沃爾巴克菌對孔弄蝶屬線粒體DNA遺傳多樣性影響的研究
發(fā)布時間:2021-12-28 04:14
昆蟲中廣泛存在一類和線粒體DNA(mt DNA)具有相同遺傳方式的細胞內(nèi)共生細菌沃爾巴克菌Wolbachia,其母系遺傳的傳播方式會影響寄主線粒體DNA的遺傳多樣性,這導致線粒體DNA難以正確反映被感染寄主的種群遺傳結構和物種分類等信息。在蝶類沃爾巴克菌的研究中,尚未有以“屬”作為分析單位進行的系統(tǒng)研究,無法對沃爾巴克菌與蝶類寄主線粒體DNA的互作關系及由此引起的分析誤差做出系統(tǒng)的評價。本研究采用孔弄蝶屬共17個種的204個樣本,首先檢測了沃爾巴克菌感染情況,結合地理分布對環(huán)境氣候與沃爾巴克菌感染率進行了關聯(lián)分析。并通過孔弄蝶屬線粒體基因單倍型網(wǎng)絡圖的繪制,以及針對線粒體基因、核基因及沃爾巴克菌的多位點序列分型片段進行了多個系統(tǒng)發(fā)育樹的構建,對沃爾巴克菌不同株系與宿主遺傳基因的多樣性進行了討論。本研究在“屬”這一分類單元下,根據(jù)上述分析方法目前得出以下結論:1)共發(fā)現(xiàn)6個種感染了沃爾巴克菌,34%(70/204只)的孔弄蝶屬樣本測得沃爾巴克菌陽性結果,采用wsp標記檢測出三個沃爾巴克菌的菌株,分別為w Nas1,w Nas2和w Nas3。進一步通過多位點序列分型(MLST)將其還能分...
【文章來源】:上海師范大學上海市
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
樣本采集情況
樣本中沃爾巴克菌感染分布情況
第3章結果與分析上海師范大學碩士學位論文26圖3-2由孔弄蝶屬與其他物種中沃爾巴克菌ST序列共同構建的ML系統(tǒng)發(fā)育樹Fig3-2.Maximum-likelihoodphylogenetictreeofWolbachiaSTsequencesfromPolytremisandotherspecies3.2孔弄蝶屬線粒體DNA和核基因的分析3.2.1線粒體基因序列的分析將擴增的所有孔弄蝶屬樣本的線粒體DNA(包括COI、COII及ND5基因)和秈弄蝶外群的線粒體串聯(lián)序列(包括COI、COII及ND5,大小為1840bp)的測序結果進行比較,發(fā)現(xiàn)在666個核苷酸位點存在多態(tài)性,其中包括617個簡約信息位點。并有保守位點1174個。該序列集的平均堿基組成含量為腺嘌呤(A)33.3%、胸腺嘧啶(T)42.2%,鳥嘌呤(G)11.6%和胞嘧啶(C)12.9%,A+T的含量為75.5%,C+G的含量為24.5%,顯示出在昆蟲線粒體基因組中常見的A
【參考文獻】:
期刊論文
[1]果蠅細胞內(nèi)共生菌Wolbachia研究進展[J]. 張廣,陳雨,王蓓蕾. 中國實驗動物學報. 2018(02)
[2]共生菌Wolbachia感染對果蠅適合度的影響[J]. 齊琳,云月利,李長春,陳建,張增燾,彭宇. 湖北大學學報(自然科學版). 2017(02)
[3]系統(tǒng)生物學家最終能得到完全一致的生命之樹嗎?[J]. 魯麗敏,陳之端,路安民. 科學通報. 2016(09)
[4]人和動物絲蟲共生菌——沃爾巴克氏體研究進展[J]. 劉梅,楊光友. 動物醫(yī)學進展. 2015(04)
[5]常用系統(tǒng)發(fā)育樹構建算法和軟件鳥瞰[J]. 張麗娜,榮昌鶴,何遠,關瓊,何彬,朱興文,劉佳妮,陳紅菊. 動物學研究. 2013(06)
[6]蚊蟲Wolbachia野外試驗的研究進展[J]. 張東京,梁格豪,鄭展圖,劉秀婷,何石萍,葉慧珍,李卓雅,詹希美,鄭小英. 中國人獸共患病學報. 2013(02)
[7]Wolbachia與昆蟲寄主關系研究進展[J]. 王哲,喬格俠. 應用昆蟲學報. 2011(06)
[8]稻縱卷葉螟感染W(wǎng)olbachia的ftsZ基因和16S rDNA基因的序列分析[J]. 柴換娜,杜予州,吳海燕. 昆蟲學報. 2011(04)
[9]分子系統(tǒng)發(fā)育分析的生物信息學方法[J]. 張樹波,賴劍煌. 計算機科學. 2010(08)
[10]譜系年代研究進展[J]. 楊群,叢培允,孫曉燕,馬俊業(yè),蓋永華,李春香,郝家勝,夏旭華. 古生物學報. 2009(03)
碩士論文
[1]孔弄蝶屬(Polytremis)的分子系統(tǒng)學研究[D]. 宋超.上海師范大學 2013
[2]中國刺脛弄蝶族分類研究(鱗翅目:弄蝶科:弄蝶亞科)[D]. 朱建青.上海師范大學 2012
本文編號:3553380
【文章來源】:上海師范大學上海市
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
樣本采集情況
樣本中沃爾巴克菌感染分布情況
第3章結果與分析上海師范大學碩士學位論文26圖3-2由孔弄蝶屬與其他物種中沃爾巴克菌ST序列共同構建的ML系統(tǒng)發(fā)育樹Fig3-2.Maximum-likelihoodphylogenetictreeofWolbachiaSTsequencesfromPolytremisandotherspecies3.2孔弄蝶屬線粒體DNA和核基因的分析3.2.1線粒體基因序列的分析將擴增的所有孔弄蝶屬樣本的線粒體DNA(包括COI、COII及ND5基因)和秈弄蝶外群的線粒體串聯(lián)序列(包括COI、COII及ND5,大小為1840bp)的測序結果進行比較,發(fā)現(xiàn)在666個核苷酸位點存在多態(tài)性,其中包括617個簡約信息位點。并有保守位點1174個。該序列集的平均堿基組成含量為腺嘌呤(A)33.3%、胸腺嘧啶(T)42.2%,鳥嘌呤(G)11.6%和胞嘧啶(C)12.9%,A+T的含量為75.5%,C+G的含量為24.5%,顯示出在昆蟲線粒體基因組中常見的A
【參考文獻】:
期刊論文
[1]果蠅細胞內(nèi)共生菌Wolbachia研究進展[J]. 張廣,陳雨,王蓓蕾. 中國實驗動物學報. 2018(02)
[2]共生菌Wolbachia感染對果蠅適合度的影響[J]. 齊琳,云月利,李長春,陳建,張增燾,彭宇. 湖北大學學報(自然科學版). 2017(02)
[3]系統(tǒng)生物學家最終能得到完全一致的生命之樹嗎?[J]. 魯麗敏,陳之端,路安民. 科學通報. 2016(09)
[4]人和動物絲蟲共生菌——沃爾巴克氏體研究進展[J]. 劉梅,楊光友. 動物醫(yī)學進展. 2015(04)
[5]常用系統(tǒng)發(fā)育樹構建算法和軟件鳥瞰[J]. 張麗娜,榮昌鶴,何遠,關瓊,何彬,朱興文,劉佳妮,陳紅菊. 動物學研究. 2013(06)
[6]蚊蟲Wolbachia野外試驗的研究進展[J]. 張東京,梁格豪,鄭展圖,劉秀婷,何石萍,葉慧珍,李卓雅,詹希美,鄭小英. 中國人獸共患病學報. 2013(02)
[7]Wolbachia與昆蟲寄主關系研究進展[J]. 王哲,喬格俠. 應用昆蟲學報. 2011(06)
[8]稻縱卷葉螟感染W(wǎng)olbachia的ftsZ基因和16S rDNA基因的序列分析[J]. 柴換娜,杜予州,吳海燕. 昆蟲學報. 2011(04)
[9]分子系統(tǒng)發(fā)育分析的生物信息學方法[J]. 張樹波,賴劍煌. 計算機科學. 2010(08)
[10]譜系年代研究進展[J]. 楊群,叢培允,孫曉燕,馬俊業(yè),蓋永華,李春香,郝家勝,夏旭華. 古生物學報. 2009(03)
碩士論文
[1]孔弄蝶屬(Polytremis)的分子系統(tǒng)學研究[D]. 宋超.上海師范大學 2013
[2]中國刺脛弄蝶族分類研究(鱗翅目:弄蝶科:弄蝶亞科)[D]. 朱建青.上海師范大學 2012
本文編號:3553380
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3553380.html
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