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2018-2019年廣西IBV分離株S1基因序列分析及4株代表性IBV變異株的免疫原性研究

發(fā)布時間:2021-08-05 12:38
  雞傳染性支氣管炎(infectious bronchitis,IB)是由雞傳染性支氣管炎病毒(infectious bronchitis virus,IBV)引起的一種急性、高度接觸性呼吸道傳染病。IBV基因組極易發(fā)生變異,導(dǎo)致基因型、血清型、致病性和免疫原性多樣化,不同基因型或血清型的毒株之間交叉保護效果不理想,生產(chǎn)上免疫失敗時有發(fā)生,給養(yǎng)禽業(yè)帶來較大經(jīng)濟損失。因此,及時了解掌握本地區(qū)IBV流行毒株的變異情況并篩選出具有良好免疫原性的毒株作為地方疫苗候選株,對IB防控具有很重要的現(xiàn)實意義。之前課題組完成了至2017年的廣西IBV分離株的分子流行病學(xué)調(diào)查,以及對4株廣西代表性IBV變異株致病性進行了研究,本研究在此基礎(chǔ)上,繼續(xù)對2018-2019年的廣西IBV分離株進行跟蹤研究,同時對此4株廣西代表性IBV變異株的免疫原性進行研究,具體如下。一、2018-2019年廣西IBV分離株S1基因序列分析應(yīng)用雞胚接種和RT-PCR技術(shù)對2018-2019年間廣西疑似病雞進行IBV的分離鑒定,并對分離株的S1基因進行擴增、測序以及相似性、進化樹、重組、高變區(qū)、糖基化位點和S蛋白裂解位點分析。結(jié)果... 

【文章來源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】:72 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

2018-2019年廣西IBV分離株S1基因序列分析及4株代表性IBV變異株的免疫原性研究


9株IBV的二重RT-PCR電泳結(jié)果

序列,基因,序列,氨基酸


.GX-BH180523;4.GX-LZ180820;5.GX-QZ181028;6.GX-NN180426;7.GX-GL181207;8.GX-YL190220;9.GX-NN190716;10.GX-QZ190726;11.GX-QZ190803;12.GX-NN190810;13.GX-GG190815;14.GX-GG190819;15.GX-NN190923;16.GX-NN191006;17.GX-YL191120;18.GX-YL191121;19.GX-NN191213;20.GX-NN191219;21.Negativecontrol2.3.2各分離株序列測定結(jié)果對19株IBV的S1基因進行RT-PCR擴增,均得到S1基因的特異性目的條帶,擴增結(jié)果如圖2-2所示。對所有IBV的S1基因進行序列測定,結(jié)果表明19株IBV的S1基因ORF為1611-1629bp,編碼537-543個氨基酸。圖2-219株IBV的SI基因RT-PCR結(jié)果注:M.DL2000PlusDNAMarker;1.GX-BH180202;2.GX-BH180523;3.GX-LZ180820;4.GX-QZ181028;5.GX-NN180426;6.GX-GL181207;7.GX-YL190220;8.GX-NN190716;9.GX-QZ190726;10.GX-QZ190803;11.GX-NN190810;12.GX-GG190815;13.GX-GG190819;14GX-NN190923;15.GX-NN191006;16.GX-YL191120;17.GX-YL191121;18.GX-NN191213;19.GX-NN191219;20.陰性對照Figure2-2ResultsofRT-PCRofSIgenein19IBVstrainsNote:M.DL2000PlusDNAMarker;1.GX-BH180202;2.GX-BH180523;3.

核苷酸序列,核苷酸序列,廣西,核苷酸


廣西大學(xué)獸醫(yī)碩士學(xué)位論文2018-2019年廣西IBV分離株S1基因序列分析及四株代表性IBV變異株的免疫原性研究16GX-LZ180820;4.GX-QZ181028;5.GX-NN180426;6.GX-GL181207;7.GX-YL190220;8.GX-NN190716;9.GX-QZ190726;10.GX-QZ190803;11.GX-NN190810;12.GX-GG190815;13.GX-GG190819;14GX-NN190923;15.GX-NN191006;16.GX-YL191120;17.GX-YL191121;18.GX-NN191213;19.GX-NN191219;20.Negativecontrol2.3.3相似性分析結(jié)果各毒株之間S1基因核苷酸序列相似性在66.2%-99.9%之間,推導(dǎo)氨基酸序列相似性在59.4%-99.8%之間。其中,GX-NN190923和GX-NN191006的核苷酸相似性為99.9%,氨基酸相似性為99.8%;19株IBV的S1基因序列與疫苗株4/91、H120、QX87、LDT3-A、LX4的核苷酸相似性分別為65.9%-78.9%、65.6%-83.2%、67.7%-96.0%、66.2%-99.1%、78.0%-99.1%(圖2-3和圖2-4)。圖2-319株分離株與參考株核苷酸序列相似性分析結(jié)果Figure2-3Resultsofnucleotidesequencesimilarityanalysisbetween19isolatesandreferencestrains

【參考文獻】:
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碩士論文
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[2]2015-2017年廣西雞傳染性支氣管炎病毒分離株結(jié)構(gòu)基因序列分析與血清型鑒定[D]. 唐寧.廣西大學(xué) 2018
[3]表達LX4型IBV流行毒株S1蛋白的重組新城疫病毒LaSota株的構(gòu)建及免疫效力評價[D]. 趙冉.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
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[5]2012~2013年IBV廣西分離株的基因序列分析和血清學(xué)鑒定[D]. 吳翠蘭.廣西大學(xué) 2015
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[9]2006年—2010年山東省雞傳染性支氣管炎病毒分離株基因型和血清型分析[D]. 任海松.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011



本文編號:3323765

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