百子蓮類(lèi)枯草桿菌蛋白酶基因ApSBT的克隆及表達(dá)特性分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-25 06:01
類(lèi)枯草桿菌蛋白酶(subtilisin-like proteases, SBT)是一類(lèi)與植物發(fā)育、防御反應(yīng)相關(guān)的多功能絲氨酸蛋白酶。本文以百子蓮(Agapanthus praecox ssp.orientalis)胚性愈傷組織為供試材料,利用RACE技術(shù)克隆出全長(zhǎng)的ApSBT基因?yàn)? 316 bp,編碼771個(gè)氨基酸。預(yù)測(cè)ApSBT蛋白為82.69 kDa,是從屬于Peptidases S8家族的親水蛋白。同源序列對(duì)比分析可知,百子蓮ApSBT蛋白與棕櫚科和禾本科等單子葉植物的SBT遺傳進(jìn)化關(guān)系較近。百子蓮叢生芽經(jīng)過(guò)4種單一的非生物(滲透、鹽、氧化及內(nèi)質(zhì)網(wǎng))脅迫處理12和24 h后,實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)發(fā)現(xiàn)ApSBT基因的相對(duì)表達(dá)量對(duì)4種脅迫均有響應(yīng),其中脅迫12 h時(shí)的表達(dá)量最高,分別為對(duì)照的12.00、4.25、3.20和2.50倍。通過(guò)單一脅迫實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在10 mmol·L-1 H2O2誘導(dǎo)下的轉(zhuǎn)基因擬南芥幼苗死亡率高達(dá)78.57%,說(shuō)明ApSBT主要響應(yīng)了氧化脅迫。
【文章來(lái)源】:植物生理學(xué)報(bào). 2020,56(12)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【部分圖文】:
百子蓮Ap SBT基因3′-RACE (A)、5′-RACE (B)及編碼區(qū)全長(zhǎng)(C)擴(kuò)增產(chǎn)物
百子蓮Ap SBT基因的核苷酸、編碼氨基酸序列(A)及蛋白的PFam結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)(B)
利用SOPMA在線(xiàn)網(wǎng)站進(jìn)行蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析表明,百子蓮Ap SBT主要由無(wú)規(guī)卷曲(379個(gè)氨基酸)、延伸主鏈(173個(gè)氨基酸)、α螺旋(166個(gè)氨基酸)和β折疊(53個(gè)氨基酸)構(gòu)成,分別占氨基酸序列總數(shù)的49.16%、22.44%、21.53%和6.87%,其中無(wú)規(guī)卷曲所占比例最高;少量的β折疊散布在延伸主鏈附近,α螺旋、延伸主鏈和無(wú)規(guī)卷曲貫穿于整個(gè)氨基酸肽鏈。圖4 百子蓮Ap SBT與其他植物SBT蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]類(lèi)枯草桿菌蛋白酶在植物和病原物互作中的研究進(jìn)展[J]. 陳發(fā)晶,譚蕊,黃萌雨,杜嬌,余洋,楊宇衡,畢朝位. 分子植物育種. 2018(10)
[2]桃PpSnRK1βγ1在擬南芥中超表達(dá)提高植株氧化脅迫耐性[J]. 趙永飛,陳曉璐,彭福田,羅靜靜,肖元松. 植物生理學(xué)報(bào). 2017(07)
[3]百子蓮有望成切花新秀[J]. 陸繼亮,周銀龍. 花木盆景(花卉園藝). 2012(08)
[4]植物抗病抗逆機(jī)理的研究概述[J]. 徐玲,陳自宏,晏愛(ài)芬,余麗. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(03)
[5]葉綠體信號(hào)參與了擬南芥干旱脅迫響應(yīng)[J]. 何春霞,曹文堯,張中偉,程鑒,徐飛,林宏輝,袁澍. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(01)
[6]轉(zhuǎn)GmAREB基因提高擬南芥的干旱、氧化脅迫耐性[J]. 高世慶,陳明,徐兆師,唐益苗,李連城,馬有志,趙昌平. 作物學(xué)報(bào). 2011(06)
碩士論文
[1]ROS誘導(dǎo)的氧化脅迫與細(xì)胞凋亡對(duì)百子蓮愈傷組織超低溫保存細(xì)胞活性的影響機(jī)制[D]. 張潔.上海交通大學(xué) 2015
[2]藍(lán)百合快速繁殖技術(shù)的研究[D]. 范現(xiàn)麗.上海交通大學(xué) 2009
本文編號(hào):3551916
【文章來(lái)源】:植物生理學(xué)報(bào). 2020,56(12)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【部分圖文】:
百子蓮Ap SBT基因3′-RACE (A)、5′-RACE (B)及編碼區(qū)全長(zhǎng)(C)擴(kuò)增產(chǎn)物
百子蓮Ap SBT基因的核苷酸、編碼氨基酸序列(A)及蛋白的PFam結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)(B)
利用SOPMA在線(xiàn)網(wǎng)站進(jìn)行蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析表明,百子蓮Ap SBT主要由無(wú)規(guī)卷曲(379個(gè)氨基酸)、延伸主鏈(173個(gè)氨基酸)、α螺旋(166個(gè)氨基酸)和β折疊(53個(gè)氨基酸)構(gòu)成,分別占氨基酸序列總數(shù)的49.16%、22.44%、21.53%和6.87%,其中無(wú)規(guī)卷曲所占比例最高;少量的β折疊散布在延伸主鏈附近,α螺旋、延伸主鏈和無(wú)規(guī)卷曲貫穿于整個(gè)氨基酸肽鏈。圖4 百子蓮Ap SBT與其他植物SBT蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]類(lèi)枯草桿菌蛋白酶在植物和病原物互作中的研究進(jìn)展[J]. 陳發(fā)晶,譚蕊,黃萌雨,杜嬌,余洋,楊宇衡,畢朝位. 分子植物育種. 2018(10)
[2]桃PpSnRK1βγ1在擬南芥中超表達(dá)提高植株氧化脅迫耐性[J]. 趙永飛,陳曉璐,彭福田,羅靜靜,肖元松. 植物生理學(xué)報(bào). 2017(07)
[3]百子蓮有望成切花新秀[J]. 陸繼亮,周銀龍. 花木盆景(花卉園藝). 2012(08)
[4]植物抗病抗逆機(jī)理的研究概述[J]. 徐玲,陳自宏,晏愛(ài)芬,余麗. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(03)
[5]葉綠體信號(hào)參與了擬南芥干旱脅迫響應(yīng)[J]. 何春霞,曹文堯,張中偉,程鑒,徐飛,林宏輝,袁澍. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(01)
[6]轉(zhuǎn)GmAREB基因提高擬南芥的干旱、氧化脅迫耐性[J]. 高世慶,陳明,徐兆師,唐益苗,李連城,馬有志,趙昌平. 作物學(xué)報(bào). 2011(06)
碩士論文
[1]ROS誘導(dǎo)的氧化脅迫與細(xì)胞凋亡對(duì)百子蓮愈傷組織超低溫保存細(xì)胞活性的影響機(jī)制[D]. 張潔.上海交通大學(xué) 2015
[2]藍(lán)百合快速繁殖技術(shù)的研究[D]. 范現(xiàn)麗.上海交通大學(xué) 2009
本文編號(hào):3551916
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