廣西野鳥(niǎo)源H9亞型禽流感病毒分離鑒定和全基因組測(cè)序分析及二重RT-LAMP檢測(cè)方法的建立
發(fā)布時(shí)間:2021-08-11 05:25
禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)屬于正粘病毒科,A型流感病毒屬。H9亞型AIV感染通常會(huì)使家禽表現(xiàn)出產(chǎn)蛋量下降、生長(zhǎng)緩慢及呼吸道癥狀,嚴(yán)重危害家禽產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展。該亞型病毒不僅能感染家禽和鳥(niǎo)類(lèi),也能直接感染人類(lèi),還能為新的感染人的重組病毒如H5N6、H7N9、和H10N8等提供部分或全部?jī)?nèi)部基因,嚴(yán)重危害人類(lèi)公共衛(wèi)生安全。廣西地理位置特殊,加強(qiáng)該地區(qū)H9亞型AIV生態(tài)進(jìn)化的研究對(duì)禽流感的有效防控具有重要意義為了解廣西地區(qū)野鳥(niǎo)源H9亞型AIV遺傳進(jìn)化情況,本研究對(duì)2017-2019年間從不同活禽市場(chǎng)采集的斑鳩、鴿子和山雞等野鳥(niǎo)咽喉和泄殖腔拭子進(jìn)行病毒分離和純化,用RT-PCR方法擴(kuò)增分離株全基因并克隆測(cè)序,同時(shí)對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果表明成功分離鑒定出15株H9亞型AIV,均符合低致病性禽流感的分子特征,遺傳進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)其全基因來(lái)源較為復(fù)雜,一共出現(xiàn)3種不同的基因組合形式。為了建立快速檢測(cè)不同亞型禽流感病毒方法,本研究利用環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)檢測(cè)方法快速、敏感和...
【文章來(lái)源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:74 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
禽流感病毒結(jié)構(gòu)圖
廣西大學(xué)獸醫(yī)碩士學(xué)位論文廣西野鳥(niǎo)源H9亞型禽流感病毒分離鑒定和全基因組測(cè)序分析及二重RT-LAMP檢測(cè)方法的建立162.3.3.2小鼠致病性試驗(yàn)2.3.3.2.1小鼠感染病毒后體重變化情況攻毒后14d內(nèi)小鼠未出現(xiàn)任何臨床癥狀,體重?zé)o明顯變化(表2-3)表2-3小鼠感染病毒后體重變化情況Table2-3Weightchangeofmiceafterinoculatedwithvirus2.3.3.2.2小鼠組織病毒滴度小鼠感染72h后有8株分離株可以在小鼠的鼻甲骨和肺中有效復(fù)制,有4株分離株僅在小鼠的鼻甲骨中有效復(fù)制,有3株分離株無(wú)法在小鼠體內(nèi)復(fù)制,小鼠組織病毒滴度結(jié)果見(jiàn)圖2-1。圖2-1接種72h后小鼠組織病毒滴定結(jié)果Fig2-1Virustiterinmousetissueson72hourspostinoculation序號(hào)Numbers毒株Virus小鼠平均體重Averageweightofmice(g)1d2d3d4d5d6d7d8d9d10d11d12d13d14d1PH/GX/208B1/1725.425.625.725.425.625.926.226.426.526.326.626.426.626.82DV/GX/279B/1924.825.626.224.424.324.724.924.824.724.925.125.325.225.43QL/GX/241B9/1826.626.326.126.426.726.926.826.927.127.227.027.327.227.44PH/GX/222B7/1825.725.825.725.925.826.026.226.126.326.226.426.326.526.55TD/GX/220B14/1826.226.326.426.326.326.426.626.726.626.826.726.827.027.16DV/GX/211B17/1726.025.925.725.826.126.126.226.326.526.426.426.526.626.67QL/GX/241B5/1825.125.125.325.425.625.425.424.525.625.525.625.725.625.78PH/GX/249B2/1825.525.625.625.825.725.725.925.825.825.926.126.126.326.39PA/GX/264B5/1926.526.626.826.526.727.027.427.527.727.527.827.628.028.110TD/GX/191B5/1728.628.928.628.829.229.429.029.329.629.830.030.330.730.411DV/GX/191B6/1727.728.128.528.
廣西大學(xué)獸醫(yī)碩士學(xué)位論文廣西野鳥(niǎo)源H9亞型禽流感病毒分離鑒定和全基因組測(cè)序分析及二重RT-LAMP檢測(cè)方法的建立22圖3-1HA基因遺傳進(jìn)化樹(shù)(1)Fig3-1PhylogenictreeofHAgene分析15株野鳥(niǎo)源分離株HA基因氨基酸序列結(jié)果表明分離株QL/GX/241B9/18、PH/GX/208B/17和DV/GX/279B19/19的受體結(jié)合位點(diǎn)左側(cè)壁第234位和236位為Q和G,具有這種HA氨基酸序列特點(diǎn)的AIV可以識(shí)別并結(jié)合禽類(lèi)細(xì)胞表面唾液酸受體SAa2,3Gal,其余12株分離株氨基酸序列在第234位和236位分別為L(zhǎng)和G,具有這種HA氨基酸序列特點(diǎn)的AIV可以識(shí)別并結(jié)合禽類(lèi)和人類(lèi)兩種細(xì)胞表面唾液酸受體SAa2,3Gal和SAa2,6Gal,15株分離株HA基因裂解位點(diǎn)均無(wú)多個(gè)堿性氨基酸插入,符合LPAIV特征[80],受體結(jié)合位點(diǎn)右側(cè)壁第149位氨基酸變化較大,其余受體結(jié)合位點(diǎn)均比較保守。(1)◆標(biāo)記的毒株為本研究分離株,▼標(biāo)記的毒株為代表毒株,◇標(biāo)記的毒株為本實(shí)驗(yàn)室其它H9亞型AIV分離株
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2017年國(guó)內(nèi)大型雞場(chǎng)分離的H9N2禽流感病毒的遺傳進(jìn)化和分子特征分析[J]. 孫王楊吉,朱睿,張建軍,石火英. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(08)
[2]廣東省深圳市首例孕婦感染H9N2禽流感病例流行病學(xué)調(diào)查[J]. 劉峰,李剛,劉鳳仁,俞國(guó)龍. 疾病監(jiān)測(cè). 2019(07)
[3]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)在病原微生物快速檢測(cè)中的研究進(jìn)展[J]. 楊靖,胡姣姣,柏先澤,王遠(yuǎn)亮,謝康莊. 食品安全質(zhì)量檢測(cè)學(xué)報(bào). 2018(23)
[4]H10亞型禽流感病毒RT-LAMP可視化檢測(cè)方法的建立[J]. 羅思思,謝芝勛,劉加波,龐耀珊,鄧顯文,謝志勤,謝麗基,范晴. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(01)
[5]H3N2亞型禽流感病毒雙重實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 劉婷婷,謝芝勛,宋德貴,謝志勤,鄧顯文,謝麗基,黃莉,羅思思,黃嬌玲,曾婷婷. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(09)
[6]H7亞型和N9亞型禽流感病毒RT-LAMP可視化檢測(cè)方法的建立[J]. 羅思思,謝芝勛,謝麗基,鄧顯文,謝志勤,黃嬌玲,曾婷婷. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(07)
[7]我國(guó)H9N2亞型禽流感病毒的流行和進(jìn)化特點(diǎn)[J]. 顧敏,彭大新,劉秀梵. 生命科學(xué). 2015(05)
[8]甲型流感病毒vRNP及PB1、PB2、PA和NP蛋白的核內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 譚偉,謝芝勛. 生物技術(shù)通訊. 2015(02)
[9]甲型流感病毒M1、M2和M42蛋白研究進(jìn)展[J]. 譚偉,謝芝勛. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(02)
[10]禽流感病毒H9和N2亞型雙重RT-PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 徐倩,謝芝勛,謝麗基,鄧顯文,謝志勤,羅思思,黃莉,黃嬌玲,曾婷婷. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(01)
博士論文
[1]禽流感病毒進(jìn)化與傳播規(guī)律研究[D]. 胡明達(dá).軍事科學(xué)院 2018
碩士論文
[1]廣西H9亞型禽流感病毒全基因組序列分析及疫苗候選株的篩選[D]. 徐倩.廣西大學(xué) 2015
本文編號(hào):3335546
【文章來(lái)源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:74 頁(yè)
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【部分圖文】:
禽流感病毒結(jié)構(gòu)圖
廣西大學(xué)獸醫(yī)碩士學(xué)位論文廣西野鳥(niǎo)源H9亞型禽流感病毒分離鑒定和全基因組測(cè)序分析及二重RT-LAMP檢測(cè)方法的建立162.3.3.2小鼠致病性試驗(yàn)2.3.3.2.1小鼠感染病毒后體重變化情況攻毒后14d內(nèi)小鼠未出現(xiàn)任何臨床癥狀,體重?zé)o明顯變化(表2-3)表2-3小鼠感染病毒后體重變化情況Table2-3Weightchangeofmiceafterinoculatedwithvirus2.3.3.2.2小鼠組織病毒滴度小鼠感染72h后有8株分離株可以在小鼠的鼻甲骨和肺中有效復(fù)制,有4株分離株僅在小鼠的鼻甲骨中有效復(fù)制,有3株分離株無(wú)法在小鼠體內(nèi)復(fù)制,小鼠組織病毒滴度結(jié)果見(jiàn)圖2-1。圖2-1接種72h后小鼠組織病毒滴定結(jié)果Fig2-1Virustiterinmousetissueson72hourspostinoculation序號(hào)Numbers毒株Virus小鼠平均體重Averageweightofmice(g)1d2d3d4d5d6d7d8d9d10d11d12d13d14d1PH/GX/208B1/1725.425.625.725.425.625.926.226.426.526.326.626.426.626.82DV/GX/279B/1924.825.626.224.424.324.724.924.824.724.925.125.325.225.43QL/GX/241B9/1826.626.326.126.426.726.926.826.927.127.227.027.327.227.44PH/GX/222B7/1825.725.825.725.925.826.026.226.126.326.226.426.326.526.55TD/GX/220B14/1826.226.326.426.326.326.426.626.726.626.826.726.827.027.16DV/GX/211B17/1726.025.925.725.826.126.126.226.326.526.426.426.526.626.67QL/GX/241B5/1825.125.125.325.425.625.425.424.525.625.525.625.725.625.78PH/GX/249B2/1825.525.625.625.825.725.725.925.825.825.926.126.126.326.39PA/GX/264B5/1926.526.626.826.526.727.027.427.527.727.527.827.628.028.110TD/GX/191B5/1728.628.928.628.829.229.429.029.329.629.830.030.330.730.411DV/GX/191B6/1727.728.128.528.
廣西大學(xué)獸醫(yī)碩士學(xué)位論文廣西野鳥(niǎo)源H9亞型禽流感病毒分離鑒定和全基因組測(cè)序分析及二重RT-LAMP檢測(cè)方法的建立22圖3-1HA基因遺傳進(jìn)化樹(shù)(1)Fig3-1PhylogenictreeofHAgene分析15株野鳥(niǎo)源分離株HA基因氨基酸序列結(jié)果表明分離株QL/GX/241B9/18、PH/GX/208B/17和DV/GX/279B19/19的受體結(jié)合位點(diǎn)左側(cè)壁第234位和236位為Q和G,具有這種HA氨基酸序列特點(diǎn)的AIV可以識(shí)別并結(jié)合禽類(lèi)細(xì)胞表面唾液酸受體SAa2,3Gal,其余12株分離株氨基酸序列在第234位和236位分別為L(zhǎng)和G,具有這種HA氨基酸序列特點(diǎn)的AIV可以識(shí)別并結(jié)合禽類(lèi)和人類(lèi)兩種細(xì)胞表面唾液酸受體SAa2,3Gal和SAa2,6Gal,15株分離株HA基因裂解位點(diǎn)均無(wú)多個(gè)堿性氨基酸插入,符合LPAIV特征[80],受體結(jié)合位點(diǎn)右側(cè)壁第149位氨基酸變化較大,其余受體結(jié)合位點(diǎn)均比較保守。(1)◆標(biāo)記的毒株為本研究分離株,▼標(biāo)記的毒株為代表毒株,◇標(biāo)記的毒株為本實(shí)驗(yàn)室其它H9亞型AIV分離株
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期刊論文
[1]2017年國(guó)內(nèi)大型雞場(chǎng)分離的H9N2禽流感病毒的遺傳進(jìn)化和分子特征分析[J]. 孫王楊吉,朱睿,張建軍,石火英. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(08)
[2]廣東省深圳市首例孕婦感染H9N2禽流感病例流行病學(xué)調(diào)查[J]. 劉峰,李剛,劉鳳仁,俞國(guó)龍. 疾病監(jiān)測(cè). 2019(07)
[3]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)在病原微生物快速檢測(cè)中的研究進(jìn)展[J]. 楊靖,胡姣姣,柏先澤,王遠(yuǎn)亮,謝康莊. 食品安全質(zhì)量檢測(cè)學(xué)報(bào). 2018(23)
[4]H10亞型禽流感病毒RT-LAMP可視化檢測(cè)方法的建立[J]. 羅思思,謝芝勛,劉加波,龐耀珊,鄧顯文,謝志勤,謝麗基,范晴. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(01)
[5]H3N2亞型禽流感病毒雙重實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 劉婷婷,謝芝勛,宋德貴,謝志勤,鄧顯文,謝麗基,黃莉,羅思思,黃嬌玲,曾婷婷. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(09)
[6]H7亞型和N9亞型禽流感病毒RT-LAMP可視化檢測(cè)方法的建立[J]. 羅思思,謝芝勛,謝麗基,鄧顯文,謝志勤,黃嬌玲,曾婷婷. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(07)
[7]我國(guó)H9N2亞型禽流感病毒的流行和進(jìn)化特點(diǎn)[J]. 顧敏,彭大新,劉秀梵. 生命科學(xué). 2015(05)
[8]甲型流感病毒vRNP及PB1、PB2、PA和NP蛋白的核內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 譚偉,謝芝勛. 生物技術(shù)通訊. 2015(02)
[9]甲型流感病毒M1、M2和M42蛋白研究進(jìn)展[J]. 譚偉,謝芝勛. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(02)
[10]禽流感病毒H9和N2亞型雙重RT-PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 徐倩,謝芝勛,謝麗基,鄧顯文,謝志勤,羅思思,黃莉,黃嬌玲,曾婷婷. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(01)
博士論文
[1]禽流感病毒進(jìn)化與傳播規(guī)律研究[D]. 胡明達(dá).軍事科學(xué)院 2018
碩士論文
[1]廣西H9亞型禽流感病毒全基因組序列分析及疫苗候選株的篩選[D]. 徐倩.廣西大學(xué) 2015
本文編號(hào):3335546
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