香豆酸-3-羥化酶屬于植物中最大的蛋白酶細(xì)胞色素P450家族之一,在植物生命活動中發(fā)揮著重要作用。為了解地黃香豆酸-3-羥化酶基因RgC3H合成毛蕊花糖苷的功能,該研究基于地黃代謝組學(xué)分析獲得KEGG途徑中的C3H,采用多重比對在NCBI中獲得同源基因的一個保守序列,并基于該保守序列和地黃SRA數(shù)據(jù)庫,采用電子克隆和RT-PCR克隆技術(shù)獲得地黃C3H基因全長CDS（RgC3H）,對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:RgC3H基因全長為1 530 bp,且編碼一個含509個氨基酸、分子量為57.91 kD、無信號肽的蛋白質(zhì);基于氨基酸序列的結(jié)構(gòu)分析顯示,RgC3H有一個保守區(qū)域-P450結(jié)構(gòu)域;系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示,RgC3H與芝麻和猴面花的C3H基因具有很高的同源性。上述結(jié)果為進(jìn)一步研究RgC3H基因在地黃毛蕊花糖苷生物合成途徑中的作用奠定了基礎(chǔ)。 

【文章來源】：廣西植物. 2020,40(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

RT-PCR擴(kuò)增Rg C3H電泳

本文應(yīng)用SOPMA及SWISS-MODEL分別對Rg C3H的二級和三級結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)其中α螺旋占最多，為50.69%，其次是無規(guī)卷曲占33.99%，延伸鏈占9.43%和β轉(zhuǎn)角占5.89%(圖6、圖7)。3 討論與結(jié)論

地黃是一種大宗中草藥，具有很高的觀賞、食用及藥用價值，其主要生物活性成分毛蕊花糖苷對其藥效意義重大。毛蕊花糖苷具有抗炎、抗菌、抗氧化、抗腫瘤、光保護(hù)、護(hù)肝、保護(hù)神經(jīng)和免疫調(diào)節(jié)等多種生物活性(Li et al.,2019)。但是，地黃毛蕊花糖苷含量很低，我國藥典規(guī)定地黃毛蕊花糖苷含量不小于0.02%。因此，需要解析地黃毛蕊花糖苷生物合成途徑，探索提高地黃毛蕊花糖苷含量。毛蕊花糖苷生物合成途徑有一條重要的苯丙烷合成途徑，與木質(zhì)素合成途徑具有重疊步驟，而C3H正是兩者重疊途徑中的限速酶(Schoch et al.,2001)，且前期研究已挖掘出了地黃C3H(Wang et al.,2017;Zhou et al.,2018)及其編碼基因Rg C3H的Unigene(Wang et al.,2017)。但是，沒有克隆Rg C3H全長基因和深入研究其合成毛蕊花糖苷的作用。圖4 Rg C3H蛋白氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3511631