目的:研究流式細胞術檢測小鼠骨髓造血干祖細胞分析方法,探索建立使用流式細胞術結合生物信息學分析小鼠造血干祖細胞的新方法,為實驗血液學研究提供基礎。方法:使用流式細胞儀進行小鼠骨髓造血干祖細胞流式分析;使用FlowJo軟件對造血干祖細胞結果應用t-分布鄰域嵌入算法（t-distributed stochastic neighbor embedding,t SNE）、統(tǒng)一流形逼近與投影（uniform manifold approximation and projection,UMAP）和流式自組織特征映射（flow selforganizing feature map,FlowSOM）分析,并對分析結果進行比較,探索通過生物信息學降維方式分析小鼠造血干祖細胞流式結果的新方法。結果:t SNE、UMAP和FlowSOM分析可以通過降維直觀地反映群體細胞的抗原表達水平,并對細胞進行分群和聚類。其分析結果與傳統(tǒng)流式分析所得細胞群比例相符。結論:流式細胞術結合FlowJo軟件建立的小鼠骨髓造血干祖細胞分析方法可以很好地評價造血干祖細胞各群分布和比例,具有較好的穩(wěn)定性和評價能力。 

【文章來源】：醫(yī)療衛(wèi)生裝備. 2020,41(02)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

小鼠骨髓造血干祖細胞流式細胞分析結果

小鼠骨髓造血干祖細胞流式細胞t SNE分析結果

如圖5所示，100個單細胞以抗原表達情況為依據(jù)，形成聚類分析結果。標識顏色越相近、所在位置越相近的細胞，其抗原表達和細胞類型越接近。著色的扇形標識表示該抗原表達強弱情況，扇形標識越大，該抗原表達越多。由圖5(c）可見，主要細胞群包括3個，細胞比例最高的一群為ST-HSC（綠色），其CD34表達為陽性，CD16/32表達為陰性。細胞比例次之的為LT-HSC（紅色），其CD34和CD16/32表達均為陰性。細胞比例第三的為MPP（藍色），其CD34和CD16/32表達均為陽性。聚類分析結果與3種細胞的細胞群比例相符，呈依次降低關系（58.3%、22.0%、12.6%）。3 討論

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3511707