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基于組學(xué)數(shù)據(jù)的藜麥油脂儲(chǔ)存蛋白的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-11-16 17:42
  采用同源對(duì)比方法,從藜麥的基因組中挖掘油脂儲(chǔ)存蛋白序列,并利用生物信息學(xué)軟件和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對(duì)挖掘的基因蛋白序列的理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位、進(jìn)化樹(shù)、組織表達(dá)情況等進(jìn)行了分析。在藜麥基因組中確定了15個(gè)基因與油脂儲(chǔ)存密切相關(guān)。15個(gè)油脂儲(chǔ)存基因分布在9條染色體上,其氨基酸數(shù)目為153~675個(gè),等電點(diǎn)為5.7~10.1。藜麥油脂儲(chǔ)存蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)以無(wú)規(guī)則卷曲和α-螺旋為主。利用MEGA軟件進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)分析,可將藜麥的油脂儲(chǔ)存蛋白分為6個(gè)分枝,且基因表達(dá)情況與分枝情況具有相似性。藜麥油脂儲(chǔ)存蛋白基因具有保守的理化特性,其表達(dá)具有組織特異性,且大多數(shù)成員在種子中的表達(dá)量顯著增加。 

【文章來(lái)源】:江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,32(12)

【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)

【部分圖文】:

基于組學(xué)數(shù)據(jù)的藜麥油脂儲(chǔ)存蛋白的生物信息學(xué)分析


藜麥油脂儲(chǔ)存蛋白基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

基因,蛋白,進(jìn)化樹(shù),中油


藜麥種子中油脂儲(chǔ)存蛋白基因的表達(dá)水平

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]60份國(guó)內(nèi)外藜麥材料子粒的品質(zhì)性狀分析[J]. 石振興,楊修仕,么楊,任貴興.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2017(01)
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本文編號(hào):3499284

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