鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子（zinc-finger protein transcription factor, ZFP）是一種具有特定結(jié)構(gòu)的蛋白,是真核生物重要轉(zhuǎn)錄因子之一,其通過與核內(nèi)其他因子相互作用,調(diào)控各種生理反應(yīng),參與植物的生長發(fā)育和生物與非生物脅迫。目前對木薯鋅指蛋白家族的研究依然較少。本研究利用木薯基因組數(shù)據(jù)庫篩選鑒定了85個(gè)木薯C2H2型鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子家族成員,利用生物信息學(xué)手段分析該家族基因的結(jié)構(gòu)特征和理化性質(zhì),結(jié)果表明同一C2H2型鋅指蛋白家族的基因結(jié)構(gòu)及氨基酸序列長度存在顯著差異,大致可分為6個(gè)亞家族,各成員具有特征性的鋅指結(jié)構(gòu)域,但數(shù)量上存在差異;染色體定位顯示該家族成員并非定位于木薯所有的18條染色體,在13號和16號染色體上沒有C2H2型鋅指蛋白家族成員定位。結(jié)合已有的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析其在不同組織及非生物脅迫下的表達(dá)模式,發(fā)現(xiàn)各成員在不同組織中的表達(dá)模式不同,各組織均有高表達(dá)的基因,部分成員無組織表達(dá)差異,部分家族成員響應(yīng)非生物脅迫。因此,木薯C2H2型鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子在植物生長發(fā)育和響應(yīng)非生物脅迫功能方面具有重要的作用。 

【文章來源】：植物生理學(xué)報(bào). 2020,56(12)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：13 頁

【部分圖文】：

木薯C2H2型鋅指蛋白家族10種編碼蛋白基序的結(jié)構(gòu)

圖3 C2H2型鋅指蛋白家族系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹綜上,本研究篩選鑒定了85個(gè)C2H2型鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子,定位在16條染色體上。C末端保守的氨基酸序列是典型的鋅指結(jié)構(gòu)域,除此之外,可根據(jù)不同的結(jié)構(gòu)域?qū)⑵浞譃?類。C2H2型鋅指蛋白家族的成員具有組織特異性,部分成員的表達(dá)受非生物脅迫的影響且存在品種差異。這些結(jié)果可以讓我們更加了解木薯C2H2型鋅指蛋白家族的結(jié)構(gòu)特征和表達(dá)模式,為之后進(jìn)一步研究C2H2型鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子在木薯生長、發(fā)育及非生物脅迫中的作用機(jī)制提供可用信息。

綜上,本研究篩選鑒定了85個(gè)C2H2型鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子,定位在16條染色體上。C末端保守的氨基酸序列是典型的鋅指結(jié)構(gòu)域,除此之外,可根據(jù)不同的結(jié)構(gòu)域?qū)⑵浞譃?類。C2H2型鋅指蛋白家族的成員具有組織特異性,部分成員的表達(dá)受非生物脅迫的影響且存在品種差異。這些結(jié)果可以讓我們更加了解木薯C2H2型鋅指蛋白家族的結(jié)構(gòu)特征和表達(dá)模式,為之后進(jìn)一步研究C2H2型鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子在木薯生長、發(fā)育及非生物脅迫中的作用機(jī)制提供可用信息。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]木薯NOX基因家族成員的生物信息學(xué)及其表達(dá)分析[J]. 胡廣,梁大成.  南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(10)
[2]木薯品種新選048耐旱生理特性研究[J]. 羅興錄,韋婉羚,單忠英,樊吳靜.  熱帶作物學(xué)報(bào). 2016(03)
[3]高溫逆境下植物葉片衰老機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 楊小飛,郭房慶.  植物生理學(xué)報(bào). 2014(09)
[4]干旱脅迫對苗期木薯內(nèi)源激素含量的影響[J]. 周芳,劉恩世,趙平娟,王文泉,彭明.  干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2013(05)



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