TVMV和PVX侵染本氏煙引發(fā)的m6A甲基化變化研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-24 00:54
6-甲基腺嘌呤[N6-methyl-adenosine(m6A)]是指發(fā)生于腺嘌呤(Adenine)的第6位氮原子(N)上的甲基化修飾,是近年來(lái)備受關(guān)注的RNA表觀遺傳調(diào)控方向的研究熱點(diǎn)。m6A甲基化在人類(lèi)RNA病毒(如HIV)和植物病毒(AMV和CMV)復(fù)制中也具有一定的調(diào)控作用。但關(guān)于植物病毒是否影響植物體內(nèi)的m6A甲基化變化的報(bào)道很少。本論文研究了本氏煙(Nicotianabenthamiana)受到煙草脈斑駁病毒(TVMV)、馬鈴薯X病毒(PVX)侵染后對(duì)寄主RNA m6A甲基化的影響。研究結(jié)果如下:(1)通過(guò)比色法測(cè)定m6A甲基化水平,發(fā)現(xiàn)在病毒侵染本氏煙后,m6A甲基化水平與健康植株相比顯著降低(P<0.5),所檢測(cè)到的m6A分別為0.0565%(健康植株),0.0295%(TVMV)和 0.0205%(PVX)。(2)對(duì)侵染TVMV和PVX的樣品中m6A甲基化峰進(jìn)行了 MeRIP-Seq測(cè)序分析。結(jié)果也證實(shí)了病毒侵染后植株中m6A甲基化水平明顯降低,健康植株中有33655個(gè)m6A甲基化峰,侵染TVMV的樣品中有32556個(gè)m6A甲基化峰,侵染PVX的樣品中有1888...
【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:48 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1真核生物mRNA中常見(jiàn)化學(xué)修飾分布(引自⑴)??Fig.l?Distribution?of?common?chemical?modifications?in?eukaryotic?mRNA??
?內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位:論文?15??3結(jié)果與分析??3.1?TVMV和PVX侵染后本氏煙m6A甲基化水平??在本氏煙(iV.?執(zhí)amiarnj)上用機(jī)械摩擦接種的方法接種了?TVMV和PVX,14??d后觀察病毒侵染癥狀,如圖2所示,與健康本氏煙相比,被PVX侵染的葉片表現(xiàn)??為輕型花葉,葉片上有大小不等、形狀不規(guī)則的黃綠色斑駁;被TVMV侵染的葉片??表現(xiàn)為厚度不均勻的癥狀。在系統(tǒng)侵染的葉片中采用RT-PCR方法分析驗(yàn)證了病毒的??積累量,如圖3可知TVMV和PVX都獲得了相應(yīng)的特異性擴(kuò)增條帶,說(shuō)明本氏煙中??病毒的積累量達(dá)到要求,可以進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。采用比色法(EpiQuikm6ARNA甲基??化定量試劑盒)對(duì)病毒侵染的系統(tǒng)葉片進(jìn)行測(cè)定m6A甲基化。結(jié)果如圖4,檢測(cè)到??健康植物、TVMV和PVX侵染的樣品中m6A甲基化分別為0.0565%,?0.0295%和??0.0205%。這表明這兩種病毒侵染均導(dǎo)致寄主植物中總的m6A甲基化水平顯著降低??(P<0.5),??Healthy?TVMV?PVX??___??圖2?TVMV和PVX在本氏煙上的侵染癥狀??Fig.2?Symptoms?of?TVMV?and?PVX?infected?N.?benthamiana??0.07?i??〇.〇a.??1500hp?'??|?0.04?-?H??>〇〇?aQ2?■?■畜??雇bp?°'°;丨■?■?■??100?bp?Healthy?TVMV??圖3?RT-PCR方法檢測(cè)TVMV和PVX?圖4病毒fe:染后的m6A甲基化水平??Fig.3?Detection?of?TVMV?and?P
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]m6A與mRNA代謝及其與惡性腫瘤關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 孫善文,雍紅梅,周學(xué)義. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2020(10)
[2]高效液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法測(cè)定芒果中六種鏈格孢霉毒素殘留[J]. 張子庚,張愛(ài)芝,邢家溧,承海,張書(shū)芬,鄭睿行,戴賢君. 食品工業(yè)科技. 2020(20)
[3]RNA甲基化修飾m6A在動(dòng)物中的研究進(jìn)展[J]. 何波,周小楓,蔣瑤,曹浩男,袁曉龍,張哲,張豪,李加琪. 畜牧與獸醫(yī). 2020(03)
[4]m6A修飾在人類(lèi)相關(guān)致病病毒中的作用與研究進(jìn)展[J]. 吳芳,成文召,趙飛媛,范大夢(mèng),刁勇,許瑞安,唐明青. 病毒學(xué)報(bào). 2019(05)
[5]病毒基因組中m6A甲基化修飾調(diào)控機(jī)制及研究進(jìn)展[J]. 鞏沅鑫,王超,李晉濤. 病毒學(xué)報(bào). 2018(05)
[6]RNA修飾分布特征概述[J]. 韓瀟,孫寶發(fā). 生命科學(xué). 2018(04)
[7]mRNA修飾研究概況及展望[J]. 孫文舉,周克任,楊建華,周惠,屈良鵠. 生命科學(xué). 2016(05)
[8]擬南芥m6A甲基化組的系統(tǒng)鑒定和功能分析[J]. 駱觀正,Alice MacQueen,鄭冠群,段紅超,Louis C.Dore,盧志科,劉君,陳凱,賈桂芳,Joy Bergelson,何川. 遺傳. 2015(03)
[9]人類(lèi)皰疹病毒8型基因甲基化的研究進(jìn)展[J]. 吳曹英,普雄明. 中國(guó)麻風(fēng)皮膚病雜志. 2012 (09)
博士論文
[1]RNA m6A修飾及其催化基因METTL14在肝癌發(fā)生發(fā)展中的作用及機(jī)制研究[D]. 馬金召.第二軍醫(yī)大學(xué) 2017
[2]mRNA m6A位點(diǎn)預(yù)測(cè)及其功能的系統(tǒng)生物學(xué)研究[D]. 向書(shū)念.清華大學(xué) 2017
[3]RNA N6-甲基腺嘌呤(m6A)位點(diǎn)形成機(jī)制及功能研究[D]. 郝亞娟.中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所 2016
碩士論文
[1]高脂對(duì)小鼠肝臟基因RNA甲基化的影響[D]. 羅祖朋.廣西大學(xué) 2019
本文編號(hào):3514966
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【文章頁(yè)數(shù)】:48 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1真核生物mRNA中常見(jiàn)化學(xué)修飾分布(引自⑴)??Fig.l?Distribution?of?common?chemical?modifications?in?eukaryotic?mRNA??
?內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位:論文?15??3結(jié)果與分析??3.1?TVMV和PVX侵染后本氏煙m6A甲基化水平??在本氏煙(iV.?執(zhí)amiarnj)上用機(jī)械摩擦接種的方法接種了?TVMV和PVX,14??d后觀察病毒侵染癥狀,如圖2所示,與健康本氏煙相比,被PVX侵染的葉片表現(xiàn)??為輕型花葉,葉片上有大小不等、形狀不規(guī)則的黃綠色斑駁;被TVMV侵染的葉片??表現(xiàn)為厚度不均勻的癥狀。在系統(tǒng)侵染的葉片中采用RT-PCR方法分析驗(yàn)證了病毒的??積累量,如圖3可知TVMV和PVX都獲得了相應(yīng)的特異性擴(kuò)增條帶,說(shuō)明本氏煙中??病毒的積累量達(dá)到要求,可以進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。采用比色法(EpiQuikm6ARNA甲基??化定量試劑盒)對(duì)病毒侵染的系統(tǒng)葉片進(jìn)行測(cè)定m6A甲基化。結(jié)果如圖4,檢測(cè)到??健康植物、TVMV和PVX侵染的樣品中m6A甲基化分別為0.0565%,?0.0295%和??0.0205%。這表明這兩種病毒侵染均導(dǎo)致寄主植物中總的m6A甲基化水平顯著降低??(P<0.5),??Healthy?TVMV?PVX??___??圖2?TVMV和PVX在本氏煙上的侵染癥狀??Fig.2?Symptoms?of?TVMV?and?PVX?infected?N.?benthamiana??0.07?i??〇.〇a.??1500hp?'??|?0.04?-?H??>〇〇?aQ2?■?■畜??雇bp?°'°;丨■?■?■??100?bp?Healthy?TVMV??圖3?RT-PCR方法檢測(cè)TVMV和PVX?圖4病毒fe:染后的m6A甲基化水平??Fig.3?Detection?of?TVMV?and?P
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]m6A與mRNA代謝及其與惡性腫瘤關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 孫善文,雍紅梅,周學(xué)義. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2020(10)
[2]高效液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法測(cè)定芒果中六種鏈格孢霉毒素殘留[J]. 張子庚,張愛(ài)芝,邢家溧,承海,張書(shū)芬,鄭睿行,戴賢君. 食品工業(yè)科技. 2020(20)
[3]RNA甲基化修飾m6A在動(dòng)物中的研究進(jìn)展[J]. 何波,周小楓,蔣瑤,曹浩男,袁曉龍,張哲,張豪,李加琪. 畜牧與獸醫(yī). 2020(03)
[4]m6A修飾在人類(lèi)相關(guān)致病病毒中的作用與研究進(jìn)展[J]. 吳芳,成文召,趙飛媛,范大夢(mèng),刁勇,許瑞安,唐明青. 病毒學(xué)報(bào). 2019(05)
[5]病毒基因組中m6A甲基化修飾調(diào)控機(jī)制及研究進(jìn)展[J]. 鞏沅鑫,王超,李晉濤. 病毒學(xué)報(bào). 2018(05)
[6]RNA修飾分布特征概述[J]. 韓瀟,孫寶發(fā). 生命科學(xué). 2018(04)
[7]mRNA修飾研究概況及展望[J]. 孫文舉,周克任,楊建華,周惠,屈良鵠. 生命科學(xué). 2016(05)
[8]擬南芥m6A甲基化組的系統(tǒng)鑒定和功能分析[J]. 駱觀正,Alice MacQueen,鄭冠群,段紅超,Louis C.Dore,盧志科,劉君,陳凱,賈桂芳,Joy Bergelson,何川. 遺傳. 2015(03)
[9]人類(lèi)皰疹病毒8型基因甲基化的研究進(jìn)展[J]. 吳曹英,普雄明. 中國(guó)麻風(fēng)皮膚病雜志. 2012 (09)
博士論文
[1]RNA m6A修飾及其催化基因METTL14在肝癌發(fā)生發(fā)展中的作用及機(jī)制研究[D]. 馬金召.第二軍醫(yī)大學(xué) 2017
[2]mRNA m6A位點(diǎn)預(yù)測(cè)及其功能的系統(tǒng)生物學(xué)研究[D]. 向書(shū)念.清華大學(xué) 2017
[3]RNA N6-甲基腺嘌呤(m6A)位點(diǎn)形成機(jī)制及功能研究[D]. 郝亞娟.中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所 2016
碩士論文
[1]高脂對(duì)小鼠肝臟基因RNA甲基化的影響[D]. 羅祖朋.廣西大學(xué) 2019
本文編號(hào):3514966
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