柳樹NAC基因的克隆與表達模式分析
發(fā)布時間:2021-10-20 22:52
【目的】研究柳樹重要抗逆轉(zhuǎn)錄因子基因家族,為揭示柳樹抗逆分子機制提供理論依據(jù)!痉椒ā恳浴K柳2345’的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),克隆了柳樹NAC家族,并分析其序列結(jié)構(gòu)、組織表達特異性以及不同脅迫條件下的表達模式!窘Y(jié)果】克隆的兩個柳樹NAC轉(zhuǎn)錄因子基因分別命名為Sl NAC1和Sl NAC2。生物信息學(xué)分析表明:Sl NAC1序列全長為1 126 bp,編碼產(chǎn)物含343個氨基酸殘基,為穩(wěn)定的親水蛋白,定位于細(xì)胞核; Sl NAC2序列全長為1 139 bp,編碼產(chǎn)物含291個氨基酸殘基,為穩(wěn)定的親水蛋白,定位于葉綠體。兩個基因均具有典型的NAM結(jié)構(gòu)域及A、B、C、D、E 5個亞結(jié)構(gòu)域,還包括共同的LPPG、YPNG和DEE保守基序及NAC抑制結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進化樹分析顯示,Sl NAC1基因與木薯親緣關(guān)系最近,Sl NAC2基因與茄子親緣關(guān)系最近。定量PCR結(jié)果顯示Sl NAC1和Sl NAC2均在葉片表達,根中沒有表達,為葉片特異性轉(zhuǎn)錄因子。定量PCR結(jié)果顯示Sl NAC1基因在脫落酸(ABA)和赤霉素(GA)處理24 h后顯著上調(diào),Sl NAC2基因在聚乙二醇(PEG)、ABA和GA脅...
【文章來源】:南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,44(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料和處理方法
1.2 反轉(zhuǎn)錄PCR與NAC基因的克隆
1.3 生物信息學(xué)分析
1.4 基因表達分析
2 結(jié)果與分析
2.1 柳樹NAC基因與蛋白序列分析
2.2 柳樹NAC家族蛋白結(jié)構(gòu)及進化樹分析
2.3 NAC基因表達模式分析
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]桃PpNAC72的克隆及表達分析[J]. 武肖琦,馮濤,劉艷軍,焦思鵬,孫攀,楊靜慧. 生物技術(shù)通報. 2019(06)
[2]沙冬青AmNAC6基因的克隆與功能初步分析[J]. 唐寬剛,任美艷,張文君,龐新躍,薛敏,王茅雁. 植物科學(xué)學(xué)報. 2018(05)
[3]木薯NAC轉(zhuǎn)錄因子Rd26基因克隆及表達[J]. 丁澤紅,顏彥,付莉莉,黃猛,鐵韋韋,胡偉. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(11)
[4]番茄NAC基因家族的系統(tǒng)進化及表達分析[J]. 姜秀明,牛義嶺,許向陽. 分子植物育種. 2016(08)
[5]茄子SmNAC1基因的克隆與表達分析[J]. 邵帥,徐嶺賢,王紹輝,趙福寬. 園藝學(xué)報. 2014(05)
[6]花生NAC轉(zhuǎn)錄因子AhNAC2和AhNAC3的克隆及轉(zhuǎn)錄特征[J]. 劉旭,李玲. 作物學(xué)報. 2009(03)
本文編號:3447740
【文章來源】:南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,44(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料和處理方法
1.2 反轉(zhuǎn)錄PCR與NAC基因的克隆
1.3 生物信息學(xué)分析
1.4 基因表達分析
2 結(jié)果與分析
2.1 柳樹NAC基因與蛋白序列分析
2.2 柳樹NAC家族蛋白結(jié)構(gòu)及進化樹分析
2.3 NAC基因表達模式分析
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]桃PpNAC72的克隆及表達分析[J]. 武肖琦,馮濤,劉艷軍,焦思鵬,孫攀,楊靜慧. 生物技術(shù)通報. 2019(06)
[2]沙冬青AmNAC6基因的克隆與功能初步分析[J]. 唐寬剛,任美艷,張文君,龐新躍,薛敏,王茅雁. 植物科學(xué)學(xué)報. 2018(05)
[3]木薯NAC轉(zhuǎn)錄因子Rd26基因克隆及表達[J]. 丁澤紅,顏彥,付莉莉,黃猛,鐵韋韋,胡偉. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(11)
[4]番茄NAC基因家族的系統(tǒng)進化及表達分析[J]. 姜秀明,牛義嶺,許向陽. 分子植物育種. 2016(08)
[5]茄子SmNAC1基因的克隆與表達分析[J]. 邵帥,徐嶺賢,王紹輝,趙福寬. 園藝學(xué)報. 2014(05)
[6]花生NAC轉(zhuǎn)錄因子AhNAC2和AhNAC3的克隆及轉(zhuǎn)錄特征[J]. 劉旭,李玲. 作物學(xué)報. 2009(03)
本文編號:3447740
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