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基于DNA計(jì)算模型的計(jì)算樹邏輯模型檢測算法研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-24 22:58
  計(jì)算樹邏輯(Computation Tree Logic,CTL)模型檢測是形式化方法研究的熱點(diǎn),是保證系統(tǒng)正確性的重要手段之一。DNA計(jì)算是以DNA分子和生物酶為材料,以生化操作為計(jì)算手段的一種生物計(jì)算模式。開展CTL模型檢測的DNA計(jì)算方法研究,不僅可以利用DNA分子的超高存儲(chǔ)容量和DNA計(jì)算的強(qiáng)大并行優(yōu)勢解決模型檢測狀態(tài)空間爆炸問題,而且對推動(dòng)DNA計(jì)算機(jī)的研發(fā)和應(yīng)用具有重要意義。自圖靈獎(jiǎng)獲得者Emerson教授提出“DNA模型檢測”問題以來,針對CTL模型檢測問題,非自治、自治和細(xì)胞內(nèi)算法仍沒有解決,現(xiàn)有算法存在不能提供反例、不能檢測帶過去算子的CTL公式(CTLP)、因使用核酸酶導(dǎo)致的魯棒性弱以及反應(yīng)材料不可復(fù)用等問題。針對上述問題,本文深入研究了基于非自治、自治和細(xì)胞內(nèi)DNA計(jì)算模型的CTL模型檢測算法,完成的主要工作和創(chuàng)新點(diǎn)如下:1)提出了基于非自治DNA計(jì)算模型的CTL模型檢測算法——AM-CTLMC。設(shè)計(jì)了待檢測系統(tǒng)模型的編碼方案,構(gòu)建了系統(tǒng)模型運(yùn)行路徑的生成算法,給出了CTL基本公式、一般公式和CTLP公式的模型檢測算法,仿真實(shí)驗(yàn)結(jié)果驗(yàn)證了算法的正確性。AM-CTL... 

【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:141 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

基于DNA計(jì)算模型的計(jì)算樹邏輯模型檢測算法研究


生物仿真平臺NUPACK的主界面

基于DNA計(jì)算模型的計(jì)算樹邏輯模型檢測算法研究


表3.1的DNA

路徑圖,路徑


3基于非自治DNA計(jì)算模型的CTL模型檢測算法51(i)路徑9和q(j)路徑10和q(k)路徑11和q(l)路徑12和q(m)路徑13和q(n)路徑14和q圖3.10路徑i的DNA單鏈與q的補(bǔ)鏈雜交結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[10]DNA納米顆粒共聚體在圖的連通度問題中的應(yīng)用[J]. 王艷釵,張會(huì),董亞非.  電子學(xué)報(bào). 2016(07)

博士論文
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[2]基于DNA折紙的納米材料的構(gòu)建和應(yīng)用[D]. 歐陽湘元.中國科學(xué)院研究生院(上海應(yīng)用物理研究所) 2015

碩士論文
[1]基于DNA序列特征的必需基因判定研究[D]. 趙宇晴.山東大學(xué) 2019
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[3]基于云計(jì)算平臺的形式化技術(shù)相關(guān)并行查詢與檢測算法的研究[D]. 馬凱旋.南京郵電大學(xué) 2018
[4]基于SVM的DNA微陣列數(shù)據(jù)分類研究[D]. 黃現(xiàn)代.西南科技大學(xué) 2018
[5]基于DNA粘貼模型的若干有向圖算法研究[D]. 張春艷.鄭州大學(xué) 2018
[6]基于DNA計(jì)算的CTL模型檢測方法研究[D]. 李永亮.鄭州大學(xué) 2015
[7]支持向量機(jī)在DNA數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用研究[D]. 劉小菲.遼寧師范大學(xué) 2015



本文編號:3607452

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