紅花檵木兩個(gè)查爾酮合成酶的克隆及生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-08-11 18:44
為了研究紅花檵木花青苷生物合成的分子機(jī)制,克隆了紅花檵木兩個(gè)查爾酮合成酶LcCHSs基因,并對(duì)克隆的兩個(gè)基因進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。利用RT-PCR技術(shù),克隆得到紅花檵木LcCHS1和LcCHS2基因,其中LcCHS1的開放閱讀框(ORF)為1 170 bp,編碼389個(gè)氨基酸,LcCHS2的ORF為1 182 bp,編碼393個(gè)氨基酸。兩個(gè)LcCHSs的氨基酸序列與來源于茶樹(Camellia sinensis)、葡萄(Vitis vinifera)、擬南芥(Arabidopsis thaliana)、煙草(Nicotiana tabacum)等植物CHSs的氨基酸序列一致性超過83%,且兩個(gè)LcCHSs的氨基酸序列中參與CHS酶類催化的3個(gè)殘基(Cys164、His303和Asn336)和兩段CHS酶類重要序列("RLMMYQQGCFAGGTVLR"和"GVLFGFGPGL")均嚴(yán)格保守,表明CHS在進(jìn)化功能上的保守性。三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)表明兩個(gè)LcCHSs都能形成同源二聚體,且兩個(gè)LcCHSs蛋白的空間結(jié)構(gòu)非常相似。
【文章來源】:湖南工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,34(06)
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
LcCHS1和LcCHS2基因的PCR擴(kuò)增圖
LcCHSs基因的核苷酸序列及其推導(dǎo)氨基酸序列
圖2 LcCHSs基因的核苷酸序列及其推導(dǎo)氨基酸序列對(duì)LcCHS1和LcCHS2基因的ORFs序列進(jìn)行分析表明,LcCHS1的ORF全長(zhǎng)為1 170 bp,編碼389個(gè)氨基酸(圖2a);LcCHS2的ORF全長(zhǎng)為1 182 bp,編碼393個(gè)氨基酸(圖2b)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]人參查爾酮合成酶基因PgCHS1的克隆與表達(dá)分析[J]. 張變玲,黃雪梅,劉心怡,謝彪,黃合慶,張儒. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2018(12)
[2]草地早熟禾查爾酮合成酶基因PpCHS1克隆、功能與表達(dá)分析[J]. 何春艷,甘露,閆蒙舉,張?zhí)m,蘇浩天,尹淑霞. 中國草地學(xué)報(bào). 2018(04)
[3]苦蘵查爾酮合成酶編碼基因(PaCHS1)的克隆及表達(dá)譜分析[J]. 朱宇佳,郭宏,孫濤,盧江杰,馮尚國,展曉日,應(yīng)奇才,孟一君,沈晨佳,王慧中. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(05)
[4]向日葵查爾酮合酶HaCHS基因的克隆與逆境應(yīng)答[J]. 馬立功,張勻華,孟慶林,石鳳梅,劉佳,李易初,王志英. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2016(01)
[5]紅花檵木CHS基因的克隆與序列分析[J]. 許威,于曉英,陳己任,符紅艷,胡博文,陳彥斌,李達(dá). 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2013(01)
[6]湖南檵木屬植物的園林應(yīng)用現(xiàn)狀調(diào)查與分析[J]. 彭閏珉,于曉英. 天津農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(06)
[7]紅木資源調(diào)查研究[J]. 黃瑞康,楊金桂,賀中華,李繼承,劉源清. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 1998(04)
本文編號(hào):3336691
【文章來源】:湖南工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,34(06)
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
LcCHS1和LcCHS2基因的PCR擴(kuò)增圖
LcCHSs基因的核苷酸序列及其推導(dǎo)氨基酸序列
圖2 LcCHSs基因的核苷酸序列及其推導(dǎo)氨基酸序列對(duì)LcCHS1和LcCHS2基因的ORFs序列進(jìn)行分析表明,LcCHS1的ORF全長(zhǎng)為1 170 bp,編碼389個(gè)氨基酸(圖2a);LcCHS2的ORF全長(zhǎng)為1 182 bp,編碼393個(gè)氨基酸(圖2b)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]人參查爾酮合成酶基因PgCHS1的克隆與表達(dá)分析[J]. 張變玲,黃雪梅,劉心怡,謝彪,黃合慶,張儒. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2018(12)
[2]草地早熟禾查爾酮合成酶基因PpCHS1克隆、功能與表達(dá)分析[J]. 何春艷,甘露,閆蒙舉,張?zhí)m,蘇浩天,尹淑霞. 中國草地學(xué)報(bào). 2018(04)
[3]苦蘵查爾酮合成酶編碼基因(PaCHS1)的克隆及表達(dá)譜分析[J]. 朱宇佳,郭宏,孫濤,盧江杰,馮尚國,展曉日,應(yīng)奇才,孟一君,沈晨佳,王慧中. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(05)
[4]向日葵查爾酮合酶HaCHS基因的克隆與逆境應(yīng)答[J]. 馬立功,張勻華,孟慶林,石鳳梅,劉佳,李易初,王志英. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2016(01)
[5]紅花檵木CHS基因的克隆與序列分析[J]. 許威,于曉英,陳己任,符紅艷,胡博文,陳彥斌,李達(dá). 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2013(01)
[6]湖南檵木屬植物的園林應(yīng)用現(xiàn)狀調(diào)查與分析[J]. 彭閏珉,于曉英. 天津農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(06)
[7]紅木資源調(diào)查研究[J]. 黃瑞康,楊金桂,賀中華,李繼承,劉源清. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 1998(04)
本文編號(hào):3336691
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