自從抗生素抗性基因（Antibiotic Resistance Genes,ARGs）被認為是一種新型環(huán)境污染物,已有研究表明ARGs可以在可移動遺傳原件（Mobile Genetic Elements,MGEs）的協(xié)助下,可以在細菌群落之間進行基因水平遷移（Horizontal gene transfer,HGT）。ARGs還可以通過人類食用含有抗性細菌的蔬菜等食品,沿食物鏈方向傳播,從而影響人類健康。農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)的健康狀態(tài),不僅與糧食作物生態(tài)安全息息相關(guān),也與人類衛(wèi)生健康密不可分,針對農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)中關(guān)于抗性基因的研究十分必要。本研究采用分子生態(tài)學和群落生態(tài)學的理論和研究方法,以內(nèi)蒙古河套灌區(qū)農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)為對象開展抗生素抗性基因豐富度及多樣性研究,目的是通過分析土壤、水體和沉積物環(huán)境介質(zhì)中環(huán)境因子、抗性基因和細菌群落三者之間的關(guān)系,揭示細菌群落結(jié)構(gòu)多樣性適應(yīng)機制、以及抗性基因與細菌群落共現(xiàn)性模式。主要結(jié)論如下:1、在不同環(huán)境介質(zhì)中抗性基因豐度及多樣性差異性顯著,土壤環(huán)境中以喹諾酮類mex F和磺胺類sul I,sul II抗性基因污染為主,水體環(huán)境中以β-內(nèi)酰胺酶類bla _... 

【文章來源】：山西大學山西省

【文章頁數(shù)】：122 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

河套灌區(qū)地理位置圖及樣點布設(shè)Fig.2.1DistributionofsoilsamplingpointsinHetaoIrrigationDistrict.

河套灌區(qū)抗生素抗性基因空間分異與細菌群落多樣性適應(yīng)機制22參基因，其的標準曲線是以標準拷貝數(shù)的對數(shù)值(log)和實驗中Ct值來構(gòu)建的該標準曲線用來計算其他抗生素抗性基因的絕對豐度。標準曲線是以標準品拷貝數(shù)的log值和實驗中測得的Ct值來繪制，然后根據(jù)實驗中待測樣品得到的Ct值用已知標準曲線來求得樣品中的拷貝數(shù)。實驗后所得的系數(shù)R2在0.99~1.00之間，擴增曲線為平滑的“S”型曲線，標準品和樣品的溶解曲線為單峰，且溶解溫度大致相同，表明擴增引物成功，特異性良好。3.3結(jié)果與討論3.3.1農(nóng)田土壤16SrRNA豐度圖3.1土壤樣品16SrRNA豐度Fig.3.1Abundanceof16SrRNAinsoilsamplesites.農(nóng)田土壤中細菌群落16SrRNA的檢測結(jié)果見圖3.1，結(jié)果顯示其絕對豐度范圍為2.70×104至3.52×105copies/g，從圖中可以看出樣點T4和T5的細菌16SrRNA基因豐度相對高于其他6個樣點，這意味著這些樣點具有相對較高的細菌群落水平。此外還發(fā)現(xiàn)，黃河入口T1樣點，灌渠土壤中T2、T4與T5樣點的樣點與采樣點之間也存在顯著性差異，T3、T6、T7和T8樣點之間沒有顯著性差異，這說明灌渠農(nóng)田土壤系統(tǒng)中不同土壤樣點中微生物的豐度水平存在差異。

第三章農(nóng)田土壤中抗性基因空間分異特征233.3.2土壤抗生素抗性基因豐度與多樣性圖3.2土壤樣品ARGs和MGEs豐度Fig.3.2TheabsoluteabundanceofARGsandMGEatdifferentsoilsamplingsites.注：(a)ARGs絕對豐度，(b)ARGs相對豐度，(c)MGEs絕對豐度，(d)MGEs相對豐度Note:AbsoluteabundanceofARGs(a)andMGE(c)RelativeabundanceofARGs(b)andMGE(d)在河套灌區(qū)土壤樣品44個檢測的抗生素抗性基因中，共檢出33種抗生素抗性基因，ARGs與MGEs豐度見圖3.2。絕對豐度用每克風干土的拷貝數(shù)(copies/g)來表征，相對豐度是用目的抗性基因的拷貝數(shù)與16SrRNA的拷貝數(shù)比值來定義的，單位是：copies/16SrRNAgenecopies，相對豐度可以回避由不同環(huán)境介質(zhì)中細菌群落豐度差異而引起的系統(tǒng)誤差，因此從絕對豐度和相對豐度兩個指標分析環(huán)境介質(zhì)中抗性基因豐度，可以更全面地剖析其在環(huán)境介質(zhì)中的賦存狀態(tài)。其中在圖3.2(a，b)中，統(tǒng)計不同抗生素相關(guān)的抗性基因在農(nóng)田土壤樣點的豐度，其樣點∑ARGs絕對豐度的值介于3.56×105-3.06×106copies/g之間，相對豐度值介于0.007-0.023copies/16SrRNAgenecopies之間，其中T4、T5樣點的∑ARGs絕對

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
[1]河套灌區(qū)沉積物中抗生素抗性基因的分布研究[D]. 杜宏宇.山西大學 2019



本文編號：3577181