春小麥的苗期生長(zhǎng)受到干旱的嚴(yán)重影響,進(jìn)而影響其產(chǎn)量和品質(zhì)。為了明確響應(yīng)干旱脅迫的關(guān)鍵表達(dá)基因,本研究以PEG脅迫和相應(yīng)對(duì)照春小麥苗期葉片為材料構(gòu)建轉(zhuǎn)錄組測(cè)序文庫(kù),利用Illumina HiSeq TM2000進(jìn)行測(cè)序,采用FPKM法計(jì)算基因表達(dá)量,對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行功能分類和KEGG通路分析。結(jié)果表明,樣品測(cè)序均得到6.4 G以上的堿基,每組樣品Q30堿基百分比均大于88.73%。最終結(jié)果篩選到差異表達(dá)基因1 217個(gè),其中410個(gè)上調(diào)表達(dá)基因,807個(gè)下調(diào)表達(dá)基因,顯著富集到谷胱甘肽和苯丙烷類等代謝途徑。本研究結(jié)果為小麥等作物抗旱基因的挖掘和功能研究奠定了良好的基礎(chǔ)。 

【文章來源】：分子植物育種. 2020,18(24)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

PEG脅迫與對(duì)照組差異基因統(tǒng)計(jì)

圖1 PEG脅迫與對(duì)照組差異基因統(tǒng)計(jì)為了分析比較PEG脅迫和對(duì)照兩組之間的表達(dá)，根據(jù)默認(rèn)參數(shù)，用得到的clean reads映射到帶有BOWTIE程序的轉(zhuǎn)錄組組件，然后將相匹配的讀取數(shù)其轉(zhuǎn)化為RPKM。根據(jù)FDR<0.05且|log2FC|>1從中篩選出了1 217個(gè)PEG脅迫處理和對(duì)照組間的差異表達(dá)基因，其中上調(diào)表達(dá)的基因有410個(gè)，807個(gè)基因表達(dá)受到抑制，為理解春小麥應(yīng)答PEG脅迫的分子機(jī)制以及抗旱功能基因的挖掘提供了一定的理論依據(jù)。

CK與PEG差異基因GO分類

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號(hào)：3415450