F-box家族是植物中最大的蛋白家族之一,廣泛地參與了植物生長(zhǎng)發(fā)育、自交不親和、衰老及生物/非生物脅迫等多個(gè)生物學(xué)過程。在擬南芥、水稻等模式植物中,對(duì)F-box家族的認(rèn)識(shí)比較早,而且比較全面。但對(duì)于重要的糧食作物—小麥,F-box家族在其中的研究報(bào)道較少。一方面,由于F-box家族保守性差,給基因克隆和功能研究帶來(lái)困難,另一方面主要由于小麥基因組龐雜和多倍體的特性導(dǎo)致。因此,亟需對(duì)小麥中F-box家族開展系統(tǒng)的鑒定分析和功能研究�；诖�,本研究對(duì)小麥中F-box家族基因進(jìn)行了全基因組系統(tǒng)鑒定、分類、結(jié)構(gòu)解析、進(jìn)化關(guān)系和染色體分布等分析;通過dPCR研究了小麥中F-box家族基因的組織專化性表達(dá)模式及響應(yīng)非生物逆境的情況;以本實(shí)驗(yàn)室前期獲得的F-box基因TaFBL14和TaSKP2A為研究對(duì)象,探討了這2個(gè)基因在3種激素和2種非生物逆境處理下的表達(dá)模式;通過酵母文庫(kù)篩選和一對(duì)一回復(fù)驗(yàn)證獲得了一個(gè)與TaSKP2A存在相互作用的蛋白——幾丁質(zhì)酶。研究主要結(jié)果如下:1.在小麥基因組中鑒定了由406個(gè)基因編碼的1013個(gè)F-box蛋白;基于其C-末端結(jié)構(gòu)域?qū)⑿←淔-box蛋白分為12個(gè)亞家族;... 

【文章來(lái)源】：河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省

【文章頁(yè)數(shù)】：89 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

基于小麥中F-box結(jié)構(gòu)域生成的WebLogo每個(gè)堆棧的整體高度表示F-box結(jié)構(gòu)域在特定位置的序列保守性，而每個(gè)堆棧中字母的高度表示

表 2. MEME 預(yù)測(cè)小麥 F-box 蛋白家族 FBU 亞家族中的基序Table 2. Putative motifs predicted in wheat F-box proteins of FBU subfamily by MEMEMotifNo.E-value No. ofsequenceLengthof motifSequence1 5.0e-2423 513 26 LPDDLLLEILSRLPVKDAVRTSCLSR2 1.4e-1116 94 50 AFGGLTRLWLENLRFGESDIPNILSTCKRLESLRLYHZVEH3 1.1e-622 84 29 PEGCDLTWTMFILEAAPSLKELCITVWDH4 8.4e-617 193 21 SWRAJISDPAFRKRLPQTHPG5 4.6e-453 91 29 AQLSELEIVYGRFERVELKWLPKLTRLTF6 4.3e-445 62 23 ILSTRPPEITIRKLKIRFVLSPD7 1.7e-414 124 15 IADYVVCNPATREWV8 2.0e-528 100 29 ESJSIGKSVARAMATQKVDAAEFEILTEK9 3.0e-381 525 15 XLLANCPSLEKLTLI圖 2. 小麥中 F-box 蛋白的 C 末端結(jié)構(gòu)域分類Figure 2. Classification of F-box proteins in wheat based on C-terminal domains

.5 小麥 F-box 基因的染色體分布為了確定小麥 F-box 基因的基因組分布情況，從小麥 IWGSC 數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得了 體位置，并繪制了 406 個(gè)已鑒定的小麥 F-box 基因的染色體定位圖。從圖 4 可以的分布并不均勻，染色體 5B (40)、3B (39)、6A (36)、6D (30) 上 F-box 基因分布之下，3A、1D 和 3D 染色體中僅包含 8 個(gè) F-box 基因，所占比例最小 (2.0%)。、7D 染色體外，小麥 F-box 基因更多地分布在染色體長(zhǎng)臂上。由于小麥 IWGSC體上長(zhǎng)臂和短臂的基因定位情況并未精確劃分，我們無(wú)法精確定位該染色體上 圖 3.小麥 F-box 基因系統(tǒng)發(fā)育分析利用 ClustalX 2.1 對(duì)全長(zhǎng)的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)，利用 MEGA7 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育 (NJ) 樹。F-box 蛋白分為 7 個(gè)不同的亞支（A-G）。Figure 3. Phylogenetic analysis of F-box genes in wheatThe full-length amino acid sequences were aligned by ClustalX 2.1 and the Neighbour Joining(NJ) tree was constructed using MEGA7. F-box proteins grouped into 7 distinct clades（A-G）.

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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