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位于可變內(nèi)含子區(qū)域microRNA的特征分析

發(fā)布時間:2021-11-14 17:36
  MicroRNA(簡稱miRNA)是一類長度為22nt的編碼小分子RNA,在基因表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮重要作用。miRNA在基因組中存在位置偏好性,一部分miRNA位于基因間區(qū),而另一些miRNA基因位于蛋白質(zhì)編碼基因的內(nèi)含子中,少數(shù)位于外顯子中,稱之為基因內(nèi)miRNA?勺兗艚樱ㄒ卜Q選擇性剪接,alternative splicing,AS)是指對同一基因的mRNA前體的不同剪接方式,即一種基因能產(chǎn)生多種mRNA。研究發(fā)現(xiàn),miRNA與基因的選擇性剪接密切相關(guān),有些miRNA位于基因的可變剪接區(qū)域。論文利用生物信息學(xué)方法對位于可變剪接區(qū)域miRNA特征進(jìn)行分析。 

【文章來源】:中小企業(yè)管理與科技(中旬刊). 2020,(01)

【文章頁數(shù)】:2 頁

【文章目錄】:
1 引言
2 材料與方法
    2.1 數(shù)據(jù)收集
    2.2 可變剪接區(qū)序列特征分析
    2.3 可變剪接區(qū)剪接調(diào)控功能元件預(yù)測
    2.4 可變內(nèi)含子miRNA作用靶基因預(yù)測及功能分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 可變內(nèi)含子區(qū)域miRNA的鑒定
    3.2 位于可變剪接區(qū)域miRNA及可變剪接基因特征分析
    3.3 可變剪接區(qū)域序列GC含量、Cp G島及SNP分布特征分析
    3.4 可變剪接區(qū)域參與的剪接調(diào)控的功能元件及剪接因子的作用位點預(yù)測
    3.5 可變內(nèi)含子miRNA靶標(biāo)基因預(yù)測及功能分析
4 結(jié)論



本文編號:3495061

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