基于轉(zhuǎn)錄組測序花煙草響應(yīng)鹽脅迫活性氧清除相關(guān)基因的挖掘
發(fā)布時間:2021-09-30 03:11
為了鑒定參與花煙草鹽脅迫響應(yīng)的活性氧清除相關(guān)基因,用200 mmol/L NaCl處理花煙草幼苗,并在處理后12 h采集其幼苗樣本,提取總RNA,采用高通量測序技術(shù),進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序;诓町惐磉_(dá)基因GO及KEGG分析的基礎(chǔ)上,對參與其中的活性氧清除基因進(jìn)行挖掘,利用qRT-PCR的方法驗證轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果。結(jié)果表明,鹽處理后,花煙草基因表達(dá)量變化在2倍以上的基因有7 239個(P<0.01),其中,上調(diào)表達(dá)基因4 037個,下調(diào)表達(dá)基因3 162個,將其功能歸類于生物過程、細(xì)胞組分及分子功能三大類159個GO條目,并顯著富集在12條KEGG代謝通路中。同時,在鹽脅迫下,花煙草有45個活性氧清除相關(guān)基因的表達(dá)發(fā)生了顯著改變,其中,上調(diào)表達(dá)基因28個,下調(diào)表達(dá)基因17個。此結(jié)果說明,活性氧的清除是花煙草抵御鹽脅迫的重要機(jī)制之一。
【文章來源】:生物技術(shù)通報. 2020,36(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
樣品各重復(fù)之間的相關(guān)性分析
抗壞血酸過氧化物酶(Ascorbate peroxidase,APX)及谷胱甘肽過氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)是2個構(gòu)成植物抗氧化系統(tǒng)的關(guān)鍵酶類。APX是一類在高等植物中廣泛存在的亞鐵血紅素蛋白,包括了4個不同的亞型,即葉綠體APX(sAPX)、類囊體APX(tAPX)、微體APX(mbAPX)和胞質(zhì)APX(cAPX)[22]。APX的表達(dá)受生物及非生物脅迫因子的廣泛誘導(dǎo)。研究表明,在鹽脅迫下,堿蓬的SsAPX[23]及白樺的APX[24]的表達(dá)均顯著升高;擬南芥APX[25]及棗樹ZjAPX[26]的過表達(dá),則顯著增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因植株的耐鹽能力。圖3 花煙草響應(yīng)高鹽脅迫的抗氧化基因
花煙草響應(yīng)高鹽脅迫的抗氧化基因
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鹽分脅迫對烤煙葉片亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)及生理生化指標(biāo)的影響[J]. 馬靜,王靜,姚鵬偉,葉紅潮,余海濤,王鵬,李玉寶,葉協(xié)鋒. 中國煙草學(xué)報. 2019(05)
[2]Transcriptome analysis of salt-stress response in three seedling tissues of common wheat[J]. Qiaoling Luo,Wan Teng,Shuang Fang,Hongwei Li,Bin Li,Jinfang Chu,Zhensheng Li,Qi Zheng. The Crop Journal. 2019(03)
[3]鹽脅迫下外源褪黑素對煙草幼苗抗氧化特性和光合特性的影響[J]. 李猛,陳棟,李秀妮,李林林,王榮浩,時向東. 中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報. 2019(02)
[4]水稻苗期低溫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 朱琳,袁夢,高紅秀,曲悅,何沈雨,王劍,王珊,王思宇,楊玲,張忠臣,金正勛. 華北農(nóng)學(xué)報. 2018(05)
[5]逆境脅迫對油菜谷胱甘肽還原酶基因表達(dá)及其酶活性的影響[J]. 張騰國,聶亭亭,孫萬倉,史中飛,王娟. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2018(01)
[6]植物谷胱甘肽過氧化物酶(GPX)研究進(jìn)展[J]. 喬新榮,張繼英. 生物技術(shù)通報. 2016(09)
[7]低鉀脅迫對煙草幼苗葉中基因表達(dá)的影響[J]. 魯黎明,陳勇,魯逸飛,李立芹. 核農(nóng)學(xué)報. 2016(07)
[8]茶樹谷胱甘肽還原酶基因CsGRs的克隆與表達(dá)分析[J]. 岳川,曹紅利,周艷華,王璐,郝心愿,王新超,楊亞軍. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(16)
[9]轉(zhuǎn)ZjAPX基因擬南芥對NaCl、干旱脅迫的耐性研究[J]. 郭慧娜,孟玉平,郝子琪,李倩,曹秋芬. 生物技術(shù)通報. 2013(01)
[10]谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶的研究進(jìn)展[J]. 陳秀華,王臻昱,李先平,朱延明,劉麗,陳威,陳勤. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2013(01)
本文編號:3415008
【文章來源】:生物技術(shù)通報. 2020,36(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
樣品各重復(fù)之間的相關(guān)性分析
抗壞血酸過氧化物酶(Ascorbate peroxidase,APX)及谷胱甘肽過氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)是2個構(gòu)成植物抗氧化系統(tǒng)的關(guān)鍵酶類。APX是一類在高等植物中廣泛存在的亞鐵血紅素蛋白,包括了4個不同的亞型,即葉綠體APX(sAPX)、類囊體APX(tAPX)、微體APX(mbAPX)和胞質(zhì)APX(cAPX)[22]。APX的表達(dá)受生物及非生物脅迫因子的廣泛誘導(dǎo)。研究表明,在鹽脅迫下,堿蓬的SsAPX[23]及白樺的APX[24]的表達(dá)均顯著升高;擬南芥APX[25]及棗樹ZjAPX[26]的過表達(dá),則顯著增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因植株的耐鹽能力。圖3 花煙草響應(yīng)高鹽脅迫的抗氧化基因
花煙草響應(yīng)高鹽脅迫的抗氧化基因
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鹽分脅迫對烤煙葉片亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)及生理生化指標(biāo)的影響[J]. 馬靜,王靜,姚鵬偉,葉紅潮,余海濤,王鵬,李玉寶,葉協(xié)鋒. 中國煙草學(xué)報. 2019(05)
[2]Transcriptome analysis of salt-stress response in three seedling tissues of common wheat[J]. Qiaoling Luo,Wan Teng,Shuang Fang,Hongwei Li,Bin Li,Jinfang Chu,Zhensheng Li,Qi Zheng. The Crop Journal. 2019(03)
[3]鹽脅迫下外源褪黑素對煙草幼苗抗氧化特性和光合特性的影響[J]. 李猛,陳棟,李秀妮,李林林,王榮浩,時向東. 中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報. 2019(02)
[4]水稻苗期低溫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 朱琳,袁夢,高紅秀,曲悅,何沈雨,王劍,王珊,王思宇,楊玲,張忠臣,金正勛. 華北農(nóng)學(xué)報. 2018(05)
[5]逆境脅迫對油菜谷胱甘肽還原酶基因表達(dá)及其酶活性的影響[J]. 張騰國,聶亭亭,孫萬倉,史中飛,王娟. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2018(01)
[6]植物谷胱甘肽過氧化物酶(GPX)研究進(jìn)展[J]. 喬新榮,張繼英. 生物技術(shù)通報. 2016(09)
[7]低鉀脅迫對煙草幼苗葉中基因表達(dá)的影響[J]. 魯黎明,陳勇,魯逸飛,李立芹. 核農(nóng)學(xué)報. 2016(07)
[8]茶樹谷胱甘肽還原酶基因CsGRs的克隆與表達(dá)分析[J]. 岳川,曹紅利,周艷華,王璐,郝心愿,王新超,楊亞軍. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(16)
[9]轉(zhuǎn)ZjAPX基因擬南芥對NaCl、干旱脅迫的耐性研究[J]. 郭慧娜,孟玉平,郝子琪,李倩,曹秋芬. 生物技術(shù)通報. 2013(01)
[10]谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶的研究進(jìn)展[J]. 陳秀華,王臻昱,李先平,朱延明,劉麗,陳威,陳勤. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2013(01)
本文編號:3415008
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