木霉菌基因組熱激轉錄因子家族基因特性
發(fā)布時間:2022-01-06 04:08
木霉(Trichoderma)是一種良好的生防因子,為揭示木霉熱激轉錄因子(Heat shock transcription factor)基因的功能并為木霉菌種的改良提供基礎數(shù)據,通過生物信息學分析方法,在7種9株木霉全基因組水平上鑒定出27個HSTF基因,并選取釀酒酵母中的5個HSTF基因作為對照,對它們的系統(tǒng)發(fā)育關系、序列特征、表達情況以及蛋白結構進行詳細分析;通過克隆鏈格孢屬(Alternaria alternata)真菌脅迫下HSTFTas基因并分析其表達量。研究結果表明:每株木霉含有3個HSTF基因家族成員,分子質量56.1~81.1 kD,等電點(PI)5.50~8.98。HSTF基因序列特征和系統(tǒng)進化分析將木霉的熱激轉錄因子分為3個分支(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ)。3類熱激轉錄因子的蛋白質三級結構差異較大,總共含有7~8種保守基序。棘孢木霉(T.asperellum) CBS 433.97的3類HSTF基因在鏈格孢致病毒素脅迫下均有響應,其表達量分別在誘導24 h、24 h和2 h時提高了1.5、2.6和1.7倍。木霉熱激轉錄因子基因家族有較高保守性,木霉與病原菌互作過程中,木霉的H...
【文章來源】:吉林農業(yè)大學學報. 2020,42(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【部分圖文】:
7種9株木霉的27個HSTF基因的內含子和外顯子結構圖
為了解不同種木霉菌中的HSTF基因是否具有相同或相似的序列特征,使用27個木霉HSTF蛋白的完整氨基酸序列、5個釀酒酵母HSTF蛋白氨基酸序列和4個擬南芥HSTF蛋白氨基酸序列構建了進化樹(圖4)。結果表明,木霉HSTF基因家族被分成3個分支(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ),且3個分支在親緣關系上較遠,其中每個分支都包含9個HSTFs基因。處于進化樹末端的同源基因的序列特征相似度較高,如HSTF-Ⅰ類基因中的9個直系同源基因分支可靠程度較高,支持率數(shù)值均約為90。相比于HSTF-Ⅰ基因,HSTF-Ⅱ和HSTF-Ⅲ類基因中的直系同源基因分支可靠程度較低。釀酒酵母的HSTF1Sac, HSTF4Sac和HSTF2Sac,HSTF5Sac基因分別與木霉的HSTF-Ⅱ類和HSTF-Ⅲ類基因相似,而HSTF3Sac基因與木霉的HSTF基因在進化程度上有較大差異。圖3 木霉菌HSTF多序列比對
木霉菌HSTF多序列比對
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃瓜全基因組熱激轉錄因子(HSFs)的鑒定與表達分析[J]. 陳先知,王燕,史建磊,朱隆靜,王克磊,徐堅. 遺傳. 2014(04)
[2]植物熱激轉錄因子在非生物逆境中的作用[J]. 翁錦周,洪月云. 分子植物育種. 2006(01)
本文編號:3571699
【文章來源】:吉林農業(yè)大學學報. 2020,42(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【部分圖文】:
7種9株木霉的27個HSTF基因的內含子和外顯子結構圖
為了解不同種木霉菌中的HSTF基因是否具有相同或相似的序列特征,使用27個木霉HSTF蛋白的完整氨基酸序列、5個釀酒酵母HSTF蛋白氨基酸序列和4個擬南芥HSTF蛋白氨基酸序列構建了進化樹(圖4)。結果表明,木霉HSTF基因家族被分成3個分支(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ),且3個分支在親緣關系上較遠,其中每個分支都包含9個HSTFs基因。處于進化樹末端的同源基因的序列特征相似度較高,如HSTF-Ⅰ類基因中的9個直系同源基因分支可靠程度較高,支持率數(shù)值均約為90。相比于HSTF-Ⅰ基因,HSTF-Ⅱ和HSTF-Ⅲ類基因中的直系同源基因分支可靠程度較低。釀酒酵母的HSTF1Sac, HSTF4Sac和HSTF2Sac,HSTF5Sac基因分別與木霉的HSTF-Ⅱ類和HSTF-Ⅲ類基因相似,而HSTF3Sac基因與木霉的HSTF基因在進化程度上有較大差異。圖3 木霉菌HSTF多序列比對
木霉菌HSTF多序列比對
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃瓜全基因組熱激轉錄因子(HSFs)的鑒定與表達分析[J]. 陳先知,王燕,史建磊,朱隆靜,王克磊,徐堅. 遺傳. 2014(04)
[2]植物熱激轉錄因子在非生物逆境中的作用[J]. 翁錦周,洪月云. 分子植物育種. 2006(01)
本文編號:3571699
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