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TVMV和PVX侵染本氏煙引發(fā)的m6A甲基化變化研究

發(fā)布時(shí)間:2021-11-24 00:54
  6-甲基腺嘌呤[N6-methyl-adenosine(m6A)]是指發(fā)生于腺嘌呤(Adenine)的第6位氮原子(N)上的甲基化修飾,是近年來(lái)備受關(guān)注的RNA表觀遺傳調(diào)控方向的研究熱點(diǎn)。m6A甲基化在人類(lèi)RNA病毒(如HIV)和植物病毒(AMV和CMV)復(fù)制中也具有一定的調(diào)控作用。但關(guān)于植物病毒是否影響植物體內(nèi)的m6A甲基化變化的報(bào)道很少。本論文研究了本氏煙(Nicotianabenthamiana)受到煙草脈斑駁病毒(TVMV)、馬鈴薯X病毒(PVX)侵染后對(duì)寄主RNA m6A甲基化的影響。研究結(jié)果如下:(1)通過(guò)比色法測(cè)定m6A甲基化水平,發(fā)現(xiàn)在病毒侵染本氏煙后,m6A甲基化水平與健康植株相比顯著降低(P<0.5),所檢測(cè)到的m6A分別為0.0565%(健康植株),0.0295%(TVMV)和 0.0205%(PVX)。(2)對(duì)侵染TVMV和PVX的樣品中m6A甲基化峰進(jìn)行了 MeRIP-Seq測(cè)序分析。結(jié)果也證實(shí)了病毒侵染后植株中m6A甲基化水平明顯降低,健康植株中有33655個(gè)m6A甲基化峰,侵染TVMV的樣品中有32556個(gè)m6A甲基化峰,侵染PVX的樣品中有1888... 

【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】:48 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

TVMV和PVX侵染本氏煙引發(fā)的m6A甲基化變化研究


圖1真核生物mRNA中常見(jiàn)化學(xué)修飾分布(引自⑴)??Fig.l?Distribution?of?common?chemical?modifications?in?eukaryotic?mRNA??

侵染,癥狀,甲基化,病毒


?內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位:論文?15??3結(jié)果與分析??3.1?TVMV和PVX侵染后本氏煙m6A甲基化水平??在本氏煙(iV.?執(zhí)amiarnj)上用機(jī)械摩擦接種的方法接種了?TVMV和PVX,14??d后觀察病毒侵染癥狀,如圖2所示,與健康本氏煙相比,被PVX侵染的葉片表現(xiàn)??為輕型花葉,葉片上有大小不等、形狀不規(guī)則的黃綠色斑駁;被TVMV侵染的葉片??表現(xiàn)為厚度不均勻的癥狀。在系統(tǒng)侵染的葉片中采用RT-PCR方法分析驗(yàn)證了病毒的??積累量,如圖3可知TVMV和PVX都獲得了相應(yīng)的特異性擴(kuò)增條帶,說(shuō)明本氏煙中??病毒的積累量達(dá)到要求,可以進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。采用比色法(EpiQuikm6ARNA甲基??化定量試劑盒)對(duì)病毒侵染的系統(tǒng)葉片進(jìn)行測(cè)定m6A甲基化。結(jié)果如圖4,檢測(cè)到??健康植物、TVMV和PVX侵染的樣品中m6A甲基化分別為0.0565%,?0.0295%和??0.0205%。這表明這兩種病毒侵染均導(dǎo)致寄主植物中總的m6A甲基化水平顯著降低??(P<0.5),??Healthy?TVMV?PVX??___??圖2?TVMV和PVX在本氏煙上的侵染癥狀??Fig.2?Symptoms?of?TVMV?and?PVX?infected?N.?benthamiana??0.07?i??〇.〇a.??1500hp?'??|?0.04?-?H??>〇〇?aQ2?■?■畜??雇bp?°'°;丨■?■?■??100?bp?Healthy?TVMV??圖3?RT-PCR方法檢測(cè)TVMV和PVX?圖4病毒fe:染后的m6A甲基化水平??Fig.3?Detection?of?TVMV?and?P

方法,侵染,甲基化,病毒


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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[6]RNA修飾分布特征概述[J]. 韓瀟,孫寶發(fā).  生命科學(xué). 2018(04)
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博士論文
[1]RNA m6A修飾及其催化基因METTL14在肝癌發(fā)生發(fā)展中的作用及機(jī)制研究[D]. 馬金召.第二軍醫(yī)大學(xué) 2017
[2]mRNA m6A位點(diǎn)預(yù)測(cè)及其功能的系統(tǒng)生物學(xué)研究[D]. 向書(shū)念.清華大學(xué) 2017
[3]RNA N6-甲基腺嘌呤(m6A)位點(diǎn)形成機(jī)制及功能研究[D]. 郝亞娟.中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所 2016

碩士論文
[1]高脂對(duì)小鼠肝臟基因RNA甲基化的影響[D]. 羅祖朋.廣西大學(xué) 2019



本文編號(hào):3514966

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