宿主蛋白SYNCRIP和MCM3在豬細(xì)小病毒復(fù)制過(guò)程中作用及機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-12-31 10:49
豬細(xì)小病毒(Porcine parvovirus,PPV)是引起母豬繁殖障礙性疾病重要病原,能夠引起初孕母豬流產(chǎn)、產(chǎn)死胎、畸胎和木乃伊胎等,給養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。PPV基因組主要包括2個(gè)開(kāi)放性閱讀框(Open Reading Frame,ORF)ORF1和ORF2,ORF1主要編碼非結(jié)構(gòu)蛋白NS1和NS2,它們的功能是參與病毒復(fù)制及致細(xì)胞病變。NS2具有與NS1相同的N末端,且NS2-m RNA是由NS1-m RNA(pre-m RNA,NS2-m RNA的前體m RNA)經(jīng)可變剪接之后產(chǎn)生。宿主蛋白Syncrip是核不均一核糖核蛋白(Heterogenous nuclear ribonucleo proteins,hn RNPs)家族成員之一,與宿主細(xì)胞m RNA的轉(zhuǎn)錄、外顯子剪接以及剪接位點(diǎn)的選擇等過(guò)程相關(guān),此外還參與了某些肝炎病毒的復(fù)制。ORF2主要編碼結(jié)構(gòu)蛋白VP1和VP2,VP2是PPV最主要的衣殼蛋白,占衣殼成分的80%左右,在病毒感染過(guò)程中VP2參與了病毒基因組的入核和成熟病毒粒子的組裝。宿主蛋白MCM3是解旋酶MCM家族成員之一,在宿主DNA復(fù)制過(guò)程中能夠使雙鏈...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:161 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
NS蛋白信號(hào)肽分析(A)和跨膜區(qū)分析(B)
第三章豬細(xì)小病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NS多克隆抗體制備23圖3-2NS的結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)分析A:蛋白α螺旋結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)(Chou-Fasman法與Gamier-Robson法);B:蛋白親水性預(yù)測(cè)(Kyte-Doolittle法);C:蛋白的柔性區(qū)域預(yù)測(cè)(Karplus-Schulz法);D:蛋白潛在的抗原表位預(yù)測(cè)(Jameson-wolf法);E:蛋白可能性預(yù)測(cè)方法(Emini法)Fig.3-2StructurebioinformaticsanalysisofNSproteinA:α-Helixprediction(Chou-FasmanandGamier-Robsonmodels);B:Hydrophilicityprediction(Kyte-Doolittlemodel);C:Flexibleregionsprediction(Karplus-Schulzmodel);D:Antigenicprediction(Jameson-wolfmodel);E:Surfaceprobabilityprediction(Eminimodel)3.3.2重組質(zhì)粒pET-32a-NS的構(gòu)建和鑒定將擴(kuò)增出的ns基因克隆入原核表達(dá)載體pET-32a上構(gòu)建重組載體,經(jīng)PCR鑒定擴(kuò)增出大小約為250bp左右的目的條帶,與預(yù)期大小相一致(圖3-3)。進(jìn)一步將PCR鑒定陽(yáng)性菌擴(kuò)大培養(yǎng),提取質(zhì)粒經(jīng)BamHI和XhoI雙酶切鑒定后分別出現(xiàn)了約6000bp和250bp的條帶,與預(yù)期大小相一致(圖3-4),測(cè)序鑒定正確。以上結(jié)果表明重組質(zhì)粒pET-32a-NS構(gòu)建成功。圖3-3pET-32a-NS重組質(zhì)粒的PCR鑒定M:DNA標(biāo)準(zhǔn)DL2000plus,1:陰性對(duì)照,2~3:pET-32a-NS的PCR鑒定Fig.3-3PCRidentificationofrecombinantplasmidpET-32a-NSM:DNAMarkerDL2000plus,1:Negativecontrol,2~3:PCRidentificationofpET-32a-NS
第三章豬細(xì)小病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NS多克隆抗體制備23圖3-2NS的結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)分析A:蛋白α螺旋結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)(Chou-Fasman法與Gamier-Robson法);B:蛋白親水性預(yù)測(cè)(Kyte-Doolittle法);C:蛋白的柔性區(qū)域預(yù)測(cè)(Karplus-Schulz法);D:蛋白潛在的抗原表位預(yù)測(cè)(Jameson-wolf法);E:蛋白可能性預(yù)測(cè)方法(Emini法)Fig.3-2StructurebioinformaticsanalysisofNSproteinA:α-Helixprediction(Chou-FasmanandGamier-Robsonmodels);B:Hydrophilicityprediction(Kyte-Doolittlemodel);C:Flexibleregionsprediction(Karplus-Schulzmodel);D:Antigenicprediction(Jameson-wolfmodel);E:Surfaceprobabilityprediction(Eminimodel)3.3.2重組質(zhì)粒pET-32a-NS的構(gòu)建和鑒定將擴(kuò)增出的ns基因克隆入原核表達(dá)載體pET-32a上構(gòu)建重組載體,經(jīng)PCR鑒定擴(kuò)增出大小約為250bp左右的目的條帶,與預(yù)期大小相一致(圖3-3)。進(jìn)一步將PCR鑒定陽(yáng)性菌擴(kuò)大培養(yǎng),提取質(zhì)粒經(jīng)BamHI和XhoI雙酶切鑒定后分別出現(xiàn)了約6000bp和250bp的條帶,與預(yù)期大小相一致(圖3-4),測(cè)序鑒定正確。以上結(jié)果表明重組質(zhì)粒pET-32a-NS構(gòu)建成功。圖3-3pET-32a-NS重組質(zhì)粒的PCR鑒定M:DNA標(biāo)準(zhǔn)DL2000plus,1:陰性對(duì)照,2~3:pET-32a-NS的PCR鑒定Fig.3-3PCRidentificationofrecombinantplasmidpET-32a-NSM:DNAMarkerDL2000plus,1:Negativecontrol,2~3:PCRidentificationofpET-32a-NS
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國(guó)10株豬細(xì)小病毒7型全基因組遺傳與重組分析[J]. 張志,張麗麗,劉爽,董雅琴,張慧,張峰,崔進(jìn),吳發(fā)興,李曉成. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020(02)
[2]豬Cyclin A和CDK2蛋白對(duì)豬細(xì)小病毒增殖的調(diào)控作用[J]. 唐青海,楊海,彭永剛,楊燦,何麗芳,王芳宇. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(08)
[3]鴨寡腺苷酸合成酶樣蛋白原核表達(dá)及多克隆抗體制備[J]. 畢可然,李銀,韓凱凱,趙冬敏,劉青濤,劉宇卓,黃欣梅,楊婧. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(23)
[4]大鼠抗人β-catenin多克隆抗體的制備與鑒定[J]. 牛夏憶,李淼,張倩,陳云雨,劉曉平. 中國(guó)免疫學(xué)雜志. 2019(16)
[5]豬圓環(huán)病毒2型病毒樣顆粒的純化及鑒定[J]. 王席,李國(guó)攀,陳清清,徐保娟,榮俊. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(06)
[6]MDGPV PT株E-box缺失感染性克隆的構(gòu)建及生物學(xué)特性分析[J]. 王劭,肖世峰,程曉霞,江丹丹,林鋒強(qiáng),朱小麗,陳仕龍,陳少鶯. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(06)
[7]偽狂犬病病毒UL56蛋白與宿主蛋白Nedd4相互作用的研究[J]. 王書(shū)文,呂闖,蔡雪輝. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(06)
[8]流感病毒NS1蛋白與宿主蛋白DOK6的相互作用研究[J]. 黃山雨,梁立濱,李俊平,王倩,趙青青,周陳陳,趙玉輝,王廣文,李奇兵,孔凡迪,李呈軍,陳化蘭,姜麗. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(10)
[9]家蠶熱休克蛋白HSP60相互作用蛋白篩選與鑒定[J]. 董戰(zhàn)旗,蔣亞明,潘敏慧. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(02)
[10]NDRVσC蛋白互作的宿主因子篩選及生物信息學(xué)分析[J]. 肖容,杜夏夏,李傳峰,馬文戈,米曉云,劉光清,周海龍,陳宗艷. 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2019(04)
博士論文
[1]豬細(xì)小病毒誘導(dǎo)豬黃體細(xì)胞凋亡及抑制孕酮產(chǎn)生機(jī)制研究[D]. 張樑.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]人細(xì)小病毒B19非結(jié)構(gòu)蛋白對(duì)啟動(dòng)子的調(diào)控及其出核轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制研究[D]. 董衍明.華中師范大學(xué) 2013
碩士論文
[1]家蠶二分濃核病毒NS1蛋白表達(dá)分析及其互作蛋白研究[D]. 劉偉.江蘇大學(xué) 2017
本文編號(hào):3560124
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:161 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
NS蛋白信號(hào)肽分析(A)和跨膜區(qū)分析(B)
第三章豬細(xì)小病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NS多克隆抗體制備23圖3-2NS的結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)分析A:蛋白α螺旋結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)(Chou-Fasman法與Gamier-Robson法);B:蛋白親水性預(yù)測(cè)(Kyte-Doolittle法);C:蛋白的柔性區(qū)域預(yù)測(cè)(Karplus-Schulz法);D:蛋白潛在的抗原表位預(yù)測(cè)(Jameson-wolf法);E:蛋白可能性預(yù)測(cè)方法(Emini法)Fig.3-2StructurebioinformaticsanalysisofNSproteinA:α-Helixprediction(Chou-FasmanandGamier-Robsonmodels);B:Hydrophilicityprediction(Kyte-Doolittlemodel);C:Flexibleregionsprediction(Karplus-Schulzmodel);D:Antigenicprediction(Jameson-wolfmodel);E:Surfaceprobabilityprediction(Eminimodel)3.3.2重組質(zhì)粒pET-32a-NS的構(gòu)建和鑒定將擴(kuò)增出的ns基因克隆入原核表達(dá)載體pET-32a上構(gòu)建重組載體,經(jīng)PCR鑒定擴(kuò)增出大小約為250bp左右的目的條帶,與預(yù)期大小相一致(圖3-3)。進(jìn)一步將PCR鑒定陽(yáng)性菌擴(kuò)大培養(yǎng),提取質(zhì)粒經(jīng)BamHI和XhoI雙酶切鑒定后分別出現(xiàn)了約6000bp和250bp的條帶,與預(yù)期大小相一致(圖3-4),測(cè)序鑒定正確。以上結(jié)果表明重組質(zhì)粒pET-32a-NS構(gòu)建成功。圖3-3pET-32a-NS重組質(zhì)粒的PCR鑒定M:DNA標(biāo)準(zhǔn)DL2000plus,1:陰性對(duì)照,2~3:pET-32a-NS的PCR鑒定Fig.3-3PCRidentificationofrecombinantplasmidpET-32a-NSM:DNAMarkerDL2000plus,1:Negativecontrol,2~3:PCRidentificationofpET-32a-NS
第三章豬細(xì)小病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NS多克隆抗體制備23圖3-2NS的結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)分析A:蛋白α螺旋結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)(Chou-Fasman法與Gamier-Robson法);B:蛋白親水性預(yù)測(cè)(Kyte-Doolittle法);C:蛋白的柔性區(qū)域預(yù)測(cè)(Karplus-Schulz法);D:蛋白潛在的抗原表位預(yù)測(cè)(Jameson-wolf法);E:蛋白可能性預(yù)測(cè)方法(Emini法)Fig.3-2StructurebioinformaticsanalysisofNSproteinA:α-Helixprediction(Chou-FasmanandGamier-Robsonmodels);B:Hydrophilicityprediction(Kyte-Doolittlemodel);C:Flexibleregionsprediction(Karplus-Schulzmodel);D:Antigenicprediction(Jameson-wolfmodel);E:Surfaceprobabilityprediction(Eminimodel)3.3.2重組質(zhì)粒pET-32a-NS的構(gòu)建和鑒定將擴(kuò)增出的ns基因克隆入原核表達(dá)載體pET-32a上構(gòu)建重組載體,經(jīng)PCR鑒定擴(kuò)增出大小約為250bp左右的目的條帶,與預(yù)期大小相一致(圖3-3)。進(jìn)一步將PCR鑒定陽(yáng)性菌擴(kuò)大培養(yǎng),提取質(zhì)粒經(jīng)BamHI和XhoI雙酶切鑒定后分別出現(xiàn)了約6000bp和250bp的條帶,與預(yù)期大小相一致(圖3-4),測(cè)序鑒定正確。以上結(jié)果表明重組質(zhì)粒pET-32a-NS構(gòu)建成功。圖3-3pET-32a-NS重組質(zhì)粒的PCR鑒定M:DNA標(biāo)準(zhǔn)DL2000plus,1:陰性對(duì)照,2~3:pET-32a-NS的PCR鑒定Fig.3-3PCRidentificationofrecombinantplasmidpET-32a-NSM:DNAMarkerDL2000plus,1:Negativecontrol,2~3:PCRidentificationofpET-32a-NS
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國(guó)10株豬細(xì)小病毒7型全基因組遺傳與重組分析[J]. 張志,張麗麗,劉爽,董雅琴,張慧,張峰,崔進(jìn),吳發(fā)興,李曉成. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020(02)
[2]豬Cyclin A和CDK2蛋白對(duì)豬細(xì)小病毒增殖的調(diào)控作用[J]. 唐青海,楊海,彭永剛,楊燦,何麗芳,王芳宇. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(08)
[3]鴨寡腺苷酸合成酶樣蛋白原核表達(dá)及多克隆抗體制備[J]. 畢可然,李銀,韓凱凱,趙冬敏,劉青濤,劉宇卓,黃欣梅,楊婧. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(23)
[4]大鼠抗人β-catenin多克隆抗體的制備與鑒定[J]. 牛夏憶,李淼,張倩,陳云雨,劉曉平. 中國(guó)免疫學(xué)雜志. 2019(16)
[5]豬圓環(huán)病毒2型病毒樣顆粒的純化及鑒定[J]. 王席,李國(guó)攀,陳清清,徐保娟,榮俊. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(06)
[6]MDGPV PT株E-box缺失感染性克隆的構(gòu)建及生物學(xué)特性分析[J]. 王劭,肖世峰,程曉霞,江丹丹,林鋒強(qiáng),朱小麗,陳仕龍,陳少鶯. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(06)
[7]偽狂犬病病毒UL56蛋白與宿主蛋白Nedd4相互作用的研究[J]. 王書(shū)文,呂闖,蔡雪輝. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(06)
[8]流感病毒NS1蛋白與宿主蛋白DOK6的相互作用研究[J]. 黃山雨,梁立濱,李俊平,王倩,趙青青,周陳陳,趙玉輝,王廣文,李奇兵,孔凡迪,李呈軍,陳化蘭,姜麗. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(10)
[9]家蠶熱休克蛋白HSP60相互作用蛋白篩選與鑒定[J]. 董戰(zhàn)旗,蔣亞明,潘敏慧. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(02)
[10]NDRVσC蛋白互作的宿主因子篩選及生物信息學(xué)分析[J]. 肖容,杜夏夏,李傳峰,馬文戈,米曉云,劉光清,周海龍,陳宗艷. 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2019(04)
博士論文
[1]豬細(xì)小病毒誘導(dǎo)豬黃體細(xì)胞凋亡及抑制孕酮產(chǎn)生機(jī)制研究[D]. 張樑.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]人細(xì)小病毒B19非結(jié)構(gòu)蛋白對(duì)啟動(dòng)子的調(diào)控及其出核轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制研究[D]. 董衍明.華中師范大學(xué) 2013
碩士論文
[1]家蠶二分濃核病毒NS1蛋白表達(dá)分析及其互作蛋白研究[D]. 劉偉.江蘇大學(xué) 2017
本文編號(hào):3560124
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