因組較小,但包含大量的遺傳信息;易提取分離;在分子水平上的差異明顯等特點,被廣泛用于物種系統(tǒng)發(fā)育研究。本研究利用高通量測序技術(shù)對香青屬61個類群(隸屬于47種)和3個擬鼠麴草屬物種進行二代測序,利用生物信息學(xué)方法注釋所有的葉綠體基因組序列,對其特征進行比較分析,并用葉綠體基因組序列和細胞核基因序列(ITS、ETS)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)合形態(tài)學(xué)特征探究了香青屬屬下類群間及與近緣屬間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。本研究的主要內(nèi)容及結(jié)果如下:1.本研究通過高通量測序技術(shù)獲得53個香青屬類群和3個擬鼠麴草屬類群的完整葉綠體基因組序列,以及8個不完整的香青屬...
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:94 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
香青屬在中國地理分布圖(來自360地圖)
23圖 3.1 珠光香青葉綠體基因組圖譜注:內(nèi)圈基因順時針方向轉(zhuǎn)錄,外圈基因順序逆時針轉(zhuǎn)錄。不同的顏色表示基因不同的功能。內(nèi)圈中的深灰色區(qū)域表示 GC 含量,而淺灰色表示基因組的 AT 含量。Figure 3.1 Gene map of the A. margaritaceae chloroplast genome.Note: Genes drawn inside the circle are transcribed clockwise, and those outside arecounterclockwise. The colored bars indicate different functional groups. The dark gray area in theinner circle corresponds to GC content while the light gray corresponds to theAT content of thegenome.
38圖 3.3 菊科植物 trnT-GGU 比較Figure 3.3 Comparison of trnT-GGU sequences among Asteraceae species.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于高通量測序組裝‘赤霞珠’葉綠體基因組及其特征分析[J]. 謝海坤,焦健,樊秀彩,張穎,姜建福,孫海生,劉崇懷. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(09)
[2]藥用植物葉綠體基因組研究進展[J]. 倪梁紅,趙志禮,米瑪. 中藥材. 2015(09)
[3]香青中農(nóng)用抗菌活性研究[J]. 楊凌云,曹慧,高寧馨. 北京農(nóng)業(yè). 2015(09)
[4]茶樹“龍井43"葉綠體基因組測序及其系統(tǒng)進化(英文)[J]. 葉曉倩,趙忠輝,朱全武,王營營,林張翔,葉楚玉,樊龍江,須海榮. 浙江大學(xué)學(xué)報(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2014(04)
[5]光苞紫菊Notoseris macilenta的核型分析[J]. 關(guān)莉,陸陽,朱世新. 鄭州師范教育. 2013(06)
[6]基于葉綠體DNA序列的Ceratotropis亞屬遺傳進化研究[J]. 劉巖,程須珍,王麗俠,王素華,白鵬. 作物學(xué)報. 2013(06)
[7]基于454FLX高通量技術(shù)的厚樸葉綠體全基因組測序及應(yīng)用研究[J]. 李西文,胡志剛,林小涵,李卿,高歡歡,羅國安,陳士林. 藥學(xué)學(xué)報. 2012(01)
[8]葉綠體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)的研究進展[J]. 張韻潔,李德銖. 植物分類與資源學(xué)報. 2011(04)
[9]14種高原植物抑制植物病原菌活性的初步研究[J]. 楊茜,王晶,達娃,楊從軍,全鑫,陶科,侯太平. 四川大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2011(03)
[10]植物DNA條形碼技術(shù)的發(fā)展及應(yīng)用[J]. 劉宇婧,劉越,黃耀江,龍春林. 植物資源與環(huán)境學(xué)報. 2011(01)
博士論文
[1]基于高通量測序技術(shù)的小麥和紫莖澤蘭基因組學(xué)初步研究[D]. 聶小軍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[2]毛鱗菊屬和細萵苣屬的系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 朱世新.中國科學(xué)院研究生院(植物研究所) 2004
碩士論文
[1]羊草葉綠體全基因組分析及分子標(biāo)記開發(fā)[D]. 楊艷婷.揚州大學(xué) 2018
[2]十種報春花屬植物的葉綠體基因組研究[D]. 任婷.西北大學(xué) 2018
[3]葡萄屬葉綠體基因組分析及其系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 王義華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]地黃屬植物葉綠體基因組研究[D]. 曾淑云.西北大學(xué) 2017
[5]泛喜馬拉雅地區(qū)香青屬植物系統(tǒng)分類學(xué)研究[D]. 許雪敏.鄭州大學(xué) 2017
[6]百合屬的比較葉綠體基因組學(xué)研究[D]. 畢彧.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[7]稗草葉綠體基因組測序及其分子標(biāo)記開發(fā)與利用[D]. 林張翔.浙江大學(xué) 2015
[8]假福王草屬Paraprenanthes(菊科—菊苣族)的系統(tǒng)學(xué)初步研究[D]. 陸陽.鄭州大學(xué) 2013
[9]中國香青屬植物系統(tǒng)分類學(xué)初步研究[D]. 張燕梅.鄭州大學(xué) 2009
[10]青藏高原東緣高寒草甸傳播體微形態(tài)特征研究[D]. 景國海.西北師范大學(xué) 2007
本文編號:3608052
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:94 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
香青屬在中國地理分布圖(來自360地圖)
23圖 3.1 珠光香青葉綠體基因組圖譜注:內(nèi)圈基因順時針方向轉(zhuǎn)錄,外圈基因順序逆時針轉(zhuǎn)錄。不同的顏色表示基因不同的功能。內(nèi)圈中的深灰色區(qū)域表示 GC 含量,而淺灰色表示基因組的 AT 含量。Figure 3.1 Gene map of the A. margaritaceae chloroplast genome.Note: Genes drawn inside the circle are transcribed clockwise, and those outside arecounterclockwise. The colored bars indicate different functional groups. The dark gray area in theinner circle corresponds to GC content while the light gray corresponds to theAT content of thegenome.
38圖 3.3 菊科植物 trnT-GGU 比較Figure 3.3 Comparison of trnT-GGU sequences among Asteraceae species.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于高通量測序組裝‘赤霞珠’葉綠體基因組及其特征分析[J]. 謝海坤,焦健,樊秀彩,張穎,姜建福,孫海生,劉崇懷. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(09)
[2]藥用植物葉綠體基因組研究進展[J]. 倪梁紅,趙志禮,米瑪. 中藥材. 2015(09)
[3]香青中農(nóng)用抗菌活性研究[J]. 楊凌云,曹慧,高寧馨. 北京農(nóng)業(yè). 2015(09)
[4]茶樹“龍井43"葉綠體基因組測序及其系統(tǒng)進化(英文)[J]. 葉曉倩,趙忠輝,朱全武,王營營,林張翔,葉楚玉,樊龍江,須海榮. 浙江大學(xué)學(xué)報(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2014(04)
[5]光苞紫菊Notoseris macilenta的核型分析[J]. 關(guān)莉,陸陽,朱世新. 鄭州師范教育. 2013(06)
[6]基于葉綠體DNA序列的Ceratotropis亞屬遺傳進化研究[J]. 劉巖,程須珍,王麗俠,王素華,白鵬. 作物學(xué)報. 2013(06)
[7]基于454FLX高通量技術(shù)的厚樸葉綠體全基因組測序及應(yīng)用研究[J]. 李西文,胡志剛,林小涵,李卿,高歡歡,羅國安,陳士林. 藥學(xué)學(xué)報. 2012(01)
[8]葉綠體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)的研究進展[J]. 張韻潔,李德銖. 植物分類與資源學(xué)報. 2011(04)
[9]14種高原植物抑制植物病原菌活性的初步研究[J]. 楊茜,王晶,達娃,楊從軍,全鑫,陶科,侯太平. 四川大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2011(03)
[10]植物DNA條形碼技術(shù)的發(fā)展及應(yīng)用[J]. 劉宇婧,劉越,黃耀江,龍春林. 植物資源與環(huán)境學(xué)報. 2011(01)
博士論文
[1]基于高通量測序技術(shù)的小麥和紫莖澤蘭基因組學(xué)初步研究[D]. 聶小軍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[2]毛鱗菊屬和細萵苣屬的系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 朱世新.中國科學(xué)院研究生院(植物研究所) 2004
碩士論文
[1]羊草葉綠體全基因組分析及分子標(biāo)記開發(fā)[D]. 楊艷婷.揚州大學(xué) 2018
[2]十種報春花屬植物的葉綠體基因組研究[D]. 任婷.西北大學(xué) 2018
[3]葡萄屬葉綠體基因組分析及其系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 王義華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]地黃屬植物葉綠體基因組研究[D]. 曾淑云.西北大學(xué) 2017
[5]泛喜馬拉雅地區(qū)香青屬植物系統(tǒng)分類學(xué)研究[D]. 許雪敏.鄭州大學(xué) 2017
[6]百合屬的比較葉綠體基因組學(xué)研究[D]. 畢彧.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[7]稗草葉綠體基因組測序及其分子標(biāo)記開發(fā)與利用[D]. 林張翔.浙江大學(xué) 2015
[8]假福王草屬Paraprenanthes(菊科—菊苣族)的系統(tǒng)學(xué)初步研究[D]. 陸陽.鄭州大學(xué) 2013
[9]中國香青屬植物系統(tǒng)分類學(xué)初步研究[D]. 張燕梅.鄭州大學(xué) 2009
[10]青藏高原東緣高寒草甸傳播體微形態(tài)特征研究[D]. 景國海.西北師范大學(xué) 2007
本文編號:3608052
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3608052.html
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