大腸桿菌holo-ACP突變體的表達(dá)純化及相應(yīng)acyl-ACP的性質(zhì)初探
發(fā)布時間:2021-11-25 12:26
酰基-;d體蛋白(acyl-acyl carrier protein,acyl-ACP)作為酰基供體,在脂肪酸、聚酮等天然產(chǎn)物合成途徑中具有重要作用.目前,常以;-輔酶A(acyl-CoA)來代替尚未商品化的acyl-ACP進(jìn)行相關(guān)酶的體外活性研究.由于底物蛋白acyl-ACP的ACP部分與相關(guān)酶發(fā)生相互作用,影響酶的催化特性,這種替代無法真實認(rèn)識相關(guān)酶的;D(zhuǎn)移特性.本文以大腸桿菌pET-28a(+)-ACP為模板,構(gòu)建12株單點(diǎn)突變體,表達(dá)純化出相應(yīng)holoACP,并進(jìn)一步合成C16:0-ACP和C18:1-ACP.高效液相色譜的結(jié)果表明,ACP單點(diǎn)突變會影響acyl-ACP整體的性質(zhì),其中T40殘基的改變對acyl-ACP的疏水性、紫外吸收響應(yīng)和穩(wěn)定性均產(chǎn)生了顯著影響.ACP突變體的性質(zhì)表征為acyl-ACP與相關(guān)酶的互作機(jī)制研究奠定了基礎(chǔ).
【文章來源】:北京理工大學(xué)學(xué)報. 2020,40(08)北大核心EICSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
不同物種來源的ACP序列同源性比較
通過SDS-PAGE分析12株holo-ACP突變體(圖2),除I63R出現(xiàn)3個條帶外,其余11株holoACP突變體均為單一條帶,該條帶出現(xiàn)在20kDa處,但holo-ACP的相對分子質(zhì)量為11kDa,這是由于大腸桿菌ACP富含酸性陰離子氨基酸殘基-天冬氨酸和谷氨酸,二者所占比例近50%,使得holo-ACP在SDS-PAGE中的遷移特征與常規(guī)蛋白質(zhì)有所不同,這與文獻(xiàn)[16]一致.可見,除I63R外的11株holo-ACP突變體均純化成功(I63R的holoACP不再繼續(xù)合成acyl-ACP),T64N的條帶位置在其余10株突變體條帶下方,與野生株(WT)有所不同,上述10株突變體的電泳遷移性質(zhì)與WT類似.由表4可知,holo-ACP突變體表達(dá)過程中,先表達(dá)的apo-ACP進(jìn)一步發(fā)生后修飾反應(yīng),生成holoACP,apo-ACP沒有完全反應(yīng)生成holo-ACP.除I63R的holo-ACP純度只有49%外,WT和其余11株突變體的holo-ACP純度在84%~99%之間.12株holo-ACP突變體中,I63R的蛋白獲得量最低,為5.1mg/L,T40I,L47F,I55F和A60P與WT的蛋白獲得量在同一水平,均在10mg/L以上,其余7株holo-ACP突變體的蛋白獲得量在7~9mg/L之間.
其次,本文比較了各C16:0-ACP和C18:1-ACP突變體在HPLC中檢測信號的單位峰面積所代表的物質(zhì)的量(fmol/mAU)的差異(圖3),以此來表征其在紫外吸收響應(yīng)方面的性質(zhì)差異,fmol/mAU越小,表明該蛋白的紫外吸收響應(yīng)越強(qiáng).由圖3可知,單位點(diǎn)突變使大部分C16:0-ACP和C18:1-ACP突變體的紫外吸收響應(yīng)增強(qiáng),其中與WT相比,C16:0-ACP突變體在210nm處的紫外吸收響應(yīng)差異較大的為T40L和A60P,C16:0-ACP的fmol/mAU分別只有WT的0.4和0.3倍,其余10株突變體與WT相近;對于C18:1-ACP,除Q15D和V30L外,其余10株突變體的紫外吸收響應(yīng)均顯著高于WT,特別是T40I,T40L和I55F,其C18:1-ACP的fmol/mAU分別只有WT的0.2,0.5和0.5倍.因此,T40氨基酸殘基也使ACP的紫外吸收發(fā)生了明顯的變化.最后,對acyl-ACP合成產(chǎn)物中C16:0-ACP和C18:1-ACP的純度及其穩(wěn)定性進(jìn)行了評價.由圖4可知,WT和大多突變體的C16:0-ACP純度低于相應(yīng)的C18:1-ACP純度,表明ACP的單點(diǎn)突變對C16:0-ACP穩(wěn)定性的影響更大.在11株ACP突變體中,C16:0-ACP和C18:1-ACP與WT之間純度差異較大的為T40I,L47F,T53F和I55F,這4株突變體的C16:0-ACP純度均在60%以下,C18:1-ACP純度均在75%以下;其余7株突變體的純度均等同于或高于WT.由表6可知,上述4株C16:0-ACP突變體經(jīng)-80℃凍融后,其holo-ACP比例均提高至20%以上,相應(yīng)的C18:1-ACP突變體經(jīng)凍融后的holo-ACP比例提高至5%~10%之間,WT和其余7株突變體的holo-ACP比例變化不大.這些結(jié)果表明上述4株突變體的acyl-ACP易水解,性質(zhì)相對不穩(wěn)定.此外,上述4株holo-ACP突變體合成acyl-ACP后,所含apo-ACP比例會明顯增大(表4和圖4),這可能是在30℃合成反應(yīng)期間ACP上Ser36的羥基與4’-PPT磷酸基之間的磷酯鍵水解造成的.可見,ACP的單點(diǎn)突變T40I,L47F,T53F和I55F會使acyl-ACP合成反應(yīng)體系的不穩(wěn)定性提高,還會影響其已合成C16:0-ACP和C18:1-ACP的水解,表明這些氨基酸殘基在維持ACP的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)穩(wěn)定方面具有重要作用.根據(jù)ACP氨基酸位點(diǎn)的分布信息,T40和L47位于α2螺旋,T53和I55位于L2.Masoudi等研究[9]表明,ACP可通過調(diào)節(jié)α2螺旋、L2和α3螺旋的位置來控制其疏水空腔大小,以容納不同鏈長的;,導(dǎo)致acyl-ACP整體構(gòu)象發(fā)生改變.因此,本研究進(jìn)一步表明了氨基酸殘基T40、L47、T53和I55在維持ACP構(gòu)象穩(wěn)定中發(fā)揮的重要作用.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Acyl-ACPs的規(guī);铣蒣J]. 丁威,馮延賓,曹旭鵬,薛松. 中國生物工程雜志. 2018(04)
本文編號:3518137
【文章來源】:北京理工大學(xué)學(xué)報. 2020,40(08)北大核心EICSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
不同物種來源的ACP序列同源性比較
通過SDS-PAGE分析12株holo-ACP突變體(圖2),除I63R出現(xiàn)3個條帶外,其余11株holoACP突變體均為單一條帶,該條帶出現(xiàn)在20kDa處,但holo-ACP的相對分子質(zhì)量為11kDa,這是由于大腸桿菌ACP富含酸性陰離子氨基酸殘基-天冬氨酸和谷氨酸,二者所占比例近50%,使得holo-ACP在SDS-PAGE中的遷移特征與常規(guī)蛋白質(zhì)有所不同,這與文獻(xiàn)[16]一致.可見,除I63R外的11株holo-ACP突變體均純化成功(I63R的holoACP不再繼續(xù)合成acyl-ACP),T64N的條帶位置在其余10株突變體條帶下方,與野生株(WT)有所不同,上述10株突變體的電泳遷移性質(zhì)與WT類似.由表4可知,holo-ACP突變體表達(dá)過程中,先表達(dá)的apo-ACP進(jìn)一步發(fā)生后修飾反應(yīng),生成holoACP,apo-ACP沒有完全反應(yīng)生成holo-ACP.除I63R的holo-ACP純度只有49%外,WT和其余11株突變體的holo-ACP純度在84%~99%之間.12株holo-ACP突變體中,I63R的蛋白獲得量最低,為5.1mg/L,T40I,L47F,I55F和A60P與WT的蛋白獲得量在同一水平,均在10mg/L以上,其余7株holo-ACP突變體的蛋白獲得量在7~9mg/L之間.
其次,本文比較了各C16:0-ACP和C18:1-ACP突變體在HPLC中檢測信號的單位峰面積所代表的物質(zhì)的量(fmol/mAU)的差異(圖3),以此來表征其在紫外吸收響應(yīng)方面的性質(zhì)差異,fmol/mAU越小,表明該蛋白的紫外吸收響應(yīng)越強(qiáng).由圖3可知,單位點(diǎn)突變使大部分C16:0-ACP和C18:1-ACP突變體的紫外吸收響應(yīng)增強(qiáng),其中與WT相比,C16:0-ACP突變體在210nm處的紫外吸收響應(yīng)差異較大的為T40L和A60P,C16:0-ACP的fmol/mAU分別只有WT的0.4和0.3倍,其余10株突變體與WT相近;對于C18:1-ACP,除Q15D和V30L外,其余10株突變體的紫外吸收響應(yīng)均顯著高于WT,特別是T40I,T40L和I55F,其C18:1-ACP的fmol/mAU分別只有WT的0.2,0.5和0.5倍.因此,T40氨基酸殘基也使ACP的紫外吸收發(fā)生了明顯的變化.最后,對acyl-ACP合成產(chǎn)物中C16:0-ACP和C18:1-ACP的純度及其穩(wěn)定性進(jìn)行了評價.由圖4可知,WT和大多突變體的C16:0-ACP純度低于相應(yīng)的C18:1-ACP純度,表明ACP的單點(diǎn)突變對C16:0-ACP穩(wěn)定性的影響更大.在11株ACP突變體中,C16:0-ACP和C18:1-ACP與WT之間純度差異較大的為T40I,L47F,T53F和I55F,這4株突變體的C16:0-ACP純度均在60%以下,C18:1-ACP純度均在75%以下;其余7株突變體的純度均等同于或高于WT.由表6可知,上述4株C16:0-ACP突變體經(jīng)-80℃凍融后,其holo-ACP比例均提高至20%以上,相應(yīng)的C18:1-ACP突變體經(jīng)凍融后的holo-ACP比例提高至5%~10%之間,WT和其余7株突變體的holo-ACP比例變化不大.這些結(jié)果表明上述4株突變體的acyl-ACP易水解,性質(zhì)相對不穩(wěn)定.此外,上述4株holo-ACP突變體合成acyl-ACP后,所含apo-ACP比例會明顯增大(表4和圖4),這可能是在30℃合成反應(yīng)期間ACP上Ser36的羥基與4’-PPT磷酸基之間的磷酯鍵水解造成的.可見,ACP的單點(diǎn)突變T40I,L47F,T53F和I55F會使acyl-ACP合成反應(yīng)體系的不穩(wěn)定性提高,還會影響其已合成C16:0-ACP和C18:1-ACP的水解,表明這些氨基酸殘基在維持ACP的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)穩(wěn)定方面具有重要作用.根據(jù)ACP氨基酸位點(diǎn)的分布信息,T40和L47位于α2螺旋,T53和I55位于L2.Masoudi等研究[9]表明,ACP可通過調(diào)節(jié)α2螺旋、L2和α3螺旋的位置來控制其疏水空腔大小,以容納不同鏈長的;,導(dǎo)致acyl-ACP整體構(gòu)象發(fā)生改變.因此,本研究進(jìn)一步表明了氨基酸殘基T40、L47、T53和I55在維持ACP構(gòu)象穩(wěn)定中發(fā)揮的重要作用.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Acyl-ACPs的規(guī);铣蒣J]. 丁威,馮延賓,曹旭鵬,薛松. 中國生物工程雜志. 2018(04)
本文編號:3518137
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