miR-107在柯薩奇B3病毒復(fù)制過(guò)程中的調(diào)控作用
發(fā)布時(shí)間:2021-08-24 16:40
目的:通過(guò)研究miR-107在CVB3感染Hela細(xì)胞過(guò)程中的表達(dá)差異,探索其對(duì)CVB3復(fù)制的調(diào)控作用及機(jī)制,旨為CVB3感染相關(guān)疾病的臨床診斷提供新的理論依據(jù)和新型生物標(biāo)志物。方法:1.篩選出CVB3感染相關(guān)的miRNA;采用RT-qPCR方法確定miR-107的差異表達(dá)情況。2.在Hela細(xì)胞中過(guò)表達(dá)或沉默miR-107后感染CVB3,通過(guò)RT-qPCR方法檢測(cè)轉(zhuǎn)染效率,并收集感染至6h的總蛋白;Western blot檢測(cè)病毒衣殼蛋白VP1的表達(dá),分析miR-107對(duì)CVB3復(fù)制增殖的影響;收集上清液進(jìn)行病毒蝕斑實(shí)驗(yàn),分析miR-107對(duì)CVB3釋放的影響。3.通過(guò)TargetScan和miRTarBase數(shù)據(jù)庫(kù)篩選出miR-107的靶基因KLF4和BACE1,采用熒光素酶報(bào)告載體實(shí)驗(yàn)進(jìn)行靶點(diǎn)驗(yàn)證。4.Hela細(xì)胞過(guò)表達(dá)或沉默靶基因后感染CVB3并收集感染6h的總RNA和總蛋白,RT-qPCR和Western blot分析靶基因的表達(dá)變化,以及靶基因?qū)VB3復(fù)制增殖的影響;同時(shí)收集上清液進(jìn)行病毒蝕斑實(shí)驗(yàn),分析靶基因?qū)Σ《綜VB3釋放的影響。5.Hela細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)染miR-107的...
【文章來(lái)源】:江蘇大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
技術(shù)路線圖
江蘇大學(xué)碩士學(xué)位論文15上孵育1h后洗滌,1×TBS/TBuffer洗膜3次,每次洗滌20min。(8)顯色與分析:將在南京諾唯贊生物科技有限公司購(gòu)買(mǎi)的HRP-ECL曝光液的A、B液按照等比例混合,滴加于PVDF膜的蛋白面后使用化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)拍照分析、留存圖像,便于后續(xù)分析統(tǒng)計(jì)結(jié)果。2.2.7結(jié)果統(tǒng)計(jì)與數(shù)據(jù)處理本實(shí)驗(yàn)結(jié)果使用ImagineJ軟件進(jìn)行灰度掃描,采用GraphPadPrism7軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,數(shù)據(jù)以X±SD表示,組間差異比較采用雙側(cè)T檢驗(yàn),P<0.05為具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。2.3實(shí)驗(yàn)結(jié)果2.3.1CVB3在Hela細(xì)胞內(nèi)的復(fù)制情況由Westernblot實(shí)驗(yàn)結(jié)果可見(jiàn),Hela細(xì)胞感染CVB34h后,VP1蛋白的表達(dá)可被實(shí)驗(yàn)檢出,在6h、8h表達(dá)水平顯著升高,依據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果且避免臨界效應(yīng),我們后續(xù)將選擇中間時(shí)間點(diǎn)6h進(jìn)行實(shí)驗(yàn)(圖2.1)(**P<0.01,***P<0.001)。圖2.1CVB3在hela細(xì)胞中的復(fù)制情況A.Hela細(xì)胞中CVB3感染不同時(shí)間點(diǎn)VP1的表達(dá)情況B.VP1灰度掃描Fig2.1CVB3replicationinhelacellsA.ExpressionofVP1atdifferenttimepointsinCVB3infectedHelaB.VP1grayscalescanresults2.3.2CVB3對(duì)miR-107表達(dá)的影響當(dāng)六孔板內(nèi)細(xì)胞融合度達(dá)到80-90%時(shí),實(shí)驗(yàn)組每孔加入10MOICVB3感染細(xì)胞,分別收取2h、4h、6h和未感染的Hela細(xì)胞,提取細(xì)胞總RNA,進(jìn)行熒光定量PCR(RT-qPCR)實(shí)驗(yàn),以U6作為內(nèi)參基因,檢測(cè)CVB3感染后miR-107表達(dá)量的變化。由RT-qPCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果可見(jiàn),Hela細(xì)胞感染CVB3后,miR-107的表達(dá)呈現(xiàn)逐步上升的趨勢(shì),在6h表達(dá)水平顯著升高,且有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(**P<0.01)。
miR-107在柯薩奇B3病毒復(fù)制過(guò)程中的調(diào)控作用16圖2.2Hela細(xì)胞感染CVB3后不同時(shí)間點(diǎn)miR-107的表達(dá)情況Fig2.2ExpressionofmiR-107atdifferenttimepointsinCVB3infectedHela2.3.3miR-107對(duì)CVB3復(fù)制增殖的影響為了探討miR-107對(duì)CVB3復(fù)制增殖的影響,我們采用脂質(zhì)體瞬時(shí)轉(zhuǎn)染技術(shù),在Hela細(xì)胞內(nèi)過(guò)表達(dá)或敲減miR-107。通過(guò)RT-qPCR實(shí)驗(yàn)確定轉(zhuǎn)染效果后(圖2.3),由Westernblot實(shí)驗(yàn)檢測(cè)發(fā)現(xiàn):miR-107過(guò)表達(dá)時(shí),CVB3衣殼蛋白VP1的表達(dá)升高(圖2.4)。與之相反的是,敲減miR-107抑制了VP1的表達(dá)(圖2.5)(*P<0.05,***P<0.001,****P<0.0001)。圖2.3RT-qPCR檢測(cè)miR-107過(guò)表達(dá)和敲減效率A.RT-qPCR檢測(cè)mimics-107的轉(zhuǎn)染效率B.RT-qPCR檢測(cè)107-inhibitor的轉(zhuǎn)染效率Fig2.3RT-qPCRtodetecttheefficiencyofmimics-107and107-inhibitorA.RT-qPCRtodetectthetransfectionefficiencyofmimics-107B.RT-qPCRtodetectthetransfectionefficiencyof107-inhibitor
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]漢黃芩苷對(duì)柯薩奇B3病毒誘導(dǎo)的病毒性心肌炎小鼠炎癥反應(yīng)的影響[J]. 石哲瑋,劉勝新,詹嘉琛,金佳麗,陳瑩瑩,秦鋮璠,錢(qián)彩珍. 中國(guó)病理生理雜志. 2020(03)
[2]LncRNA TUG1通過(guò)調(diào)控miR-196b-5p調(diào)控卵巢癌細(xì)胞凋亡和放射敏感性分子作用機(jī)制[J]. 趙國(guó)立,張海金,陳鑒. 中國(guó)婦幼保健. 2020(04)
[3]Resolvin D2通過(guò)抑制NF-κB通路減輕病毒性心肌炎小鼠炎癥反應(yīng)的研究[J]. 石哲瑋,劉勝新,張銀宇,丁可軍,秦鋮璠,陳瑩瑩,錢(qián)彩珍. 心電與循環(huán). 2020(01)
[4]LncRNA HEIH通過(guò)miR-98-5p調(diào)節(jié)肺癌細(xì)胞增殖和凋亡[J]. 蔣慶鋒,于永魁,程金華,申思寧,邢文群. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2020(01)
[5]長(zhǎng)鏈非編碼RNA在鼻咽癌中的研究進(jìn)展[J]. 劉秋燕,熊偉,李程,王巧麗. 中國(guó)醫(yī)藥. 2020(01)
[6]lncRNA在乙腦病毒感染PK15細(xì)胞過(guò)程中的作用研究[J]. 杜程濤,汪涵,楊松柏,李向臣,周曉龍,趙阿勇. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(07)
[7]LncRNA-NONMMUT131476.1對(duì)PHEV復(fù)制的影響及其靶基因Nlrc5的驗(yàn)證[J]. 姜景夫,蘭云剛,李姿,張競(jìng),關(guān)繼羽,趙魁,高豐,賀文琦,宋德光. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(04)
[8]NF-κB亞基泛素化研究進(jìn)展[J]. 孫婷,陳泉,肖繼,王德明. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2018(03)
[9]藻酸雙脂鈉抑制巨細(xì)胞病毒誘導(dǎo)小鼠β分泌酶表達(dá)的研究(英文)[J]. 杜宇,李嬌,孫延龍,陳永,李文通,阮極盟,張曼,劉志軍. 中國(guó)海洋藥物. 2017(06)
[10]萊菔硫烷對(duì)鼻咽癌細(xì)胞中Klf4表達(dá)及侵襲遷移能力的影響[J]. 李錫清,趙尊蘭,劉冬玲,劉明月,馬寧,周云. 中華實(shí)用診斷與治療雜志. 2017(08)
博士論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA SPRY4-IT1作為miR-101-3p分子海綿上調(diào)EZH2的表達(dá)促進(jìn)膀胱癌的增殖和轉(zhuǎn)移[D]. 劉東.華中科技大學(xué) 2017
碩士論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA HCP5通過(guò)微小RNA的吸附作用促進(jìn)甲狀腺濾泡癌的進(jìn)程[D]. 梁磊磊.大連醫(yī)科大學(xué) 2018
本文編號(hào):3360348
【文章來(lái)源】:江蘇大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
技術(shù)路線圖
江蘇大學(xué)碩士學(xué)位論文15上孵育1h后洗滌,1×TBS/TBuffer洗膜3次,每次洗滌20min。(8)顯色與分析:將在南京諾唯贊生物科技有限公司購(gòu)買(mǎi)的HRP-ECL曝光液的A、B液按照等比例混合,滴加于PVDF膜的蛋白面后使用化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)拍照分析、留存圖像,便于后續(xù)分析統(tǒng)計(jì)結(jié)果。2.2.7結(jié)果統(tǒng)計(jì)與數(shù)據(jù)處理本實(shí)驗(yàn)結(jié)果使用ImagineJ軟件進(jìn)行灰度掃描,采用GraphPadPrism7軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,數(shù)據(jù)以X±SD表示,組間差異比較采用雙側(cè)T檢驗(yàn),P<0.05為具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。2.3實(shí)驗(yàn)結(jié)果2.3.1CVB3在Hela細(xì)胞內(nèi)的復(fù)制情況由Westernblot實(shí)驗(yàn)結(jié)果可見(jiàn),Hela細(xì)胞感染CVB34h后,VP1蛋白的表達(dá)可被實(shí)驗(yàn)檢出,在6h、8h表達(dá)水平顯著升高,依據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果且避免臨界效應(yīng),我們后續(xù)將選擇中間時(shí)間點(diǎn)6h進(jìn)行實(shí)驗(yàn)(圖2.1)(**P<0.01,***P<0.001)。圖2.1CVB3在hela細(xì)胞中的復(fù)制情況A.Hela細(xì)胞中CVB3感染不同時(shí)間點(diǎn)VP1的表達(dá)情況B.VP1灰度掃描Fig2.1CVB3replicationinhelacellsA.ExpressionofVP1atdifferenttimepointsinCVB3infectedHelaB.VP1grayscalescanresults2.3.2CVB3對(duì)miR-107表達(dá)的影響當(dāng)六孔板內(nèi)細(xì)胞融合度達(dá)到80-90%時(shí),實(shí)驗(yàn)組每孔加入10MOICVB3感染細(xì)胞,分別收取2h、4h、6h和未感染的Hela細(xì)胞,提取細(xì)胞總RNA,進(jìn)行熒光定量PCR(RT-qPCR)實(shí)驗(yàn),以U6作為內(nèi)參基因,檢測(cè)CVB3感染后miR-107表達(dá)量的變化。由RT-qPCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果可見(jiàn),Hela細(xì)胞感染CVB3后,miR-107的表達(dá)呈現(xiàn)逐步上升的趨勢(shì),在6h表達(dá)水平顯著升高,且有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(**P<0.01)。
miR-107在柯薩奇B3病毒復(fù)制過(guò)程中的調(diào)控作用16圖2.2Hela細(xì)胞感染CVB3后不同時(shí)間點(diǎn)miR-107的表達(dá)情況Fig2.2ExpressionofmiR-107atdifferenttimepointsinCVB3infectedHela2.3.3miR-107對(duì)CVB3復(fù)制增殖的影響為了探討miR-107對(duì)CVB3復(fù)制增殖的影響,我們采用脂質(zhì)體瞬時(shí)轉(zhuǎn)染技術(shù),在Hela細(xì)胞內(nèi)過(guò)表達(dá)或敲減miR-107。通過(guò)RT-qPCR實(shí)驗(yàn)確定轉(zhuǎn)染效果后(圖2.3),由Westernblot實(shí)驗(yàn)檢測(cè)發(fā)現(xiàn):miR-107過(guò)表達(dá)時(shí),CVB3衣殼蛋白VP1的表達(dá)升高(圖2.4)。與之相反的是,敲減miR-107抑制了VP1的表達(dá)(圖2.5)(*P<0.05,***P<0.001,****P<0.0001)。圖2.3RT-qPCR檢測(cè)miR-107過(guò)表達(dá)和敲減效率A.RT-qPCR檢測(cè)mimics-107的轉(zhuǎn)染效率B.RT-qPCR檢測(cè)107-inhibitor的轉(zhuǎn)染效率Fig2.3RT-qPCRtodetecttheefficiencyofmimics-107and107-inhibitorA.RT-qPCRtodetectthetransfectionefficiencyofmimics-107B.RT-qPCRtodetectthetransfectionefficiencyof107-inhibitor
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]漢黃芩苷對(duì)柯薩奇B3病毒誘導(dǎo)的病毒性心肌炎小鼠炎癥反應(yīng)的影響[J]. 石哲瑋,劉勝新,詹嘉琛,金佳麗,陳瑩瑩,秦鋮璠,錢(qián)彩珍. 中國(guó)病理生理雜志. 2020(03)
[2]LncRNA TUG1通過(guò)調(diào)控miR-196b-5p調(diào)控卵巢癌細(xì)胞凋亡和放射敏感性分子作用機(jī)制[J]. 趙國(guó)立,張海金,陳鑒. 中國(guó)婦幼保健. 2020(04)
[3]Resolvin D2通過(guò)抑制NF-κB通路減輕病毒性心肌炎小鼠炎癥反應(yīng)的研究[J]. 石哲瑋,劉勝新,張銀宇,丁可軍,秦鋮璠,陳瑩瑩,錢(qián)彩珍. 心電與循環(huán). 2020(01)
[4]LncRNA HEIH通過(guò)miR-98-5p調(diào)節(jié)肺癌細(xì)胞增殖和凋亡[J]. 蔣慶鋒,于永魁,程金華,申思寧,邢文群. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2020(01)
[5]長(zhǎng)鏈非編碼RNA在鼻咽癌中的研究進(jìn)展[J]. 劉秋燕,熊偉,李程,王巧麗. 中國(guó)醫(yī)藥. 2020(01)
[6]lncRNA在乙腦病毒感染PK15細(xì)胞過(guò)程中的作用研究[J]. 杜程濤,汪涵,楊松柏,李向臣,周曉龍,趙阿勇. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(07)
[7]LncRNA-NONMMUT131476.1對(duì)PHEV復(fù)制的影響及其靶基因Nlrc5的驗(yàn)證[J]. 姜景夫,蘭云剛,李姿,張競(jìng),關(guān)繼羽,趙魁,高豐,賀文琦,宋德光. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(04)
[8]NF-κB亞基泛素化研究進(jìn)展[J]. 孫婷,陳泉,肖繼,王德明. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2018(03)
[9]藻酸雙脂鈉抑制巨細(xì)胞病毒誘導(dǎo)小鼠β分泌酶表達(dá)的研究(英文)[J]. 杜宇,李嬌,孫延龍,陳永,李文通,阮極盟,張曼,劉志軍. 中國(guó)海洋藥物. 2017(06)
[10]萊菔硫烷對(duì)鼻咽癌細(xì)胞中Klf4表達(dá)及侵襲遷移能力的影響[J]. 李錫清,趙尊蘭,劉冬玲,劉明月,馬寧,周云. 中華實(shí)用診斷與治療雜志. 2017(08)
博士論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA SPRY4-IT1作為miR-101-3p分子海綿上調(diào)EZH2的表達(dá)促進(jìn)膀胱癌的增殖和轉(zhuǎn)移[D]. 劉東.華中科技大學(xué) 2017
碩士論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA HCP5通過(guò)微小RNA的吸附作用促進(jìn)甲狀腺濾泡癌的進(jìn)程[D]. 梁磊磊.大連醫(yī)科大學(xué) 2018
本文編號(hào):3360348
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3360348.html
最近更新
教材專著