以Sinularia軟珊瑚為研究對象,用Covaris超聲波破碎儀隨機(jī)將其DNA樣品打斷成長度為350 bp的片段,構(gòu)建好的文庫通過Illumina Nova Seq進(jìn)行PE測序.結(jié)果表明:軟珊瑚Sinularia ceramensis Verseveldt基因組大小為649. 58 Mbp,雜合率為1. 25%,重復(fù)序列比例為57. 06%.采用kmer=43進(jìn)行初步組裝,得到contig N50為836 bp,總長為586. 07 Mbp,scaffold N50為1 044 bp,總長為599. 11 Mbp.結(jié)果顯示,Sinularia ceramensis Verseveldt的基因組為1個復(fù)雜的基因組,需要采用相應(yīng)的策略進(jìn)行基因組組裝. 

【文章來源】：海南熱帶海洋學(xué)院學(xué)報. 2020,27(02)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

短指軟珊瑚圖像及其共肉組織

短指軟珊瑚(Sinularia ceramensis Verseveldt)共肉組織不同部位壓片

短指軟珊瑚共肉組織不同部位DNA擴(kuò)增產(chǎn)物結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3530803