定量蛋白質(zhì)組學揭示hfq2在嗜水氣單胞菌多效生理功能中的重要作用
發(fā)布時間:2021-11-05 04:54
Hfq蛋白是一種進化上高度保守的sRNA分子伴侶蛋白,可在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控RNA翻譯并在細菌生理功能調(diào)節(jié)中發(fā)揮重要作用。大多數(shù)細菌基因組只有一個hfq拷貝,然而少數(shù)細菌在其染色體上含有兩個甚至多個hfq拷貝。目前對Hfq蛋白的分子機制理論大多是建立在常見的Hfq蛋白(Hfq1)上,而Hfq2蛋白由于在大腸桿菌等模式生物中不存在,其聚體形成模式與功能的研究較為缺乏。據(jù)以往報道,不同細菌不同hfq拷貝的生理功能具有多樣性,且與Hfq1相比Hfq2的同源性具有較大差異,這提示Hfq2蛋白的功能與調(diào)控機制在不同微生物中可能會有所不同,其作用在很大程度上仍然不清楚,有待進一步的研究。本實驗室前期對嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)ATCC 7966(NC008570.1)的全基因組分析發(fā)現(xiàn)該菌基因組中含有兩個hfq拷貝,一個是常見的hfq,其基因名是AHA0924,與大多數(shù)細菌Hfq有著較高的同源性,其生物學功能研究較為清楚;另一個hfq拷貝,本文將其簡稱為hfq2,其基因名是AHA3797,是一個含有121個...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學福建省
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
模式菌株大腸桿菌Hfq蛋白的結(jié)構(gòu)示意圖
圖 1-2 Hfq 在 sRNA 介導中的作用[8]Fig 1-2 The role of Hfq in sRNA mediated新的研究已將 Hfq 在 sRNA 介導中的作用機制具體到某些特定基因菌的 csgD 基因,如圖 1-3 所示。csgD 是 sRNAs 介導的轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)的降解依賴于 hfq。在 Hfq 的協(xié)助下,OmrA、OmrB、McaS、RprA、G 和 RybB 等 sRNA 對轉(zhuǎn)錄因子 csgD 的表達具有負作用。通常情況下點或者裂解位點上的 sRNAs、Hfq 和核糖核酸酶 E(RNase E)位csgD mRNA 上。McaS,RprA,GcvB 和 OmrA / B 蛋白都有與核糖端配對的堿基對。當 OmrA 和 OmrB 引起翻譯抑制時,McaS、R 誘導 mRNA 的核糖核酸裂解,當結(jié)合在 Hfq 結(jié)合位點上游 5'-末端附抑制 RNase E 裂解、并且減輕由 McaS 誘導的 csgD 基因表達抑制。bB 通過在核糖體結(jié)合位點結(jié)合 CsgD 來抑制翻譯起始復合物的形成制起始核糖體進入的目的。在某些情況下,與 csgD 結(jié)合的 sRNA
圖 1-3 sRNA 介導的 CsyD 與 Hfq 調(diào)控模型[30]Fig 1-3 Model for sRNA-mediated regulation of CsgD and H sRNA-asRNA 的相互配對過程中的作用 sRNA 發(fā)生作用外,還會與順式反義 RNA(natura作。30 多年前第一次在細菌中發(fā)現(xiàn) asRNA,asRNA
本文編號:3477116
【文章來源】:福建農(nóng)林大學福建省
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
模式菌株大腸桿菌Hfq蛋白的結(jié)構(gòu)示意圖
圖 1-2 Hfq 在 sRNA 介導中的作用[8]Fig 1-2 The role of Hfq in sRNA mediated新的研究已將 Hfq 在 sRNA 介導中的作用機制具體到某些特定基因菌的 csgD 基因,如圖 1-3 所示。csgD 是 sRNAs 介導的轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)的降解依賴于 hfq。在 Hfq 的協(xié)助下,OmrA、OmrB、McaS、RprA、G 和 RybB 等 sRNA 對轉(zhuǎn)錄因子 csgD 的表達具有負作用。通常情況下點或者裂解位點上的 sRNAs、Hfq 和核糖核酸酶 E(RNase E)位csgD mRNA 上。McaS,RprA,GcvB 和 OmrA / B 蛋白都有與核糖端配對的堿基對。當 OmrA 和 OmrB 引起翻譯抑制時,McaS、R 誘導 mRNA 的核糖核酸裂解,當結(jié)合在 Hfq 結(jié)合位點上游 5'-末端附抑制 RNase E 裂解、并且減輕由 McaS 誘導的 csgD 基因表達抑制。bB 通過在核糖體結(jié)合位點結(jié)合 CsgD 來抑制翻譯起始復合物的形成制起始核糖體進入的目的。在某些情況下,與 csgD 結(jié)合的 sRNA
圖 1-3 sRNA 介導的 CsyD 與 Hfq 調(diào)控模型[30]Fig 1-3 Model for sRNA-mediated regulation of CsgD and H sRNA-asRNA 的相互配對過程中的作用 sRNA 發(fā)生作用外,還會與順式反義 RNA(natura作。30 多年前第一次在細菌中發(fā)現(xiàn) asRNA,asRNA
本文編號:3477116
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