胡麻木酚素含量的全基因組關聯(lián)分析
發(fā)布時間:2021-11-19 02:18
為了挖掘胡麻木酚素含量相關基因,本研究用269份胡麻種質(zhì)的基因型數(shù)據(jù)和木酚素含量數(shù)據(jù)進行全基因組關聯(lián)分析研究。呼和浩特、集寧、錫盟和新疆等4個環(huán)境下木酚素含量的統(tǒng)計分析表明:新疆伊犁地區(qū)種的269份胡麻種質(zhì)平均木酚素含量為最大,變異系數(shù)依次排序為錫盟<呼和浩特<集寧<新疆,廣義遺傳力為60.67%。4個環(huán)境下胡麻種質(zhì)木酚素含量均呈現(xiàn)正太分布的趨勢。全基因組關聯(lián)分析獲得了13個顯著SNP位點和21個候選基因,為胡麻分子標記輔助育種以及高木酚素含量新品種選育提供科學依據(jù)。
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
269份胡麻品質(zhì)(系)的木酚素含量的頻率直方圖
本研究用269份胡麻種質(zhì)的基因型數(shù)據(jù)和木酚素含量數(shù)據(jù)進行全基因組關聯(lián)分析獲得了13個顯著SNP位點和21個候選基因。其中,呼和浩特地區(qū)關聯(lián)得到的Lus10030068和錫盟地區(qū)關聯(lián)得到的Lus10020189基因功能相同,即蘇氨酸蛋白激酶。說明該酶功能受多基因控制,而兩個環(huán)境下均檢測到了該酶基因,預測以上兩個基因通過蘇氨酸蛋白激酶功能來調(diào)控胡麻木酚素含量。4個環(huán)境下均檢測到了酶相關基因,其中呼和浩特地區(qū)檢測到了3種酶,集寧地區(qū)檢測到了2種酶,錫盟地區(qū)檢測到了2種酶,新疆地區(qū)檢測到了1種酶。除了呼市地區(qū)以外其他3個地區(qū)均檢測到了蛋白結(jié)合相關基因。木酚素含量關聯(lián)的21個候選基因中集寧地區(qū)的Lus10040474、Lus1-0024628和新疆地區(qū)Lus10007629基因起始位點與相應的顯著SNP位點重疊。因此,后期利用多種組學進一步研究以上三個基因調(diào)控網(wǎng)絡(王曉丹等,218)。3 材料與方法
本文編號:3504086
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
269份胡麻品質(zhì)(系)的木酚素含量的頻率直方圖
本研究用269份胡麻種質(zhì)的基因型數(shù)據(jù)和木酚素含量數(shù)據(jù)進行全基因組關聯(lián)分析獲得了13個顯著SNP位點和21個候選基因。其中,呼和浩特地區(qū)關聯(lián)得到的Lus10030068和錫盟地區(qū)關聯(lián)得到的Lus10020189基因功能相同,即蘇氨酸蛋白激酶。說明該酶功能受多基因控制,而兩個環(huán)境下均檢測到了該酶基因,預測以上兩個基因通過蘇氨酸蛋白激酶功能來調(diào)控胡麻木酚素含量。4個環(huán)境下均檢測到了酶相關基因,其中呼和浩特地區(qū)檢測到了3種酶,集寧地區(qū)檢測到了2種酶,錫盟地區(qū)檢測到了2種酶,新疆地區(qū)檢測到了1種酶。除了呼市地區(qū)以外其他3個地區(qū)均檢測到了蛋白結(jié)合相關基因。木酚素含量關聯(lián)的21個候選基因中集寧地區(qū)的Lus10040474、Lus1-0024628和新疆地區(qū)Lus10007629基因起始位點與相應的顯著SNP位點重疊。因此,后期利用多種組學進一步研究以上三個基因調(diào)控網(wǎng)絡(王曉丹等,218)。3 材料與方法
本文編號:3504086
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