牛源大腸埃希菌HPI毒力島irp1基因敲除及對(duì)其毒力和生物學(xué)特性影響
發(fā)布時(shí)間:2021-08-29 04:24
奶牛子宮內(nèi)膜炎是目前世界各國(guó)奶牛養(yǎng)殖和生產(chǎn)中最為常見且造成損失最大的疾病之一,在我國(guó)65%至80%奶牛不孕是子宮內(nèi)膜炎所導(dǎo)致的。引起奶牛子宮內(nèi)膜炎的主要病原微生物包括細(xì)菌、支原體、鉤端螺旋體、病毒、真菌及毛滴蟲等,細(xì)菌中主要是大腸埃希菌、變形桿菌、鏈球菌和金黃色葡萄球菌等。為了確定大腸埃希菌致病能力與HPI毒力島irp1基因的關(guān)系,本試驗(yàn)使用自殺性質(zhì)粒p RE112構(gòu)建了大腸埃希菌irp1基因缺失株和回補(bǔ)株,進(jìn)行了irp1基因的功能驗(yàn)證,獲得如下結(jié)果:1. 對(duì)14株大腸埃希菌(編號(hào)E1-E14)進(jìn)行氯霉素抗性和irp1基因的檢測(cè),菌株E1、E4、E6、E8、E9和E12對(duì)氯霉素敏感且irp1基因陽(yáng)性,選取菌株E4進(jìn)行irp1基因敲除和回補(bǔ)。2. 使用重疊PCR法,以E4基因組為模板,融合irp1上下游同源臂,克隆融合片段到自殺性質(zhì)粒p RE112,成功構(gòu)建重組自殺性質(zhì)粒p REΔirp1。以含重組自殺性質(zhì)粒p REΔirp1的大腸埃希菌X7213為供體菌,大腸埃希菌E4為受體菌進(jìn)行共培養(yǎng),通過(guò)兩步同源重組篩選出缺失株E4Δirp1。最后同樣使用自殺性質(zhì)粒p RE112得到回補(bǔ)株E4Δi...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
FeDye3-y復(fù)合物結(jié)構(gòu)式(李葉芳,2012)
第二章大腸埃希菌缺失株E4Δirp1和回補(bǔ)株E4Δirp1-C的構(gòu)建和鑒定9圖2-1pRE112限制性圖譜(彭穎,2015)Figure2-1RestrictionmapofpRE112(pengying2015)本試驗(yàn)所用菌株和質(zhì)粒如下表(表2-1)。表2-1本試驗(yàn)所用菌株及質(zhì)粒列表Table2-1Strainsandplasmidsusedinthisexperiment菌株或質(zhì)粒Strainsorplasmids種類和基因型TypesandGenotypes來(lái)源Source菌株StrainsE4Amps,Cms實(shí)驗(yàn)室分離Δirp1E4,irp1基因缺失本人構(gòu)建Δirp1-CΔirp1,irp1基因缺失后回補(bǔ)本人構(gòu)建X7213自殺性質(zhì)粒pRE112宿主菌,DAP-實(shí)驗(yàn)室保存質(zhì)粒PlasmidspRE112pGP704自殺性質(zhì)粒,pir依賴,包含oriT,oriV,sacB,Cmr實(shí)驗(yàn)室保存pREΔirp1pRE112自殺性質(zhì)粒和irp1上下游序列,包含Cmr本人構(gòu)建pEASY-T1克隆載體,包含Ampr,Kanr實(shí)驗(yàn)室保存pREΔirp1-CpRE112自殺性質(zhì)粒,irp1及其上下游序列,包含Cmr本人構(gòu)建2.1.2主要試劑及儀器主要試劑及儀器,分別見表2-2和2-3。表2-2主要試劑Table2-2Mainreagents主要試劑Mainreagents生產(chǎn)廠家ManufacturerPrimerSTARMaxPremix(2X)寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司Taq酶、T4連接酶、內(nèi)切酶寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司氯霉素、氨芐西林粉末快速感受態(tài)細(xì)胞制備試劑盒(一步法)上海生工生物工程公司上海生工生物工程公司一站式DNA/RNA小量提取試劑盒上海生工生物工程公司UNIQ-10柱式微量瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒上海生工生物工程公司pEASY-T1CloningVector北京全式金公司
第二章大腸埃希菌缺失株E4Δirp1和回補(bǔ)株E4Δirp1-C的構(gòu)建和鑒定13物送去生物公司測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果正確的質(zhì)粒命名為pREΔirp1。(4)缺失株Δirp1的篩選無(wú)痕缺失突變株篩選原理,如圖2-2,具體操作如下:A.含質(zhì)粒pREΔirp1的X7213與親本株E4共培養(yǎng)(單交換)取供體菌X7213100μL(含pREΔirp1)和受體菌大腸埃希菌E450μL,置于含500μL無(wú)菌LB液體的試管中(含DAP),37℃恒溫?fù)u床過(guò)夜搖菌,涂布于含有50μg/mL氯霉素的LB固體平板上,37℃恒溫培養(yǎng)箱過(guò)夜培養(yǎng),次日挑取單菌落PCR進(jìn)行鑒定。B.基因缺失株的篩選和鑒定(雙交換)PCR條帶大小和測(cè)序結(jié)果正確的即為陽(yáng)性接合子,于無(wú)鹽LB液體(含10%蔗糖)中連續(xù)傳代3-5代,取最后一代菌液稀釋涂板,37℃恒溫培養(yǎng)箱過(guò)夜培養(yǎng),次日挑取單菌落進(jìn)行PCR和測(cè)序鑒定,PCR條帶大小和測(cè)序結(jié)果都正確的菌株即為突變株,命名為E4Δirp1。圖2-2缺失株E4Δirp1構(gòu)建原理示意圖Figure2-2TheschematicdiagramofconstructingE4Δirp1deletionstrain2.2.6回補(bǔ)株E4Δirp1-C的構(gòu)建為了確定后續(xù)試驗(yàn)得到的結(jié)果差異是由irp1基因的缺失所致,本試驗(yàn)使用自殺性質(zhì)粒介導(dǎo)同源重組的方法構(gòu)建了缺失株E4Δirp1的回補(bǔ)株E4Δirp1-C。使用irp1-A-F和irp1-B-R作為上下游引物、E4基因組為模板進(jìn)行擴(kuò)增,可以得到約1953bp的片段,其中包括irp1基因及其上下游同源臂,將自殺性質(zhì)粒與所得片段連接轉(zhuǎn)化后,最后用兩步同源重組的方法即可得到回補(bǔ)株E4Δirp1-C,具體操作步驟詳見2.2.5(周秀娟2015)。2.3結(jié)果2.3.1基因敲除菌株的篩選14株大腸埃希菌(E1-E14)經(jīng)過(guò)氯霉素檢測(cè)和irp1基因的PCR篩選,菌株E1、
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大腸桿菌的研究綜述[J]. 殷澤祿,萬(wàn)虎. 甘肅畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[2]奶牛子宮內(nèi)膜炎研究進(jìn)展[J]. 羅光建,王萍,李瑩杰,劉英. 今日畜牧獸醫(yī). 2019(02)
[3]PEC HPI irp2基因缺失株的構(gòu)建及蛋白結(jié)構(gòu)功能預(yù)測(cè)[J]. 劉超英,吳程華,高洪,嚴(yán)玉霖,富國(guó)文,趙汝. 中國(guó)獸藥雜志. 2018(02)
[4]大腸桿菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)2毒力島研究進(jìn)展[J]. 尹磊,祁克宗,宋祥軍,涂健. 微生物學(xué)通報(bào). 2017(12)
[5]豬腸外致病性大腸桿菌對(duì)氟喹諾酮類耐藥機(jī)制研究[J]. 王斌,袁定勝,李金良,李思聰,楊銳,張敏,李旭廷. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(07)
[6]奶牛子宮內(nèi)膜炎病因?qū)W研究進(jìn)展[J]. 那立冬,王東升,董書偉,張世棟,閆寶琪,楊洪早,桑夢(mèng)琪,嚴(yán)作廷. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(09)
[7]大腸埃希菌強(qiáng)毒力島核心基因fyuA研究進(jìn)展[J]. 王莊,張澤輝,劉耀川,張德顯,劉明春. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(08)
[8]副溶血弧菌calR的基因敲除株與回補(bǔ)株構(gòu)建[J]. 侯書寧,孟彥言,朱文君,張凌宇,周冬生,張義全,黃新祥. 軍事醫(yī)學(xué). 2016(05)
[9]奶牛子宮內(nèi)膜炎診療研究進(jìn)展[J]. 彭津津,雍康,張傳師. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(02)
[10]腸毒性大腸桿菌gspD基因敲除以及對(duì)LT毒素分泌的影響[J]. 魯曦,傅恩清,潘蕾,穆德廣,李王平,金發(fā)光. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(12)
博士論文
[1]我國(guó)北方地區(qū)犢牛腹瀉大腸桿菌HPI分子結(jié)構(gòu)組成及其菌蛻的研究[D]. 孫武文.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]沙門氏菌C1血清組特異基因功能分析[D]. 周秀娟.上海交通大學(xué) 2015
碩士論文
[1]克氏檸檬酸桿菌的生物學(xué)特性及其鞭毛素基因fliC的功能[D]. 王樂.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]大腸埃希菌生物被膜對(duì)抗生素和消毒劑藥效的影響[D]. 范玉堂.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[3]香樟精油對(duì)奶牛子宮內(nèi)膜炎大腸桿菌生物膜的抑制作用研究[D]. 付敬敬.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]K88ac+產(chǎn)腸毒素大腸桿菌強(qiáng)毒力島HPI缺失株的構(gòu)建及相關(guān)毒力功能探析[D]. 許綿.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[5]雞肉中大腸桿菌生物膜的污染情況及石榴皮單寧對(duì)大腸桿菌生物膜的干預(yù)作用[D]. 楊沁南.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[6]K88ac+大腸桿菌減毒株的構(gòu)建及其在小鼠體內(nèi)的初步應(yīng)用[D]. 余樹培.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[7]K88ac+產(chǎn)腸毒素大腸桿菌sRNA伴侶蛋白Hfq毒力相關(guān)功能的研究[D]. 胡會(huì)杰.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[8]豬源腸外致病性大腸桿菌六型分泌系統(tǒng)hcp基因缺失株的構(gòu)建及功能研究[D]. 彭穎.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[9]大腸桿菌毒力島HPI相關(guān)基因缺失株的研究[D]. 王晨娟.揚(yáng)州大學(xué) 2012
[10]大腸桿菌O157:H7 O島缺失規(guī)律及O45島基因缺失對(duì)STX2表達(dá)的影響[D]. 李貝貝.山西醫(yī)科大學(xué) 2007
本文編號(hào):3369903
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【部分圖文】:
FeDye3-y復(fù)合物結(jié)構(gòu)式(李葉芳,2012)
第二章大腸埃希菌缺失株E4Δirp1和回補(bǔ)株E4Δirp1-C的構(gòu)建和鑒定9圖2-1pRE112限制性圖譜(彭穎,2015)Figure2-1RestrictionmapofpRE112(pengying2015)本試驗(yàn)所用菌株和質(zhì)粒如下表(表2-1)。表2-1本試驗(yàn)所用菌株及質(zhì)粒列表Table2-1Strainsandplasmidsusedinthisexperiment菌株或質(zhì)粒Strainsorplasmids種類和基因型TypesandGenotypes來(lái)源Source菌株StrainsE4Amps,Cms實(shí)驗(yàn)室分離Δirp1E4,irp1基因缺失本人構(gòu)建Δirp1-CΔirp1,irp1基因缺失后回補(bǔ)本人構(gòu)建X7213自殺性質(zhì)粒pRE112宿主菌,DAP-實(shí)驗(yàn)室保存質(zhì)粒PlasmidspRE112pGP704自殺性質(zhì)粒,pir依賴,包含oriT,oriV,sacB,Cmr實(shí)驗(yàn)室保存pREΔirp1pRE112自殺性質(zhì)粒和irp1上下游序列,包含Cmr本人構(gòu)建pEASY-T1克隆載體,包含Ampr,Kanr實(shí)驗(yàn)室保存pREΔirp1-CpRE112自殺性質(zhì)粒,irp1及其上下游序列,包含Cmr本人構(gòu)建2.1.2主要試劑及儀器主要試劑及儀器,分別見表2-2和2-3。表2-2主要試劑Table2-2Mainreagents主要試劑Mainreagents生產(chǎn)廠家ManufacturerPrimerSTARMaxPremix(2X)寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司Taq酶、T4連接酶、內(nèi)切酶寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司氯霉素、氨芐西林粉末快速感受態(tài)細(xì)胞制備試劑盒(一步法)上海生工生物工程公司上海生工生物工程公司一站式DNA/RNA小量提取試劑盒上海生工生物工程公司UNIQ-10柱式微量瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒上海生工生物工程公司pEASY-T1CloningVector北京全式金公司
第二章大腸埃希菌缺失株E4Δirp1和回補(bǔ)株E4Δirp1-C的構(gòu)建和鑒定13物送去生物公司測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果正確的質(zhì)粒命名為pREΔirp1。(4)缺失株Δirp1的篩選無(wú)痕缺失突變株篩選原理,如圖2-2,具體操作如下:A.含質(zhì)粒pREΔirp1的X7213與親本株E4共培養(yǎng)(單交換)取供體菌X7213100μL(含pREΔirp1)和受體菌大腸埃希菌E450μL,置于含500μL無(wú)菌LB液體的試管中(含DAP),37℃恒溫?fù)u床過(guò)夜搖菌,涂布于含有50μg/mL氯霉素的LB固體平板上,37℃恒溫培養(yǎng)箱過(guò)夜培養(yǎng),次日挑取單菌落PCR進(jìn)行鑒定。B.基因缺失株的篩選和鑒定(雙交換)PCR條帶大小和測(cè)序結(jié)果正確的即為陽(yáng)性接合子,于無(wú)鹽LB液體(含10%蔗糖)中連續(xù)傳代3-5代,取最后一代菌液稀釋涂板,37℃恒溫培養(yǎng)箱過(guò)夜培養(yǎng),次日挑取單菌落進(jìn)行PCR和測(cè)序鑒定,PCR條帶大小和測(cè)序結(jié)果都正確的菌株即為突變株,命名為E4Δirp1。圖2-2缺失株E4Δirp1構(gòu)建原理示意圖Figure2-2TheschematicdiagramofconstructingE4Δirp1deletionstrain2.2.6回補(bǔ)株E4Δirp1-C的構(gòu)建為了確定后續(xù)試驗(yàn)得到的結(jié)果差異是由irp1基因的缺失所致,本試驗(yàn)使用自殺性質(zhì)粒介導(dǎo)同源重組的方法構(gòu)建了缺失株E4Δirp1的回補(bǔ)株E4Δirp1-C。使用irp1-A-F和irp1-B-R作為上下游引物、E4基因組為模板進(jìn)行擴(kuò)增,可以得到約1953bp的片段,其中包括irp1基因及其上下游同源臂,將自殺性質(zhì)粒與所得片段連接轉(zhuǎn)化后,最后用兩步同源重組的方法即可得到回補(bǔ)株E4Δirp1-C,具體操作步驟詳見2.2.5(周秀娟2015)。2.3結(jié)果2.3.1基因敲除菌株的篩選14株大腸埃希菌(E1-E14)經(jīng)過(guò)氯霉素檢測(cè)和irp1基因的PCR篩選,菌株E1、
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大腸桿菌的研究綜述[J]. 殷澤祿,萬(wàn)虎. 甘肅畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[2]奶牛子宮內(nèi)膜炎研究進(jìn)展[J]. 羅光建,王萍,李瑩杰,劉英. 今日畜牧獸醫(yī). 2019(02)
[3]PEC HPI irp2基因缺失株的構(gòu)建及蛋白結(jié)構(gòu)功能預(yù)測(cè)[J]. 劉超英,吳程華,高洪,嚴(yán)玉霖,富國(guó)文,趙汝. 中國(guó)獸藥雜志. 2018(02)
[4]大腸桿菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)2毒力島研究進(jìn)展[J]. 尹磊,祁克宗,宋祥軍,涂健. 微生物學(xué)通報(bào). 2017(12)
[5]豬腸外致病性大腸桿菌對(duì)氟喹諾酮類耐藥機(jī)制研究[J]. 王斌,袁定勝,李金良,李思聰,楊銳,張敏,李旭廷. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(07)
[6]奶牛子宮內(nèi)膜炎病因?qū)W研究進(jìn)展[J]. 那立冬,王東升,董書偉,張世棟,閆寶琪,楊洪早,桑夢(mèng)琪,嚴(yán)作廷. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(09)
[7]大腸埃希菌強(qiáng)毒力島核心基因fyuA研究進(jìn)展[J]. 王莊,張澤輝,劉耀川,張德顯,劉明春. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(08)
[8]副溶血弧菌calR的基因敲除株與回補(bǔ)株構(gòu)建[J]. 侯書寧,孟彥言,朱文君,張凌宇,周冬生,張義全,黃新祥. 軍事醫(yī)學(xué). 2016(05)
[9]奶牛子宮內(nèi)膜炎診療研究進(jìn)展[J]. 彭津津,雍康,張傳師. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(02)
[10]腸毒性大腸桿菌gspD基因敲除以及對(duì)LT毒素分泌的影響[J]. 魯曦,傅恩清,潘蕾,穆德廣,李王平,金發(fā)光. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(12)
博士論文
[1]我國(guó)北方地區(qū)犢牛腹瀉大腸桿菌HPI分子結(jié)構(gòu)組成及其菌蛻的研究[D]. 孫武文.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]沙門氏菌C1血清組特異基因功能分析[D]. 周秀娟.上海交通大學(xué) 2015
碩士論文
[1]克氏檸檬酸桿菌的生物學(xué)特性及其鞭毛素基因fliC的功能[D]. 王樂.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]大腸埃希菌生物被膜對(duì)抗生素和消毒劑藥效的影響[D]. 范玉堂.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[3]香樟精油對(duì)奶牛子宮內(nèi)膜炎大腸桿菌生物膜的抑制作用研究[D]. 付敬敬.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]K88ac+產(chǎn)腸毒素大腸桿菌強(qiáng)毒力島HPI缺失株的構(gòu)建及相關(guān)毒力功能探析[D]. 許綿.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[5]雞肉中大腸桿菌生物膜的污染情況及石榴皮單寧對(duì)大腸桿菌生物膜的干預(yù)作用[D]. 楊沁南.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[6]K88ac+大腸桿菌減毒株的構(gòu)建及其在小鼠體內(nèi)的初步應(yīng)用[D]. 余樹培.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[7]K88ac+產(chǎn)腸毒素大腸桿菌sRNA伴侶蛋白Hfq毒力相關(guān)功能的研究[D]. 胡會(huì)杰.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[8]豬源腸外致病性大腸桿菌六型分泌系統(tǒng)hcp基因缺失株的構(gòu)建及功能研究[D]. 彭穎.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[9]大腸桿菌毒力島HPI相關(guān)基因缺失株的研究[D]. 王晨娟.揚(yáng)州大學(xué) 2012
[10]大腸桿菌O157:H7 O島缺失規(guī)律及O45島基因缺失對(duì)STX2表達(dá)的影響[D]. 李貝貝.山西醫(yī)科大學(xué) 2007
本文編號(hào):3369903
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