牛源大腸埃希菌HPI毒力島irp1基因敲除及對其毒力和生物學(xué)特性影響
發(fā)布時間:2021-08-29 04:24
奶牛子宮內(nèi)膜炎是目前世界各國奶牛養(yǎng)殖和生產(chǎn)中最為常見且造成損失最大的疾病之一,在我國65%至80%奶牛不孕是子宮內(nèi)膜炎所導(dǎo)致的。引起奶牛子宮內(nèi)膜炎的主要病原微生物包括細菌、支原體、鉤端螺旋體、病毒、真菌及毛滴蟲等,細菌中主要是大腸埃希菌、變形桿菌、鏈球菌和金黃色葡萄球菌等。為了確定大腸埃希菌致病能力與HPI毒力島irp1基因的關(guān)系,本試驗使用自殺性質(zhì)粒p RE112構(gòu)建了大腸埃希菌irp1基因缺失株和回補株,進行了irp1基因的功能驗證,獲得如下結(jié)果:1. 對14株大腸埃希菌(編號E1-E14)進行氯霉素抗性和irp1基因的檢測,菌株E1、E4、E6、E8、E9和E12對氯霉素敏感且irp1基因陽性,選取菌株E4進行irp1基因敲除和回補。2. 使用重疊PCR法,以E4基因組為模板,融合irp1上下游同源臂,克隆融合片段到自殺性質(zhì)粒p RE112,成功構(gòu)建重組自殺性質(zhì)粒p REΔirp1。以含重組自殺性質(zhì)粒p REΔirp1的大腸埃希菌X7213為供體菌,大腸埃希菌E4為受體菌進行共培養(yǎng),通過兩步同源重組篩選出缺失株E4Δirp1。最后同樣使用自殺性質(zhì)粒p RE112得到回補株E4Δi...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
FeDye3-y復(fù)合物結(jié)構(gòu)式(李葉芳,2012)
第二章大腸埃希菌缺失株E4Δirp1和回補株E4Δirp1-C的構(gòu)建和鑒定9圖2-1pRE112限制性圖譜(彭穎,2015)Figure2-1RestrictionmapofpRE112(pengying2015)本試驗所用菌株和質(zhì)粒如下表(表2-1)。表2-1本試驗所用菌株及質(zhì)粒列表Table2-1Strainsandplasmidsusedinthisexperiment菌株或質(zhì)粒Strainsorplasmids種類和基因型TypesandGenotypes來源Source菌株StrainsE4Amps,Cms實驗室分離Δirp1E4,irp1基因缺失本人構(gòu)建Δirp1-CΔirp1,irp1基因缺失后回補本人構(gòu)建X7213自殺性質(zhì)粒pRE112宿主菌,DAP-實驗室保存質(zhì)粒PlasmidspRE112pGP704自殺性質(zhì)粒,pir依賴,包含oriT,oriV,sacB,Cmr實驗室保存pREΔirp1pRE112自殺性質(zhì)粒和irp1上下游序列,包含Cmr本人構(gòu)建pEASY-T1克隆載體,包含Ampr,Kanr實驗室保存pREΔirp1-CpRE112自殺性質(zhì)粒,irp1及其上下游序列,包含Cmr本人構(gòu)建2.1.2主要試劑及儀器主要試劑及儀器,分別見表2-2和2-3。表2-2主要試劑Table2-2Mainreagents主要試劑Mainreagents生產(chǎn)廠家ManufacturerPrimerSTARMaxPremix(2X)寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司Taq酶、T4連接酶、內(nèi)切酶寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司氯霉素、氨芐西林粉末快速感受態(tài)細胞制備試劑盒(一步法)上海生工生物工程公司上海生工生物工程公司一站式DNA/RNA小量提取試劑盒上海生工生物工程公司UNIQ-10柱式微量瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒上海生工生物工程公司pEASY-T1CloningVector北京全式金公司
第二章大腸埃希菌缺失株E4Δirp1和回補株E4Δirp1-C的構(gòu)建和鑒定13物送去生物公司測序,將測序結(jié)果正確的質(zhì)粒命名為pREΔirp1。(4)缺失株Δirp1的篩選無痕缺失突變株篩選原理,如圖2-2,具體操作如下:A.含質(zhì)粒pREΔirp1的X7213與親本株E4共培養(yǎng)(單交換)取供體菌X7213100μL(含pREΔirp1)和受體菌大腸埃希菌E450μL,置于含500μL無菌LB液體的試管中(含DAP),37℃恒溫搖床過夜搖菌,涂布于含有50μg/mL氯霉素的LB固體平板上,37℃恒溫培養(yǎng)箱過夜培養(yǎng),次日挑取單菌落PCR進行鑒定。B.基因缺失株的篩選和鑒定(雙交換)PCR條帶大小和測序結(jié)果正確的即為陽性接合子,于無鹽LB液體(含10%蔗糖)中連續(xù)傳代3-5代,取最后一代菌液稀釋涂板,37℃恒溫培養(yǎng)箱過夜培養(yǎng),次日挑取單菌落進行PCR和測序鑒定,PCR條帶大小和測序結(jié)果都正確的菌株即為突變株,命名為E4Δirp1。圖2-2缺失株E4Δirp1構(gòu)建原理示意圖Figure2-2TheschematicdiagramofconstructingE4Δirp1deletionstrain2.2.6回補株E4Δirp1-C的構(gòu)建為了確定后續(xù)試驗得到的結(jié)果差異是由irp1基因的缺失所致,本試驗使用自殺性質(zhì)粒介導(dǎo)同源重組的方法構(gòu)建了缺失株E4Δirp1的回補株E4Δirp1-C。使用irp1-A-F和irp1-B-R作為上下游引物、E4基因組為模板進行擴增,可以得到約1953bp的片段,其中包括irp1基因及其上下游同源臂,將自殺性質(zhì)粒與所得片段連接轉(zhuǎn)化后,最后用兩步同源重組的方法即可得到回補株E4Δirp1-C,具體操作步驟詳見2.2.5(周秀娟2015)。2.3結(jié)果2.3.1基因敲除菌株的篩選14株大腸埃希菌(E1-E14)經(jīng)過氯霉素檢測和irp1基因的PCR篩選,菌株E1、
【參考文獻】:
期刊論文
[1]大腸桿菌的研究綜述[J]. 殷澤祿,萬虎. 甘肅畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[2]奶牛子宮內(nèi)膜炎研究進展[J]. 羅光建,王萍,李瑩杰,劉英. 今日畜牧獸醫(yī). 2019(02)
[3]PEC HPI irp2基因缺失株的構(gòu)建及蛋白結(jié)構(gòu)功能預(yù)測[J]. 劉超英,吳程華,高洪,嚴玉霖,富國文,趙汝. 中國獸藥雜志. 2018(02)
[4]大腸桿菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)2毒力島研究進展[J]. 尹磊,祁克宗,宋祥軍,涂健. 微生物學(xué)通報. 2017(12)
[5]豬腸外致病性大腸桿菌對氟喹諾酮類耐藥機制研究[J]. 王斌,袁定勝,李金良,李思聰,楊銳,張敏,李旭廷. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(07)
[6]奶牛子宮內(nèi)膜炎病因?qū)W研究進展[J]. 那立冬,王東升,董書偉,張世棟,閆寶琪,楊洪早,桑夢琪,嚴作廷. 動物醫(yī)學(xué)進展. 2016(09)
[7]大腸埃希菌強毒力島核心基因fyuA研究進展[J]. 王莊,張澤輝,劉耀川,張德顯,劉明春. 動物醫(yī)學(xué)進展. 2016(08)
[8]副溶血弧菌calR的基因敲除株與回補株構(gòu)建[J]. 侯書寧,孟彥言,朱文君,張凌宇,周冬生,張義全,黃新祥. 軍事醫(yī)學(xué). 2016(05)
[9]奶牛子宮內(nèi)膜炎診療研究進展[J]. 彭津津,雍康,張傳師. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(02)
[10]腸毒性大腸桿菌gspD基因敲除以及對LT毒素分泌的影響[J]. 魯曦,傅恩清,潘蕾,穆德廣,李王平,金發(fā)光. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(12)
博士論文
[1]我國北方地區(qū)犢牛腹瀉大腸桿菌HPI分子結(jié)構(gòu)組成及其菌蛻的研究[D]. 孫武文.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]沙門氏菌C1血清組特異基因功能分析[D]. 周秀娟.上海交通大學(xué) 2015
碩士論文
[1]克氏檸檬酸桿菌的生物學(xué)特性及其鞭毛素基因fliC的功能[D]. 王樂.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]大腸埃希菌生物被膜對抗生素和消毒劑藥效的影響[D]. 范玉堂.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[3]香樟精油對奶牛子宮內(nèi)膜炎大腸桿菌生物膜的抑制作用研究[D]. 付敬敬.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]K88ac+產(chǎn)腸毒素大腸桿菌強毒力島HPI缺失株的構(gòu)建及相關(guān)毒力功能探析[D]. 許綿.揚州大學(xué) 2017
[5]雞肉中大腸桿菌生物膜的污染情況及石榴皮單寧對大腸桿菌生物膜的干預(yù)作用[D]. 楊沁南.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[6]K88ac+大腸桿菌減毒株的構(gòu)建及其在小鼠體內(nèi)的初步應(yīng)用[D]. 余樹培.揚州大學(xué) 2016
[7]K88ac+產(chǎn)腸毒素大腸桿菌sRNA伴侶蛋白Hfq毒力相關(guān)功能的研究[D]. 胡會杰.揚州大學(xué) 2016
[8]豬源腸外致病性大腸桿菌六型分泌系統(tǒng)hcp基因缺失株的構(gòu)建及功能研究[D]. 彭穎.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[9]大腸桿菌毒力島HPI相關(guān)基因缺失株的研究[D]. 王晨娟.揚州大學(xué) 2012
[10]大腸桿菌O157:H7 O島缺失規(guī)律及O45島基因缺失對STX2表達的影響[D]. 李貝貝.山西醫(yī)科大學(xué) 2007
本文編號:3369903
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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FeDye3-y復(fù)合物結(jié)構(gòu)式(李葉芳,2012)
第二章大腸埃希菌缺失株E4Δirp1和回補株E4Δirp1-C的構(gòu)建和鑒定9圖2-1pRE112限制性圖譜(彭穎,2015)Figure2-1RestrictionmapofpRE112(pengying2015)本試驗所用菌株和質(zhì)粒如下表(表2-1)。表2-1本試驗所用菌株及質(zhì)粒列表Table2-1Strainsandplasmidsusedinthisexperiment菌株或質(zhì)粒Strainsorplasmids種類和基因型TypesandGenotypes來源Source菌株StrainsE4Amps,Cms實驗室分離Δirp1E4,irp1基因缺失本人構(gòu)建Δirp1-CΔirp1,irp1基因缺失后回補本人構(gòu)建X7213自殺性質(zhì)粒pRE112宿主菌,DAP-實驗室保存質(zhì)粒PlasmidspRE112pGP704自殺性質(zhì)粒,pir依賴,包含oriT,oriV,sacB,Cmr實驗室保存pREΔirp1pRE112自殺性質(zhì)粒和irp1上下游序列,包含Cmr本人構(gòu)建pEASY-T1克隆載體,包含Ampr,Kanr實驗室保存pREΔirp1-CpRE112自殺性質(zhì)粒,irp1及其上下游序列,包含Cmr本人構(gòu)建2.1.2主要試劑及儀器主要試劑及儀器,分別見表2-2和2-3。表2-2主要試劑Table2-2Mainreagents主要試劑Mainreagents生產(chǎn)廠家ManufacturerPrimerSTARMaxPremix(2X)寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司Taq酶、T4連接酶、內(nèi)切酶寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司氯霉素、氨芐西林粉末快速感受態(tài)細胞制備試劑盒(一步法)上海生工生物工程公司上海生工生物工程公司一站式DNA/RNA小量提取試劑盒上海生工生物工程公司UNIQ-10柱式微量瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒上海生工生物工程公司pEASY-T1CloningVector北京全式金公司
第二章大腸埃希菌缺失株E4Δirp1和回補株E4Δirp1-C的構(gòu)建和鑒定13物送去生物公司測序,將測序結(jié)果正確的質(zhì)粒命名為pREΔirp1。(4)缺失株Δirp1的篩選無痕缺失突變株篩選原理,如圖2-2,具體操作如下:A.含質(zhì)粒pREΔirp1的X7213與親本株E4共培養(yǎng)(單交換)取供體菌X7213100μL(含pREΔirp1)和受體菌大腸埃希菌E450μL,置于含500μL無菌LB液體的試管中(含DAP),37℃恒溫搖床過夜搖菌,涂布于含有50μg/mL氯霉素的LB固體平板上,37℃恒溫培養(yǎng)箱過夜培養(yǎng),次日挑取單菌落PCR進行鑒定。B.基因缺失株的篩選和鑒定(雙交換)PCR條帶大小和測序結(jié)果正確的即為陽性接合子,于無鹽LB液體(含10%蔗糖)中連續(xù)傳代3-5代,取最后一代菌液稀釋涂板,37℃恒溫培養(yǎng)箱過夜培養(yǎng),次日挑取單菌落進行PCR和測序鑒定,PCR條帶大小和測序結(jié)果都正確的菌株即為突變株,命名為E4Δirp1。圖2-2缺失株E4Δirp1構(gòu)建原理示意圖Figure2-2TheschematicdiagramofconstructingE4Δirp1deletionstrain2.2.6回補株E4Δirp1-C的構(gòu)建為了確定后續(xù)試驗得到的結(jié)果差異是由irp1基因的缺失所致,本試驗使用自殺性質(zhì)粒介導(dǎo)同源重組的方法構(gòu)建了缺失株E4Δirp1的回補株E4Δirp1-C。使用irp1-A-F和irp1-B-R作為上下游引物、E4基因組為模板進行擴增,可以得到約1953bp的片段,其中包括irp1基因及其上下游同源臂,將自殺性質(zhì)粒與所得片段連接轉(zhuǎn)化后,最后用兩步同源重組的方法即可得到回補株E4Δirp1-C,具體操作步驟詳見2.2.5(周秀娟2015)。2.3結(jié)果2.3.1基因敲除菌株的篩選14株大腸埃希菌(E1-E14)經(jīng)過氯霉素檢測和irp1基因的PCR篩選,菌株E1、
【參考文獻】:
期刊論文
[1]大腸桿菌的研究綜述[J]. 殷澤祿,萬虎. 甘肅畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[2]奶牛子宮內(nèi)膜炎研究進展[J]. 羅光建,王萍,李瑩杰,劉英. 今日畜牧獸醫(yī). 2019(02)
[3]PEC HPI irp2基因缺失株的構(gòu)建及蛋白結(jié)構(gòu)功能預(yù)測[J]. 劉超英,吳程華,高洪,嚴玉霖,富國文,趙汝. 中國獸藥雜志. 2018(02)
[4]大腸桿菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)2毒力島研究進展[J]. 尹磊,祁克宗,宋祥軍,涂健. 微生物學(xué)通報. 2017(12)
[5]豬腸外致病性大腸桿菌對氟喹諾酮類耐藥機制研究[J]. 王斌,袁定勝,李金良,李思聰,楊銳,張敏,李旭廷. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(07)
[6]奶牛子宮內(nèi)膜炎病因?qū)W研究進展[J]. 那立冬,王東升,董書偉,張世棟,閆寶琪,楊洪早,桑夢琪,嚴作廷. 動物醫(yī)學(xué)進展. 2016(09)
[7]大腸埃希菌強毒力島核心基因fyuA研究進展[J]. 王莊,張澤輝,劉耀川,張德顯,劉明春. 動物醫(yī)學(xué)進展. 2016(08)
[8]副溶血弧菌calR的基因敲除株與回補株構(gòu)建[J]. 侯書寧,孟彥言,朱文君,張凌宇,周冬生,張義全,黃新祥. 軍事醫(yī)學(xué). 2016(05)
[9]奶牛子宮內(nèi)膜炎診療研究進展[J]. 彭津津,雍康,張傳師. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(02)
[10]腸毒性大腸桿菌gspD基因敲除以及對LT毒素分泌的影響[J]. 魯曦,傅恩清,潘蕾,穆德廣,李王平,金發(fā)光. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(12)
博士論文
[1]我國北方地區(qū)犢牛腹瀉大腸桿菌HPI分子結(jié)構(gòu)組成及其菌蛻的研究[D]. 孫武文.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]沙門氏菌C1血清組特異基因功能分析[D]. 周秀娟.上海交通大學(xué) 2015
碩士論文
[1]克氏檸檬酸桿菌的生物學(xué)特性及其鞭毛素基因fliC的功能[D]. 王樂.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]大腸埃希菌生物被膜對抗生素和消毒劑藥效的影響[D]. 范玉堂.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[3]香樟精油對奶牛子宮內(nèi)膜炎大腸桿菌生物膜的抑制作用研究[D]. 付敬敬.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]K88ac+產(chǎn)腸毒素大腸桿菌強毒力島HPI缺失株的構(gòu)建及相關(guān)毒力功能探析[D]. 許綿.揚州大學(xué) 2017
[5]雞肉中大腸桿菌生物膜的污染情況及石榴皮單寧對大腸桿菌生物膜的干預(yù)作用[D]. 楊沁南.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[6]K88ac+大腸桿菌減毒株的構(gòu)建及其在小鼠體內(nèi)的初步應(yīng)用[D]. 余樹培.揚州大學(xué) 2016
[7]K88ac+產(chǎn)腸毒素大腸桿菌sRNA伴侶蛋白Hfq毒力相關(guān)功能的研究[D]. 胡會杰.揚州大學(xué) 2016
[8]豬源腸外致病性大腸桿菌六型分泌系統(tǒng)hcp基因缺失株的構(gòu)建及功能研究[D]. 彭穎.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[9]大腸桿菌毒力島HPI相關(guān)基因缺失株的研究[D]. 王晨娟.揚州大學(xué) 2012
[10]大腸桿菌O157:H7 O島缺失規(guī)律及O45島基因缺失對STX2表達的影響[D]. 李貝貝.山西醫(yī)科大學(xué) 2007
本文編號:3369903
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