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2018-2019年廣西IBV分離株S1基因序列分析及4株代表性IBV變異株的免疫原性研究

發(fā)布時(shí)間:2021-08-05 12:38
  雞傳染性支氣管炎(infectious bronchitis,IB)是由雞傳染性支氣管炎病毒(infectious bronchitis virus,IBV)引起的一種急性、高度接觸性呼吸道傳染病。IBV基因組極易發(fā)生變異,導(dǎo)致基因型、血清型、致病性和免疫原性多樣化,不同基因型或血清型的毒株之間交叉保護(hù)效果不理想,生產(chǎn)上免疫失敗時(shí)有發(fā)生,給養(yǎng)禽業(yè)帶來(lái)較大經(jīng)濟(jì)損失。因此,及時(shí)了解掌握本地區(qū)IBV流行毒株的變異情況并篩選出具有良好免疫原性的毒株作為地方疫苗候選株,對(duì)IB防控具有很重要的現(xiàn)實(shí)意義。之前課題組完成了至2017年的廣西IBV分離株的分子流行病學(xué)調(diào)查,以及對(duì)4株廣西代表性IBV變異株致病性進(jìn)行了研究,本研究在此基礎(chǔ)上,繼續(xù)對(duì)2018-2019年的廣西IBV分離株進(jìn)行跟蹤研究,同時(shí)對(duì)此4株廣西代表性IBV變異株的免疫原性進(jìn)行研究,具體如下。一、2018-2019年廣西IBV分離株S1基因序列分析應(yīng)用雞胚接種和RT-PCR技術(shù)對(duì)2018-2019年間廣西疑似病雞進(jìn)行IBV的分離鑒定,并對(duì)分離株的S1基因進(jìn)行擴(kuò)增、測(cè)序以及相似性、進(jìn)化樹(shù)、重組、高變區(qū)、糖基化位點(diǎn)和S蛋白裂解位點(diǎn)分析。結(jié)果... 

【文章來(lái)源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

2018-2019年廣西IBV分離株S1基因序列分析及4株代表性IBV變異株的免疫原性研究


9株IBV的二重RT-PCR電泳結(jié)果

序列,基因,序列,氨基酸


.GX-BH180523;4.GX-LZ180820;5.GX-QZ181028;6.GX-NN180426;7.GX-GL181207;8.GX-YL190220;9.GX-NN190716;10.GX-QZ190726;11.GX-QZ190803;12.GX-NN190810;13.GX-GG190815;14.GX-GG190819;15.GX-NN190923;16.GX-NN191006;17.GX-YL191120;18.GX-YL191121;19.GX-NN191213;20.GX-NN191219;21.Negativecontrol2.3.2各分離株序列測(cè)定結(jié)果對(duì)19株IBV的S1基因進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,均得到S1基因的特異性目的條帶,擴(kuò)增結(jié)果如圖2-2所示。對(duì)所有IBV的S1基因進(jìn)行序列測(cè)定,結(jié)果表明19株IBV的S1基因ORF為1611-1629bp,編碼537-543個(gè)氨基酸。圖2-219株IBV的SI基因RT-PCR結(jié)果注:M.DL2000PlusDNAMarker;1.GX-BH180202;2.GX-BH180523;3.GX-LZ180820;4.GX-QZ181028;5.GX-NN180426;6.GX-GL181207;7.GX-YL190220;8.GX-NN190716;9.GX-QZ190726;10.GX-QZ190803;11.GX-NN190810;12.GX-GG190815;13.GX-GG190819;14GX-NN190923;15.GX-NN191006;16.GX-YL191120;17.GX-YL191121;18.GX-NN191213;19.GX-NN191219;20.陰性對(duì)照Figure2-2ResultsofRT-PCRofSIgenein19IBVstrainsNote:M.DL2000PlusDNAMarker;1.GX-BH180202;2.GX-BH180523;3.

核苷酸序列,核苷酸序列,廣西,核苷酸


廣西大學(xué)獸醫(yī)碩士學(xué)位論文2018-2019年廣西IBV分離株S1基因序列分析及四株代表性IBV變異株的免疫原性研究16GX-LZ180820;4.GX-QZ181028;5.GX-NN180426;6.GX-GL181207;7.GX-YL190220;8.GX-NN190716;9.GX-QZ190726;10.GX-QZ190803;11.GX-NN190810;12.GX-GG190815;13.GX-GG190819;14GX-NN190923;15.GX-NN191006;16.GX-YL191120;17.GX-YL191121;18.GX-NN191213;19.GX-NN191219;20.Negativecontrol2.3.3相似性分析結(jié)果各毒株之間S1基因核苷酸序列相似性在66.2%-99.9%之間,推導(dǎo)氨基酸序列相似性在59.4%-99.8%之間。其中,GX-NN190923和GX-NN191006的核苷酸相似性為99.9%,氨基酸相似性為99.8%;19株IBV的S1基因序列與疫苗株4/91、H120、QX87、LDT3-A、LX4的核苷酸相似性分別為65.9%-78.9%、65.6%-83.2%、67.7%-96.0%、66.2%-99.1%、78.0%-99.1%(圖2-3和圖2-4)。圖2-319株分離株與參考株核苷酸序列相似性分析結(jié)果Figure2-3Resultsofnucleotidesequencesimilarityanalysisbetween19isolatesandreferencestrains

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]雞傳染性支氣管炎病毒山東株分離鑒定及其滅活疫苗制備與評(píng)價(jià)[D]. 苗立中.吉林大學(xué) 2018
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碩士論文
[1]四株廣西代表性IBV變異株的全基因組序列測(cè)定和生物信息學(xué)分析及致病性研究[D]. 董志華.廣西大學(xué) 2019
[2]2015-2017年廣西雞傳染性支氣管炎病毒分離株結(jié)構(gòu)基因序列分析與血清型鑒定[D]. 唐寧.廣西大學(xué) 2018
[3]表達(dá)LX4型IBV流行毒株S1蛋白的重組新城疫病毒LaSota株的構(gòu)建及免疫效力評(píng)價(jià)[D]. 趙冉.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]三種常用IBV商品弱毒疫苗對(duì)廣西主要流行毒株免疫保護(hù)作用的比較研究[D]. 李和鳴.廣西大學(xué) 2016
[5]2012~2013年IBV廣西分離株的基因序列分析和血清學(xué)鑒定[D]. 吳翠蘭.廣西大學(xué) 2015
[6]中國(guó)部分Massachusetts型雞傳染性支氣管炎病毒的生物學(xué)特性[D]. 陳玲鳳.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[7]雞傳染性支氣管炎病毒廣西分離株血清型的鑒定及免疫原性的研究[D]. 孫蓉.廣西大學(xué) 2012
[8]雞傳染性支氣管炎病毒基因型與血清型相關(guān)性初步研究[D]. 汪洋.中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所 2011
[9]2006年—2010年山東省雞傳染性支氣管炎病毒分離株基因型和血清型分析[D]. 任海松.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011



本文編號(hào):3323765

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