生物對氧的感受與調(diào)控過程非常復(fù)雜,應(yīng)答機(jī)制主要涉及基因組、轉(zhuǎn)錄組與蛋白質(zhì)組等,其中蛋白質(zhì)組及其翻譯后修飾組是研究此類問題的重要手段。生物對高海拔低氧適應(yīng)機(jī)制是研究熱點(diǎn),目前缺乏蛋白質(zhì)組及磷酸化蛋白質(zhì)組在生物應(yīng)對低氧環(huán)境中作用機(jī)制的研究。青海田鼠（Neodon fuscus）世居于青藏高原高寒草甸地區(qū),布氏田鼠（Lasiopodomys brandtii）則分布于內(nèi)蒙古草原,兩種田鼠分類地位較近,棲息地類型相似,是高海拔低氧相關(guān)研究的良好物種。本論文以青海田鼠為研究對象,布氏田鼠為對照,經(jīng)個性化與肥滿度篩選后,分別將20只個體在實驗室低氧艙內(nèi)模擬100m、3000m、5000m和7000m海拔的氧環(huán)境,經(jīng)24小時處理后取腦組織,采用高通量質(zhì)譜鑒定技術(shù)獲取兩種田鼠的蛋白質(zhì)組和磷酸化蛋白質(zhì)組定量數(shù)據(jù);通過差異蛋白鑒定方法,確定差異蛋白表達(dá)趨勢,采用GO與KEGG富集、蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測等方法,對特定表達(dá)趨勢類型的差異蛋白進(jìn)行分析;使用GPS 2.1算法,結(jié)合蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù),預(yù)測兩種田鼠的位點(diǎn)特異性激酶與底物的相互關(guān)系,并構(gòu)建相應(yīng)的激酶-位點(diǎn)磷酸化調(diào)控網(wǎng)絡(luò),分析該網(wǎng)絡(luò)調(diào)控低氧適應(yīng)的分子機(jī)制。旨... 

【文章來源】：鄭州大學(xué)河南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：95 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

曠場-鏡像實驗裝置示意圖[79]

2蛋白質(zhì)組及磷酸化蛋白質(zhì)組的質(zhì)譜鑒定12基于青海田鼠和布氏田鼠磷酸化蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)，分別篩選出可定量的且位點(diǎn)修飾概率大于0.75的磷酸化位點(diǎn)，及其相應(yīng)蛋白和肽段作為后續(xù)磷酸化組學(xué)分析的數(shù)據(jù)集。2.3結(jié)果與分析2.3.1個性化得分和肥滿度分別對27只青海田鼠和布氏田鼠的個性化得分進(jìn)行正態(tài)分布檢驗，結(jié)果表明青海田鼠（Kolmogorov-SmirnovZ=0.143，df=27，P=0.163）和布氏田鼠（Kolmogorov-SmirnovZ=0.138，P=0.200）的個性化得分均表現(xiàn)為正態(tài)分布（圖2.2）。青海田鼠個性化得分均值為8.14±0.67，95%置信區(qū)間為6.75-9.52，中值8.48，方差12.26，標(biāo)準(zhǔn)差3.50，范圍是12.84（1.47-14.31），四分位距6.08，偏度-0.30±0.45，峰度-0.81±0.87（圖2.2A）。布氏田鼠個性化得分均值為15.35±0.64，95%置信區(qū)間為14.01-16.67，中值16.00，方差11.19，標(biāo)準(zhǔn)差3.34，范圍是11.06（8.94-20.00），四分位距6.40，偏度-0.18±0.45，峰度-1.09±0.87（圖2.2B）。圖2.2青海田鼠（A）和布氏田鼠（B）個性化得分直方圖Figure2.2ThehistogramofpersonalizedscoreinN.fuscus(A)andL.brandtii(B)

青海田鼠（Kolmogorov-Smirnov Z=0.179，df=27，P=0.027）和布氏田鼠（Kolmogorov-Smirnov Z=0.240，df=27，P<0.001）肥滿度均不符合正態(tài)分布。青海田鼠肥滿度均值為 4.92±0.16，95%置信區(qū)間為 4.60-5.24，中值 4.70，方差0.67，標(biāo)準(zhǔn)差 0.82，范圍是 2.73（3.85-6.58），四分位距 1.30，偏度 0.49±0.45，峰度-1.08±0.87（圖 2.3A）。布氏田鼠肥滿度均值為 4.95±0.11，95%置信區(qū)間為4.72-5.17，中值 5.00，方差 0.33，標(biāo)準(zhǔn)差 0.57，范圍是 2.00（4.00-6.00），四分位距 0.30，偏度 0.15±0.45，峰度-0.08±0.87（圖 2.3B）。 Mann-Whitney U 檢驗發(fā)現(xiàn)青海田鼠和布氏田鼠肥滿度之間不存在顯著性差異（P=0.4924，U=324.5）。兩種田鼠均選擇肥滿度 4-6.5 區(qū)間，對后續(xù)低氧實驗造成干擾可能會較小。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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[3]基于比較轉(zhuǎn)錄組的棕色田鼠與布氏田鼠低氧適應(yīng)研究[D]. 李揚(yáng)威.鄭州大學(xué) 2017
[4]植物磷酸化蛋白質(zhì)組的生物信息學(xué)分析[D]. 程涵.華中科技大學(xué) 2015

碩士論文
[1]布氏田鼠婚配制度初探[D]. 牟媛媛.曲阜師范大學(xué) 2019
[2]個性化對棕色田鼠雌性配偶選擇和子代的影響[D]. 虞靜.鄭州大學(xué) 2016



本文編號：3516960