枸杞中性轉(zhuǎn)化酶NI基因的克隆及組織表達(dá)分析
發(fā)布時間:2021-12-30 21:06
中性轉(zhuǎn)化酶(NI)是蔗糖代謝的關(guān)鍵酶之一,在植物的生長發(fā)育、物質(zhì)代謝等生理活動中發(fā)揮重要的作用。以寧夏枸杞果實為材料,利用RACE技術(shù)克隆枸杞NI基因,Lb NI (GenBank登錄號為KR026955)基因開放閱讀框1 653 bp,編碼545個氨基酸。Lb NI蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測發(fā)現(xiàn)不規(guī)則卷曲(Random coil)結(jié)構(gòu)所占39.63%;α螺旋(Alpha helix)次之,占36.51%;延伸鏈結(jié)構(gòu)(Extended strand)18.53%;β轉(zhuǎn)角(Beta turn)最少,僅5.32%。生物信息學(xué)分析顯示Lb NI蛋白含有糖苷酶100超家族保守結(jié)構(gòu)域,與番茄、煙草等NI蛋白相似度較高,無酸性轉(zhuǎn)化酶保守結(jié)構(gòu)域NDPNG/A、FRDP和WECP。QPCR結(jié)果顯示,Lb NI在枸杞不同的器官中表達(dá)存在差異,在葉中的表達(dá)量達(dá)到最高值,Lb NI在果實的不同組織中的表達(dá)模式為:果皮>種子>果肉,表明中性轉(zhuǎn)化酶參與枸杞多種發(fā)育過程。在枸杞果實形成的每一階段Lb NI都有表達(dá),果實發(fā)育初期(前15 d)Lb NI的表達(dá)維持在較低水平,從第22天開始表達(dá)量呈現(xiàn)逐步升高的趨勢,...
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(07)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
Lb NI基因全長克隆
蛋白親水性分析(Prot Scale軟件)顯示:枸杞Lb NI蛋白序列中的親水區(qū)域大于疏水區(qū)域(圖3),親水性最強(qiáng)區(qū)域是其186~190段,親水性次之的蛋白區(qū)段為191~194,90~95等。疏水性最強(qiáng)蛋白區(qū)域為40,疏水性次之的蛋白區(qū)段23~26,44~46等。圖3 Lb NI蛋白親水/疏水性分析
Lb NI蛋白親水/疏水性分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]枸杞WRKY2基因的克隆及組織表達(dá)分析[J]. 徐惠娟,楊亞珺,石晶,鄭蕊,王婷婷,高楚,陳任,王麗娟. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(10)
[2]粗山羊草Dof轉(zhuǎn)錄因子家族基因的鑒定與分析[J]. 趙夢琪,周正富,齊豫川,晁岳恩,王美芳,何盛蓮,李文旭,秦毛毛,吳政卿,雷振生. 分子植物育種. 2017(07)
[3]枸杞WRKY3基因克隆及組織表達(dá)分析[J]. 徐惠娟,鄭蕊,陳任,王彥才,王麗娟. 西北植物學(xué)報. 2016(09)
[4]番荔枝花器官發(fā)育基因AsAG的克隆、亞細(xì)胞定位及表達(dá)分析[J]. 劉鍇棟,黎海利,鐘舒婷,袁長春,陳燕,劉金祥,鐘軍弟. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(01)
[5]茶樹中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因CsINV10的克隆與表達(dá)分析[J]. 錢文俊,岳川,曹紅利,郝心愿,王璐,王玉春,黃玉婷,王博,王新超,肖斌,楊亞軍. 作物學(xué)報. 2016(03)
[6]番荔枝開花調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子基因AsLEAFY的克隆與表達(dá)分析[J]. 劉鍇棟,黃素娜,姜艷,黎海利,袁長春,劉金祥,陳燕. 園藝學(xué)報. 2015(08)
[7]枸杞酸性轉(zhuǎn)化酶基因的克隆及組織表達(dá)分析[J]. 王麗娟,趙輝,王彥才,丁向真,馬建明. 北方園藝. 2014(01)
[8]甘蔗中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因SoNIN1的克隆和表達(dá)分析[J]. 牛俊奇,王愛勤,黃靜麗,楊麗濤,李楊瑞. 作物學(xué)報. 2014(02)
[9]枸杞蔗糖磷酸合成酶基因的克隆及組織表達(dá)分析[J]. 王麗娟,丁向真,王彥才,李翔. 西北植物學(xué)報. 2013(08)
[10]西瓜不同種質(zhì)資源糖分積累規(guī)律的研究[J]. 楊玉梅,張顯,于蓉,于遠(yuǎn). 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2006(06)
本文編號:3558963
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(07)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
Lb NI基因全長克隆
蛋白親水性分析(Prot Scale軟件)顯示:枸杞Lb NI蛋白序列中的親水區(qū)域大于疏水區(qū)域(圖3),親水性最強(qiáng)區(qū)域是其186~190段,親水性次之的蛋白區(qū)段為191~194,90~95等。疏水性最強(qiáng)蛋白區(qū)域為40,疏水性次之的蛋白區(qū)段23~26,44~46等。圖3 Lb NI蛋白親水/疏水性分析
Lb NI蛋白親水/疏水性分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]枸杞WRKY2基因的克隆及組織表達(dá)分析[J]. 徐惠娟,楊亞珺,石晶,鄭蕊,王婷婷,高楚,陳任,王麗娟. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(10)
[2]粗山羊草Dof轉(zhuǎn)錄因子家族基因的鑒定與分析[J]. 趙夢琪,周正富,齊豫川,晁岳恩,王美芳,何盛蓮,李文旭,秦毛毛,吳政卿,雷振生. 分子植物育種. 2017(07)
[3]枸杞WRKY3基因克隆及組織表達(dá)分析[J]. 徐惠娟,鄭蕊,陳任,王彥才,王麗娟. 西北植物學(xué)報. 2016(09)
[4]番荔枝花器官發(fā)育基因AsAG的克隆、亞細(xì)胞定位及表達(dá)分析[J]. 劉鍇棟,黎海利,鐘舒婷,袁長春,陳燕,劉金祥,鐘軍弟. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(01)
[5]茶樹中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因CsINV10的克隆與表達(dá)分析[J]. 錢文俊,岳川,曹紅利,郝心愿,王璐,王玉春,黃玉婷,王博,王新超,肖斌,楊亞軍. 作物學(xué)報. 2016(03)
[6]番荔枝開花調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子基因AsLEAFY的克隆與表達(dá)分析[J]. 劉鍇棟,黃素娜,姜艷,黎海利,袁長春,劉金祥,陳燕. 園藝學(xué)報. 2015(08)
[7]枸杞酸性轉(zhuǎn)化酶基因的克隆及組織表達(dá)分析[J]. 王麗娟,趙輝,王彥才,丁向真,馬建明. 北方園藝. 2014(01)
[8]甘蔗中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因SoNIN1的克隆和表達(dá)分析[J]. 牛俊奇,王愛勤,黃靜麗,楊麗濤,李楊瑞. 作物學(xué)報. 2014(02)
[9]枸杞蔗糖磷酸合成酶基因的克隆及組織表達(dá)分析[J]. 王麗娟,丁向真,王彥才,李翔. 西北植物學(xué)報. 2013(08)
[10]西瓜不同種質(zhì)資源糖分積累規(guī)律的研究[J]. 楊玉梅,張顯,于蓉,于遠(yuǎn). 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2006(06)
本文編號:3558963
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