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TVMV和PVX侵染本氏煙引發(fā)的m6A甲基化變化研究

發(fā)布時間:2021-11-24 00:54
  6-甲基腺嘌呤[N6-methyl-adenosine(m6A)]是指發(fā)生于腺嘌呤(Adenine)的第6位氮原子(N)上的甲基化修飾,是近年來備受關注的RNA表觀遺傳調控方向的研究熱點。m6A甲基化在人類RNA病毒(如HIV)和植物病毒(AMV和CMV)復制中也具有一定的調控作用。但關于植物病毒是否影響植物體內的m6A甲基化變化的報道很少。本論文研究了本氏煙(Nicotianabenthamiana)受到煙草脈斑駁病毒(TVMV)、馬鈴薯X病毒(PVX)侵染后對寄主RNA m6A甲基化的影響。研究結果如下:(1)通過比色法測定m6A甲基化水平,發(fā)現(xiàn)在病毒侵染本氏煙后,m6A甲基化水平與健康植株相比顯著降低(P<0.5),所檢測到的m6A分別為0.0565%(健康植株),0.0295%(TVMV)和 0.0205%(PVX)。(2)對侵染TVMV和PVX的樣品中m6A甲基化峰進行了 MeRIP-Seq測序分析。結果也證實了病毒侵染后植株中m6A甲基化水平明顯降低,健康植株中有33655個m6A甲基化峰,侵染TVMV的樣品中有32556個m6A甲基化峰,侵染PVX的樣品中有1888... 

【文章來源】:內蒙古農業(yè)大學內蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】:48 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

TVMV和PVX侵染本氏煙引發(fā)的m6A甲基化變化研究


圖1真核生物mRNA中常見化學修飾分布(引自⑴)??Fig.l?Distribution?of?common?chemical?modifications?in?eukaryotic?mRNA??

侵染,癥狀,甲基化,病毒


?內蒙古農業(yè)大學碩士學位:論文?15??3結果與分析??3.1?TVMV和PVX侵染后本氏煙m6A甲基化水平??在本氏煙(iV.?執(zhí)amiarnj)上用機械摩擦接種的方法接種了?TVMV和PVX,14??d后觀察病毒侵染癥狀,如圖2所示,與健康本氏煙相比,被PVX侵染的葉片表現(xiàn)??為輕型花葉,葉片上有大小不等、形狀不規(guī)則的黃綠色斑駁;被TVMV侵染的葉片??表現(xiàn)為厚度不均勻的癥狀。在系統(tǒng)侵染的葉片中采用RT-PCR方法分析驗證了病毒的??積累量,如圖3可知TVMV和PVX都獲得了相應的特異性擴增條帶,說明本氏煙中??病毒的積累量達到要求,可以進行下一步實驗。采用比色法(EpiQuikm6ARNA甲基??化定量試劑盒)對病毒侵染的系統(tǒng)葉片進行測定m6A甲基化。結果如圖4,檢測到??健康植物、TVMV和PVX侵染的樣品中m6A甲基化分別為0.0565%,?0.0295%和??0.0205%。這表明這兩種病毒侵染均導致寄主植物中總的m6A甲基化水平顯著降低??(P<0.5),??Healthy?TVMV?PVX??___??圖2?TVMV和PVX在本氏煙上的侵染癥狀??Fig.2?Symptoms?of?TVMV?and?PVX?infected?N.?benthamiana??0.07?i??〇.〇a.??1500hp?'??|?0.04?-?H??>〇〇?aQ2?■?■畜??雇bp?°'°;丨■?■?■??100?bp?Healthy?TVMV??圖3?RT-PCR方法檢測TVMV和PVX?圖4病毒fe:染后的m6A甲基化水平??Fig.3?Detection?of?TVMV?and?P

方法,侵染,甲基化,病毒


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【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
[1]RNA m6A修飾及其催化基因METTL14在肝癌發(fā)生發(fā)展中的作用及機制研究[D]. 馬金召.第二軍醫(yī)大學 2017
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[3]RNA N6-甲基腺嘌呤(m6A)位點形成機制及功能研究[D]. 郝亞娟.中國科學院北京基因組研究所 2016

碩士論文
[1]高脂對小鼠肝臟基因RNA甲基化的影響[D]. 羅祖朋.廣西大學 2019



本文編號:3514966

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