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紅花檵木兩個(gè)查爾酮合成酶的克隆及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-08-11 18:44
  為了研究紅花檵木花青苷生物合成的分子機(jī)制,克隆了紅花檵木兩個(gè)查爾酮合成酶LcCHSs基因,并對(duì)克隆的兩個(gè)基因進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。利用RT-PCR技術(shù),克隆得到紅花檵木LcCHS1和LcCHS2基因,其中LcCHS1的開放閱讀框(ORF)為1 170 bp,編碼389個(gè)氨基酸,LcCHS2的ORF為1 182 bp,編碼393個(gè)氨基酸。兩個(gè)LcCHSs的氨基酸序列與來源于茶樹(Camellia sinensis)、葡萄(Vitis vinifera)、擬南芥(Arabidopsis thaliana)、煙草(Nicotiana tabacum)等植物CHSs的氨基酸序列一致性超過83%,且兩個(gè)LcCHSs的氨基酸序列中參與CHS酶類催化的3個(gè)殘基(Cys164、His303和Asn336)和兩段CHS酶類重要序列("RLMMYQQGCFAGGTVLR"和"GVLFGFGPGL")均嚴(yán)格保守,表明CHS在進(jìn)化功能上的保守性。三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)表明兩個(gè)LcCHSs都能形成同源二聚體,且兩個(gè)LcCHSs蛋白的空間結(jié)構(gòu)非常相似。 

【文章來源】:湖南工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,34(06)

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

紅花檵木兩個(gè)查爾酮合成酶的克隆及生物信息學(xué)分析


LcCHS1和LcCHS2基因的PCR擴(kuò)增圖

氨基酸序列,基因,核苷酸序列,氨基酸序列


LcCHSs基因的核苷酸序列及其推導(dǎo)氨基酸序列

氨基酸序列,基因,核苷酸序列,氨基酸序列


圖2 LcCHSs基因的核苷酸序列及其推導(dǎo)氨基酸序列對(duì)LcCHS1和LcCHS2基因的ORFs序列進(jìn)行分析表明,LcCHS1的ORF全長為1 170 bp,編碼389個(gè)氨基酸(圖2a);LcCHS2的ORF全長為1 182 bp,編碼393個(gè)氨基酸(圖2b)。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3336691

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