海蛇是名貴中藥材,也是滋補佳品,分子鑒定方法可適用于海蛇組織。為篩選適合海蛇DNA條形碼的基因,本研究搜索并下載了GenBank上所有12S和16S基因序列。其中每個物種每個基因,盡量保留所有序列,但最多保留不同來源的5條序列。運用Mega軟件比對后,建立MrBayes系統(tǒng)聚類樹。結(jié)果顯示,相對12S基因,16S基因序列包含物種多;其MrBayes樹拓撲結(jié)構(gòu)清晰,支持率高,適合作為DNA條形碼。因此得出結(jié)論,不是每類物種的DNA條形碼都必須是COI基因,對于海蛇的線粒體編碼核糖體基因,16S適合度更高。篩選DNA條形碼基因,可通過蛇肉、蛇皮、蛇膽、蛇血等組織,測得DNA序列片段,從而鑒定物種;可用于海關(guān)、餐飲、中藥、環(huán)保等部門,從而保護野生動物,打擊走私犯罪。 

【文章來源】：基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(07)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

基于12S基因貝葉斯聚類樹

12S和16S為線粒體中編碼核糖體的基因，因為其變異不受氨基酸三聯(lián)密碼子的約束，因此變異率較高；由于擴增蛇類以上兩個基因的引物通用性高，擴增條件溫和，經(jīng)常用作DNA分子標記。作者通過篩選12S和16S基因，旨在篩選出除COI外其它更合適做海蛇DNA條形碼的基因，為市場上海蛇品種鑒定提供技術(shù)支持。由于Gen Bank海蛇12S基因無論是物種數(shù)還是序列總數(shù)都遠不及16S，所以將16S基因作為海蛇DNA條形碼更現(xiàn)實。從分子樹可以看出，平頦海蛇屬(Lapemis)、棘鱗海蛇屬(Astrotia)和長吻海蛇屬(Pelamis)都不成立，應(yīng)歸于真海蛇屬(Hydrophis)。此信息在國際爬行動物數(shù)據(jù)庫The reptile database已經(jīng)得到承認(Pyron et al.,2013)，但中國的權(quán)威工具書《中國動物志》并未作出修改，故建議出版新的權(quán)威工具書。

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3468290