互花米草NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-31 02:40
互花米草(Spartina alterniflora)作為一種海岸帶鹽生植物,高度耐鹽脅迫,但因?yàn)槿鄙賲⒖蓟蚪M,其耐鹽的分子機(jī)制卻尚未見(jiàn)報(bào)道。NAC家族蛋白是植物特有的轉(zhuǎn)錄因子,調(diào)控植物的生長(zhǎng)發(fā)育和脅迫應(yīng)答。為了鑒定互花米草NAC蛋白(Sa NAC)并探究它們與互花米草生長(zhǎng)發(fā)育及脅迫響應(yīng)之間的關(guān)系,本研究以互花米草三代全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為參考,通過(guò)與水稻(Oryza sativa)、擬南芥(Arabidopsis thaliana)和玉米(Zea mays)NAC蛋白序列進(jìn)行比對(duì),并結(jié)合保守功能域進(jìn)一步篩選,最終找到62個(gè)Sa NAC蛋白。從蛋白序列比對(duì)、進(jìn)化、motif預(yù)測(cè)、同源性比較、亞細(xì)胞定位、組織表達(dá)以及非生物脅迫下的基因差異表達(dá)等方面分別對(duì)互花米草NAC家族成員進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)Sa NAC蛋白均含有保守的NAM結(jié)構(gòu)域,且在進(jìn)化上與水稻NAC家族具有一定的相似性;Sa NAC家族中的兩個(gè)蛋白Sa NAC9和Sa NAC49在細(xì)胞核表達(dá);另外,本研究還發(fā)現(xiàn)互花米草Sa NAC基因表達(dá)具有高度組織和脅迫應(yīng)答差異性。這些結(jié)果表明互花米草NAC轉(zhuǎn)錄因子家族不僅具有保守的功能域,而且在調(diào)...
【文章來(lái)源】:遺傳. 2020,42(02)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:18 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]烏拉爾圖小麥NAC轉(zhuǎn)錄因子的篩選與分析[J]. 馬建輝,仝豆豆,張文利,張黛靜,邵云,楊云,姜麗娜. 遺傳. 2016(03)
[2]NAC轉(zhuǎn)錄因子在植物抗病和抗非生物脅迫反應(yīng)中的作用[J]. 孫利軍,李大勇,張慧娟,宋鳳鳴. 遺傳. 2012(08)
本文編號(hào):3559468
【文章來(lái)源】:遺傳. 2020,42(02)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:18 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]烏拉爾圖小麥NAC轉(zhuǎn)錄因子的篩選與分析[J]. 馬建輝,仝豆豆,張文利,張黛靜,邵云,楊云,姜麗娜. 遺傳. 2016(03)
[2]NAC轉(zhuǎn)錄因子在植物抗病和抗非生物脅迫反應(yīng)中的作用[J]. 孫利軍,李大勇,張慧娟,宋鳳鳴. 遺傳. 2012(08)
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