菌株TYF-B5-5（NCBI網(wǎng)站基因登錄號為WJHD00000000）是太原理工大學(xué)微生物課題組從山西食醋中分離篩選出的1株嗜熱耐酸野生菌株,通過NCBI數(shù)據(jù)庫將菌株的16S r RNA進(jìn)行Blast同源比對,確認(rèn)為芽孢桿菌。菌株TYF-B5-5可以利用木質(zhì)纖維素一步發(fā)酵生產(chǎn)乙醇,在以天然玉米秸稈為唯一碳源時,最適條件下乙醇濃度可達(dá)8.0 mmol/L。為了進(jìn)一步了解該菌株的代謝機(jī)制及其特性,對菌株TYF-B5-5進(jìn)行了全基因組測序。結(jié)果顯示,該菌株基因組大小為3 984 415 bp,GC含量為43.56%,有11個scaffolds和12個contigs,共有4 303個基因得到注釋;通過數(shù)據(jù)庫比對分析,完成了菌株TYF-B5-5丙酮酸到乙醇代謝過程5種關(guān)鍵基因的功能預(yù)測。菌株TYF-B5-5全基因組測序結(jié)果分析可為嗜熱芽孢桿菌產(chǎn)乙醇代謝途徑的研究提供理論支持。 

【文章來源】：山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(01)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 試劑與儀器設(shè)備
    1.3 方法
        1.3.1 菌種的分離鑒定與發(fā)酵條件確定
        1.3.2 發(fā)酵代謝物分析及產(chǎn)物優(yōu)化
    1.4 全基因組數(shù)據(jù)處理分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 菌種的分離鑒定
    2.2 菌株代謝產(chǎn)物分析及乙醇條件優(yōu)化
        2.2.1 代謝產(chǎn)物分析
        2.2.2 乙醇特性優(yōu)化
    2.3 菌株全基因組測序及乙醇代謝通路預(yù)測
        2.3.1 樣品組裝結(jié)果
        2.3.2 基因功能注釋
        2.3.3 乙醇代謝通路預(yù)測
3 結(jié)論與討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]原料藥SR的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)研究[D]. 董曉亞.河南大學(xué) 2016



本文編號：3551409