珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)是全球生產(chǎn)力最高的生態(tài)系統(tǒng)之一,在海洋環(huán)境的物質(zhì)循環(huán)與能量流動中發(fā)揮了重要作用,并以不到1%的覆蓋面積為沿海數(shù)百萬人提供了食物及收入來源。然而目前研究顯示全球活珊瑚覆蓋率正因人類活動影響和自然環(huán)境變化而逐漸降低,如人類過度捕撈活動,大型機械破壞珊瑚礁區(qū),CO₂過度排放導(dǎo)致的全球變暖,以及海洋酸化導(dǎo)致的珊瑚骨骼的侵蝕等。國內(nèi)外大量研究指出當珊瑚受到環(huán)境壓力時,珊瑚共附生細菌群落組成會發(fā)生變化,這種變化可能與珊瑚健康維持和恢復(fù)有關(guān),對珊瑚共附生細菌的研究將有助于我們深入了解細菌與珊瑚健康關(guān)系,理解珊瑚退化的內(nèi)在機理,為珊瑚礁健康的恢復(fù)創(chuàng)造機會。然而珊瑚共附生細菌研究起步晚,對珊瑚共附生細菌的研究還有待進一步探索。目前澄黃濱珊瑚所代表的塊狀珊瑚在多個地點代替枝狀珊瑚成為優(yōu)勢種,證明塊狀珊瑚有更強的適應(yīng)能力和抗干擾能力,因此本論文選取澄黃濱珊瑚（Porites lutea）和團塊濱珊瑚（Porites lobata）作為研究對象,分析其共附生細菌多樣性,并對其進行純培養(yǎng)研究。首先,利用高通量測序技術(shù)從整體上對濱珊瑚共附生細菌多樣性進行研究。16S rRNA基... 

【文章來源】：廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-16個珊瑚樣品的Rank-Abundance曲線

廣西大學(xué)碩士學(xué)位論文濱珊瑚共附生細菌多樣性及其純培養(yǎng)研究132.3.2.2Alpha多樣性分析和稀釋曲線分析從coverage指數(shù)可知（表2-4），6個樣品的coverage指數(shù)均在0.99以上，說明樣品種序列被檢測出的概率很高，基本可以代表樣品種細菌的真實情況。表2-4個珊瑚樣品細菌多樣性分析Table2-4thebacterialdiversityin6coralsamples樣品編號sobsacechaoshannonsimpsoncoveragePL1258265.0758268.21.9632990.3527220.999454PL218731966.6051946.2494.9101950.0335610.995429PL3730741.8746743.69573.4495410.1664120.999241PL410281050.8791046.9833.7936720.0921140.998317P113531369.2231367.3934.548780.0812890.998884P212671334.8481334.0512.8953740.2261560.996985由多樣性指數(shù)可看出，PL2的ace指數(shù)和chao指數(shù)呈較高水平，為1966.605和1946.249，說明其細菌豐富度較高，其次P1和P2的ace指數(shù)和chao指數(shù)相似，PL3和PL4的ace指數(shù)和chao指數(shù)相似，PL1的ace指數(shù)和chao指數(shù)最低，僅有265.0758和268.2，表明細菌豐富度較低。Sobs指數(shù)表明樣品豐富度實際觀測值，從表2-4中可知，PL1的sobs值最低，表明其豐度最低，PL2最高，P1和P2的sobs值接近，具有相似的豐富度。Shannon指數(shù)和simpson指數(shù)得到了相似的結(jié)果，Shannon指數(shù)結(jié)果顯示PL1的shannon指數(shù)和simpson指數(shù)最低，多樣性最低，PL2的shannon指數(shù)和simpson指數(shù)最高，多樣性最高（表2-4）。圖2-2Shannon指數(shù)和chao指數(shù)構(gòu)建的6個珊瑚樣品的稀釋曲線Figure2-2Rarefactioncurveof6coralsamplesconstructedbyShannonindexandChaoindex圖2-2所示為6個珊瑚樣品測序結(jié)果的稀釋曲線圖。Chao指數(shù)和shannon指數(shù)結(jié)果

廣西大學(xué)碩士學(xué)位論文濱珊瑚共附生細菌多樣性及其純培養(yǎng)研究14顯示稀釋曲線隨測序數(shù)量增加趨于平緩，表明樣品的測序量合理。shannon指數(shù)越大多樣性越高，可以看出PL2和P1多樣性最高，其次是PL3，PL4和P2，PL1最低。chao指數(shù)越高群落豐富度越高，可以看出PL2豐富度最高，其次是P1，PL3，P2和PL4，PL1豐富度最低。2.3.3物種組成分析通過群落組分分析可知6個珊瑚樣品的細菌在門水平的比例和分布（圖2-3）�？芍�6個珊瑚樣品中細菌在門水平上主要分為變形菌門（Proteobacteria），占比在42.58-86.11%之間、擬桿菌門（Bacteroidetes），占比在2.27-23.13%之間、藍細菌門（Cyanobacteria）占比在1.67-16.05%之間、放線菌門（Actinobacteria），占比在1.23-4.87%之間、厚壁菌門（Firmicutes），占比在0.36-2.4%之間、酸桿菌門（Acidobacteria），占比在0.26-1.31%之間，其余還有綠彎菌門（Chloroflexi）、浮霉菌門（Planctomycetes）、Patescibacteria、疣微菌門（Verrucomicrobia）、芽單胞菌門（Gemmatimonadetes）、螺旋體門（Spirochaetes）、梭桿菌門（Fusobacteria）、Dadabacteria、Epsilonbacteraeota、匿桿菌門（Latescibacteria）、硝化螺旋菌門（Nitrospirae）和Dependentiae，主要分布于變形菌門、擬桿菌門、藍細菌門、放線菌門、厚壁菌門和酸桿菌門。圖2-3門水平群落組成分析Figure2-3Analysisofcommunitycompositioninphylumlevel不同珊瑚樣品之間的細菌群落組成基本一致，但各門占比存在一定的差異。PL2，ProteobacteriaBacteriodetesUnclassified_k_norank_d_BacteriaCyanobacteriaActinobacteriaFirmicutesAcidobacteriaChloroflexiPlanctomycetesPatescibacteriaVerrucomicrobiaDeinococcus-ThermusGemmatimo

【參考文獻】：
期刊論文
[1]人類活動對徐聞燈樓角珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)的影響[J]. 王麗榮,趙煥庭,宋朝景.  海洋開發(fā)與管理. 2006(01)



本文編號：3494772