3種鼩鼱線粒體基因組分析及鼩鼱屬分類探討
發(fā)布時間:2021-08-03 21:26
食蟲目(Insectivora)鼩鼱科(Soricidae)物種是現(xiàn)今為止人們發(fā)現(xiàn)的最小的一類哺乳動物,廣泛分布于亞、非、歐及南北美洲。現(xiàn)分為鼩鼱亞科(Soricinae)和麝鼩亞科(Crocidurinae)兩類。鼩鼱屬(Sorex)隸屬于鼩鼱亞科。該類動物體型小且隱蔽性強,因此較難捕獲,迄今國內(nèi)相關(guān)文獻資料相對較少。隨著分子生物學的發(fā)展,越來越多的學者開始將傳統(tǒng)的形態(tài)學和系統(tǒng)發(fā)育學技術(shù)整合在一起并實際應用于物種鑒別,極大程度地加強了對鼩鼱科的分類學研究,并且在鼩鼱科發(fā)現(xiàn)新物種和重新描述等研究方面也受到了熱烈的關(guān)注。然而,由于缺乏線粒體基因組數(shù)據(jù),鼩鼱屬的親緣關(guān)系和物種分類狀況無法在線粒體基因組水平上進行探索;2013年至今積累的鼩鼱科標本為基礎,本文對扁顱鼩鼱(S.roboratus)、遠東鼩鼱(S.isodon)及中鼩鼱(S.caecutiens)以傳統(tǒng)形態(tài)學和系統(tǒng)發(fā)育學相結(jié)合,互相印證從而完成物種鑒定。即先利用標本外部形態(tài)與頭骨特征的對比、描述與測量進行形態(tài)學物種鑒定,再利用mt DNA中Cytb單基因完成系統(tǒng)發(fā)育樹重建,通過計算樣本間的遺傳距離進行分子生物學物種鑒定,最終...
【文章來源】:牡丹江師范學院黑龍江省
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
技術(shù)路線圖
牡丹江師范學院碩士學位-16-圖3-1鼩鼱屬3個物種頭骨圖(a:上頜背面;b:上頜腹面;C:下頜齒側(cè)面;d:上頜齒側(cè)面)Fig.3-1Skullof3typesSorexspecies(a:Dorsalviewofthemaxilla;b:Ventralviewofthemaxilla;c:Lateralaspectoftoothofthemandible;d:Lateralaspectoftoothofthemaxilla)表3-23種鼩鼱形態(tài)學指標測量數(shù)據(jù)Table.3-2Morphologicalindexmeasurementdataof3typesSorex扁顱鼩鼱S.roboratus遠東鼩鼱S.isodon中鼩鼱S.caecutiens體重BW(g)10.237.824.49頭體長HB(mm)62.4959.8051.33尾長TL(mm)35.9042.6536.38尾長/頭體長TL/HB0.570.710.71后足長HF(mm)11.6612.4410.73耳長EL(mm)3.442.452.35顱全長GLS(mm)20.7719.5518.21顱基長CIL(mm)17.7718.1217.41基長BL(mm)16.5416.8815.40腦顱寬CB(mm)9.709.618.86腦顱高BH(mm)5.955.885.61眶間寬IOB(mm)2.792.932.61上齒列長UTRL(mm)8.678.107.21下齒列長LTRL(mm)7.597.936.78腭前部寬FWP(mm)2.622.322.05腭后部寬HWP(mm)3.193.122.86扁顱鼩鼱S.roboratus遠東鼩鼱S.isodon中鼩鼱S.caecutiens
第三章結(jié)果與分析-17-結(jié)合近緣物種和東北亞地區(qū)分布的其它物種,根據(jù)表2-3中的序列以ML法和NJ法分別構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹并計算樣本間的遺傳距離。結(jié)果顯示:同種鼩鼱的遺傳距離為0.00-0.04,鼩鼱屬物種間的遺傳距離為0.1-0.14,鼩鼱屬所有物種與大麝鼩的遺傳距離為0.21-0.25(表3-3);相同物種的序列都聚在一個小的分支上,并且表現(xiàn)出種內(nèi)與種間明顯的系統(tǒng)分化(圖3-2,圖3-3)。物種的聚類分析結(jié)果與形態(tài)學分類一致,進一步證明了物種的形態(tài)學鑒定結(jié)果。圖3-2基于Cytb基因構(gòu)建的3種鼩鼱ML系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.3-2Phylogenetictreeof3typesSorexinferredfromMLbasedontheCytbgene
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于Cyt b基因全序列鼩鼱屬分子系統(tǒng)學分析——我國東北地區(qū)鼩鼱屬物種的系統(tǒng)發(fā)生地位[J]. 張雋晟,劉鑄,董明,杜建宇,楊茜,金志民. 野生動物學報. 2019(01)
[2]中國東北地區(qū)鼩鼱科動物分類與分布[J]. 劉鑄,張雋晟,白薇,劉歡,解瑞雪,楊茜,金志民. 獸類學報. 2019(01)
[3]我國東北地區(qū)發(fā)現(xiàn)姬鼩鼱分布[J]. 劉鑄,張雋晟,孫悅欣,楊茜,金志民. 動物學雜志. 2017(03)
[4]扁顱鼩鼱(Sorex roboratus)在中國分布的證實[J]. 劉鑄,楊茜,解瑞雪,劉歡,金志民,張新鵬. 獸類學報. 2016(04)
[5]黑龍江省橫道河子地區(qū)發(fā)現(xiàn)細鼩鼱(食蟲目:鼩鼱科)[J]. 劉鑄,解瑞雪,劉歡,金志民. 動物學雜志. 2016(03)
[6]隱種及其在兩棲動物中的研究進展[J]. 黃華,鄭榮泉,張加勇,陳雯,于曉云,陳平. 生命科學. 2012(05)
[7]鳥類分子系統(tǒng)地理學研究進展[J]. 董路,張雁云. 生態(tài)學報. 2011(14)
[8]苔原鼩鼱(Sorex tundrensis)在中國分布的首次證實[J]. 劉洋,王昊,劉少英. 獸類學報. 2010(04)
[9]動物線粒體基因與進化研究進展[J]. 劉銀梅. 山西農(nóng)業(yè)科學. 2007(01)
[10]線粒體基因組全序列研究與動物分子系統(tǒng)發(fā)生的關(guān)系[J]. 李耀東,邵嘉會. 青海醫(yī)學院學報. 2006(01)
碩士論文
[1]鶇屬九種鳥線粒體基因組全序列比較及系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系[D]. 江波.蘭州大學 2018
[2]倉鼠屬物種線粒體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)生[D]. 丁勵.蘭州大學 2017
本文編號:3320364
【文章來源】:牡丹江師范學院黑龍江省
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
技術(shù)路線圖
牡丹江師范學院碩士學位-16-圖3-1鼩鼱屬3個物種頭骨圖(a:上頜背面;b:上頜腹面;C:下頜齒側(cè)面;d:上頜齒側(cè)面)Fig.3-1Skullof3typesSorexspecies(a:Dorsalviewofthemaxilla;b:Ventralviewofthemaxilla;c:Lateralaspectoftoothofthemandible;d:Lateralaspectoftoothofthemaxilla)表3-23種鼩鼱形態(tài)學指標測量數(shù)據(jù)Table.3-2Morphologicalindexmeasurementdataof3typesSorex扁顱鼩鼱S.roboratus遠東鼩鼱S.isodon中鼩鼱S.caecutiens體重BW(g)10.237.824.49頭體長HB(mm)62.4959.8051.33尾長TL(mm)35.9042.6536.38尾長/頭體長TL/HB0.570.710.71后足長HF(mm)11.6612.4410.73耳長EL(mm)3.442.452.35顱全長GLS(mm)20.7719.5518.21顱基長CIL(mm)17.7718.1217.41基長BL(mm)16.5416.8815.40腦顱寬CB(mm)9.709.618.86腦顱高BH(mm)5.955.885.61眶間寬IOB(mm)2.792.932.61上齒列長UTRL(mm)8.678.107.21下齒列長LTRL(mm)7.597.936.78腭前部寬FWP(mm)2.622.322.05腭后部寬HWP(mm)3.193.122.86扁顱鼩鼱S.roboratus遠東鼩鼱S.isodon中鼩鼱S.caecutiens
第三章結(jié)果與分析-17-結(jié)合近緣物種和東北亞地區(qū)分布的其它物種,根據(jù)表2-3中的序列以ML法和NJ法分別構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹并計算樣本間的遺傳距離。結(jié)果顯示:同種鼩鼱的遺傳距離為0.00-0.04,鼩鼱屬物種間的遺傳距離為0.1-0.14,鼩鼱屬所有物種與大麝鼩的遺傳距離為0.21-0.25(表3-3);相同物種的序列都聚在一個小的分支上,并且表現(xiàn)出種內(nèi)與種間明顯的系統(tǒng)分化(圖3-2,圖3-3)。物種的聚類分析結(jié)果與形態(tài)學分類一致,進一步證明了物種的形態(tài)學鑒定結(jié)果。圖3-2基于Cytb基因構(gòu)建的3種鼩鼱ML系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.3-2Phylogenetictreeof3typesSorexinferredfromMLbasedontheCytbgene
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于Cyt b基因全序列鼩鼱屬分子系統(tǒng)學分析——我國東北地區(qū)鼩鼱屬物種的系統(tǒng)發(fā)生地位[J]. 張雋晟,劉鑄,董明,杜建宇,楊茜,金志民. 野生動物學報. 2019(01)
[2]中國東北地區(qū)鼩鼱科動物分類與分布[J]. 劉鑄,張雋晟,白薇,劉歡,解瑞雪,楊茜,金志民. 獸類學報. 2019(01)
[3]我國東北地區(qū)發(fā)現(xiàn)姬鼩鼱分布[J]. 劉鑄,張雋晟,孫悅欣,楊茜,金志民. 動物學雜志. 2017(03)
[4]扁顱鼩鼱(Sorex roboratus)在中國分布的證實[J]. 劉鑄,楊茜,解瑞雪,劉歡,金志民,張新鵬. 獸類學報. 2016(04)
[5]黑龍江省橫道河子地區(qū)發(fā)現(xiàn)細鼩鼱(食蟲目:鼩鼱科)[J]. 劉鑄,解瑞雪,劉歡,金志民. 動物學雜志. 2016(03)
[6]隱種及其在兩棲動物中的研究進展[J]. 黃華,鄭榮泉,張加勇,陳雯,于曉云,陳平. 生命科學. 2012(05)
[7]鳥類分子系統(tǒng)地理學研究進展[J]. 董路,張雁云. 生態(tài)學報. 2011(14)
[8]苔原鼩鼱(Sorex tundrensis)在中國分布的首次證實[J]. 劉洋,王昊,劉少英. 獸類學報. 2010(04)
[9]動物線粒體基因與進化研究進展[J]. 劉銀梅. 山西農(nóng)業(yè)科學. 2007(01)
[10]線粒體基因組全序列研究與動物分子系統(tǒng)發(fā)生的關(guān)系[J]. 李耀東,邵嘉會. 青海醫(yī)學院學報. 2006(01)
碩士論文
[1]鶇屬九種鳥線粒體基因組全序列比較及系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系[D]. 江波.蘭州大學 2018
[2]倉鼠屬物種線粒體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)生[D]. 丁勵.蘭州大學 2017
本文編號:3320364
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