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從序列和基因功能網(wǎng)絡(luò)水平研究植物印記基因

發(fā)布時間:2021-09-15 13:39
  印記基因是一類受表觀遺傳調(diào)控并呈現(xiàn)出親本來源特異性表達(dá)的基因�;蛴∮洭F(xiàn)象廣泛存在于哺乳動物的胎盤組織以及高等植物的胚乳中,對動植物的正常生長、發(fā)育起著重要的調(diào)控作用。印記基因異常的等位基因表達(dá)不僅與人類的某些疾病息息相關(guān),而且對于植物種子大小、淀粉含量的積累等具有重要影響。目前研究者通過高通量測序的手段已經(jīng)在人類、小鼠以及不同高等植物中鑒定出數(shù)十個到數(shù)百個不等的印記基因。然而,除了少數(shù)印記基因的功能被實驗證實外,絕大多數(shù)的印記基因,尤其是在植物中,其功能仍不清楚;另外,印記基因之間的功能關(guān)系也不得而知;更為重要的是,印記基因與非印記基因在序列特征、功能網(wǎng)絡(luò)等方面的差異以及在進(jìn)化過程中驅(qū)動印記基因的產(chǎn)生和丟失等原因仍沒有被詳細(xì)地報道過。因此,在序列水平以及基因功能網(wǎng)絡(luò)水平通過對植物印記基因進(jìn)行分析,可以為揭示基因印記的特點和基因印記機理等方面提供理論依據(jù)。本文以八種被子植物全基因組范圍內(nèi)鑒定到的印記基因為研究對象,通過生物信息學(xué)手段在序列水平,如序列長度、CpG島、串聯(lián)重復(fù)元件等方面進(jìn)行了分析,比較了印記基因和非印記基因在序列特征方面的不同;對植物印記基因的跨物種保守情況進(jìn)行了分析,探... 

【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:124 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

從序列和基因功能網(wǎng)絡(luò)水平研究植物印記基因


基因印記示意圖

種子發(fā)育,現(xiàn)象,甲基化,母本


第一章 文獻(xiàn)綜述E1。其中擬南芥的四個 PRC2 復(fù)合物的組分 MEA,央細(xì)胞中,在雙受精前起到抑制中央細(xì)胞增殖的功A 和 FIS2 的母本和父本等位基因均受到 MET1 的 在中央細(xì)胞中表達(dá)并激活了 FWA 和 FIS2,這種母到甲基化抑制表達(dá)的現(xiàn)象一直持續(xù)到胚乳中,導(dǎo)致的,MEA 的母本等位基因由于 DME 發(fā)生去甲基化受 MET1 以及 H3K27me3 的甲基化抑制表達(dá)。受精2 復(fù)合物的形成,并通過 H3K27me3 抑制了 MEA 本等位基因的表達(dá) (Huh et al., 2007)(圖 1-2)。

印記基因,植物,獨立起源,起源時間


第一章 文獻(xiàn)綜述基因的起源和假說記基因的起源和進(jìn)化,在植物和動物中已鑒定出數(shù)百個印記基因 (Gehring, 2013; Morisonissig et al., 2011),但關(guān)于印記基因的具體起源時間和進(jìn)化模式備受爭議因印記現(xiàn)象在高等植物和哺乳動物中獨立起源,但有著趨同進(jìn)化的Berger, 2007; Pires and Grossniklaus, 2014) (圖 1-3)。在動物中,基因在于真獸亞綱和有袋類動物中,而在單孔目和非哺乳類動物(如鳥類nfree et al., 2009)。在植物中,基因印記則存在于單子葉和雙子葉的胚中(少數(shù))(Pires and Grossniklaus, 2014),而在非開花植物如裸子植物不存在,暗示印記基因的產(chǎn)生是伴隨著植物胚乳的產(chǎn)生而進(jìn)化出來的


本文編號:3396180

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