深海生態(tài)系統(tǒng)中有著豐富的病毒粒子,病毒通過影響宿主的生命活動從而參與全球生物化學(xué)循環(huán)中。通過對深海沉積物病毒宏基因組進行分析,有助于了解深海病毒的種類、豐度及其分布特點,也可以了解深�？赡艽嬖诘木哂懈腥拘缘牟《镜刃畔ⅰ１菊撐氖占煌暥�、不同深度、不同深海環(huán)境（包括海山、洋中脊、熱液口、冷泉）的50個深海沉積物樣本,分離沉積物中的病毒、提取病毒基因組DNA并進行全基因組擴增,然后進行病毒宏基因組分析。透射電鏡觀察結(jié)果顯示,深海沉積物中存在形態(tài)各異的病毒。深海沉積物病毒宏基因組高通量測序,共獲得1,271,381,283條read（序列）,經(jīng)序列拼接共得到1,293,316條contig（拼接序列）,這些病毒有73,678個OTU（分類單元）。將測序結(jié)果與實驗室自建的病毒數(shù)據(jù)庫進行比較分析,結(jié)果表明約23%的深海沉積物病毒是已知病毒,約有77%的深海沉積物病毒為未知病毒,其中已知病毒可歸屬于25個科的病毒類群。在深海沉積物的已知病毒中,短尾噬菌體科是豐度最高的病毒類群,豐度排在前九位的病毒類群還包括長尾噬菌體科、多瘤病毒科、痘病毒科、微小噬菌體科、肌尾噬菌體科、線極病毒科、基因病毒科、環(huán)... 

【文章來源】：浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學(xué)位級別】：碩士

【圖文】：

海洋生物的大小

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文引言10兩組分系統(tǒng)的氮代謝和同化途徑、有機含硒化合物代謝、氨�；�-tRNA的生物合成、氨基糖和核苷酸糖代謝等[95]。目前，在深海熱液口發(fā)現(xiàn)了大量的噬菌體[107,108]，這表明病毒感染可能可以促進宿主的生存。一些研究還表明，病毒是支持宿主在不利環(huán)境中生存的關(guān)鍵因素[104,105,109]。據(jù)報道，病毒可以攜帶多種輔助代謝基因參與其宿主的代謝[97,110,111]。Lindell等研究表明，噬菌體攜帶編碼光系統(tǒng)II核心反應(yīng)中心蛋白D1的psbA基因[109]。在宿主細胞停止產(chǎn)生光合作用蛋白之后，由藍藻所編碼的光合作用蛋白可用于維持能量的產(chǎn)生[111]。在大腸桿菌中，盡管其不能被誘導(dǎo)，但它們?nèi)詫Νh(huán)境脅迫有很大的耐受力[120]。據(jù)報道，推測感染硫氧化細菌的15種雙鏈DNA病毒的基因組包含反向異化亞硫酸鹽還原酶的輔助代謝基因和亞基[105]。所有記錄在案的發(fā)現(xiàn)都表明，病毒可以使宿主應(yīng)對不同的環(huán)境條件，并且病毒感染可以為病毒的生存和繁殖發(fā)揮重要作用[106-113]。這些研究結(jié)果都顯示，病毒在微生物代謝途徑中的具有補償作用。迄今為止，許多關(guān)于不可培養(yǎng)病毒的研究來自于海洋環(huán)境。研究發(fā)現(xiàn)，海洋病毒在生物地球化學(xué)過程中發(fā)揮重要作用，病毒在感染宿主之后可釋放出生物可用的溶解的有機物，促進生物地球化學(xué)循環(huán)[114-122]（圖1.2）。圖1.2病毒在海洋食物網(wǎng)中的作用（引自文獻48）。DOM：溶解的有機物；POM：顆粒性有機物。Fig1.2Theroleofvirusinmarinefoodweb(FromRef48).DOM,dissolvedorganic

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文結(jié)果與分析31圖3.1透射電鏡觀察分離的沉積物病毒顆粒。在所示的深海沉積物病毒中，a、b可能是噬菌體，病毒粒子呈扁形或橢圓狀。c、d、e、f、q、r、s、t可能是噬菌體，病毒呈圓形，具有不同直徑大校h和l所示為長尾噬菌體，其外表形態(tài)上具有長無收縮性的尾鞘，衣殼為正多面體或扁形。g和i都屬于肌尾噬菌體，噬菌體構(gòu)造包含頭部（病毒顆粒）和尾部，病毒顆粒無被膜。j、k都是短尾噬菌體，在形態(tài)上具有不能收縮的短尾以及無被膜的頭部病毒顆粒。m、n、o、p可能為真核生物病毒，呈現(xiàn)圓形、扁形或正多面體結(jié)構(gòu)，病毒顆粒外有被膜結(jié)構(gòu)。Fig3.1TEMresultsofvirusparticlesisolatedfromdeep-seasediments.Forthesedeep-seaviruses,aandbmightbebacteriophages,whichwereflatorellipticalvirions.Thevirusesshowninc,d,e,f,q,r,sandtmightbebacteriophageswith


本文編號：3527215