半滑舌鰨補(bǔ)體凝集素途徑基因MASP1、MASP2和CL-11的鑒定、表達(dá)和功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-13 06:07
本研究以半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)的甘露糖結(jié)合凝集素相關(guān)絲氨酸蛋白酶MASP1基因(CsMASP1)、甘露糖結(jié)合凝集素相關(guān)絲氨酸蛋白酶MASP2基因(CsMASP2)和膠原凝集素Collectin 11基因(CsCL-11)為研究對(duì)象,通過基因克隆,基因表達(dá)分析,原核表達(dá)及重組蛋白抑菌功能的驗(yàn)證等,獲得以下結(jié)果:CsMASP1基因的cDNA全長(zhǎng)2507 bp,5′非編碼區(qū)長(zhǎng)82 bp,3′非編碼區(qū)長(zhǎng)142 bp,開放閱讀框長(zhǎng)2283 bp,共編碼760個(gè)氨基酸。預(yù)測(cè)其分子量為84.95 kDa,理論等電點(diǎn)(pI)為5.33。SMART結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)分析得知CsMASP1蛋白含有6個(gè)結(jié)構(gòu)域:分別是2個(gè)類Clr/Cls蛋白結(jié)構(gòu)域(like Clr/Cls Protein domain,CUB)(47-168aa,215-327aa),1個(gè)表皮細(xì)胞生長(zhǎng)因子樣結(jié)構(gòu)域(calcium-binding epidermal growth factor-like domain,EGF-CA)(169-212aa),2個(gè)補(bǔ)體控制蛋白區(qū)結(jié)構(gòu)域(complement control...
【文章來源】:青島大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
半滑舌鰨MASP1cDNA序列和推測(cè)的氨基酸序列
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文氨基酸序列顯示在核苷酸序列下方,用大寫字母表示。方框所示為起始密碼子 (ATG)、為終止密碼子 TGA;實(shí)線所示為 CUB 結(jié)構(gòu)域;圓點(diǎn)線所示為 EGF-CA 結(jié)構(gòu)域;短劃線CP 結(jié)構(gòu)域;雙劃線所示為 Tryp-SPc 結(jié)構(gòu)域;波浪線所示為 polyA 結(jié)構(gòu)ted amino acid sequence was shown under the nucleotide sequence as uppercase. The iniaand termination codon were marked by a box and an asterisk, respectively; CUB domain in solid line; EGF-CA domain was shown in dot line; CCP domain was shown in dashed lPc domain was shown in double solid line; polyAwas shown in wavy line.
Translated amino acid sequence was shown under the nucleotide sequence as uppercase. Thcodon and termination codon were marked by a box and an asterisk, respectively; CUB doshown in solid line; EGF-CA domain was shown in dot line; CCP domain was shown in daTryp-SPc domain was shown in double solid line; polyAwas shown in wavy line.圖 1.2 半滑舌鰨 MASP1 蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)Fig 1.2 Domain structure prediction of C. semilaevis MASP1SMART 軟件在線預(yù)測(cè) CsMASP1 蛋白的結(jié)構(gòu)域,CsMASP1 包含 6 個(gè)結(jié)構(gòu)域,從 C 端到 是 CUB 結(jié)構(gòu)域 (47-168aa), EGF-CA 結(jié)構(gòu)域 (169-212aa), CUB 結(jié)構(gòu)域 (215-327aa), CCP(331-392aa), CCP 結(jié)構(gòu)域 (397-461aa), Tryp-SPc 結(jié)構(gòu)域 (478-752aa).SMART software predicts the domain of CsMASP1 protein online. CsMASP1 contains six domadomain (47-168aa), EGF-CA domain (169-212aa), CUB domain (215-327aa), CCP domain (33CCP domain (397-461aa), Tryp-SPc domain (478-752aa).
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]半滑舌鰨外周血T淋巴細(xì)胞的分離、鑒定及TCRβ基因免疫應(yīng)答分析[J]. 汪林慶,王航,陳亞東,楊光,白莉,孫璐明,沙珍霞. 水生生物學(xué)報(bào). 2018(03)
[2]甘露聚糖結(jié)合凝集素相關(guān)絲氨酸蛋白酶3的研究現(xiàn)狀[J]. 魏敏,邢國蘭. 中國免疫學(xué)雜志. 2018(02)
[3]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)c-Jun基因的克隆及免疫應(yīng)答分析[J]. 于孟君,孫璐明,陳亞東,陳學(xué)杰,楊光,劉洋,仇雪梅,沙珍霞. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2017(02)
[4]甘露聚糖結(jié)合凝集素相關(guān)蛋白19(MAp19)的研究現(xiàn)狀[J]. 李婷,李萍. 中國免疫學(xué)雜志. 2016(07)
[5]甘露聚糖結(jié)合凝集素的研究進(jìn)展[J]. 張喆. 山東化工. 2016(03)
[6]半滑舌鰨TRAF6基因和TAK1基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 陳燕,樊琳,劉田田,劉躍中,李贊,張全啟. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2015(05)
[7]斑點(diǎn)叉尾TLR20和TLR21基因在不同細(xì)菌和病毒感染后的表達(dá)特征[J]. 路飏,王啟龍,李敏,陳松林,沙珍霞. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2013(06)
[8]甘露糖結(jié)合凝集素相關(guān)的絲氨酸蛋白酶2研究進(jìn)展[J]. 王新菊,鞠志花,王長(zhǎng)法,李國榮. 中國畜牧獸醫(yī). 2012(03)
[9]甲狀腺腫瘤患者血清中MBL和MASP-2的表達(dá)及意義[J]. 石燕萍,劉閣玲,張慧芹,俞芳,項(xiàng)岫秀,路一芳. 廣東醫(yī)學(xué). 2012(02)
[10]甘露聚糖結(jié)合凝集素的絲氨酸蛋白酶結(jié)合位點(diǎn)初步研究[J]. 蔡學(xué)敏,趙娜,左大明,張麗蕓,陳政良. 現(xiàn)代免疫學(xué). 2009(03)
博士論文
[1]文昌魚體液和魚類血清補(bǔ)體溶血系統(tǒng)比較研究[D]. 王長(zhǎng)法.中國海洋大學(xué) 2003
碩士論文
[1]半滑舌鰨腸道微生物及C9基因在免疫反應(yīng)中的應(yīng)答特征[D]. 汪林慶.福州大學(xué) 2017
[2]半滑舌鰨補(bǔ)體調(diào)控因子I的鑒定、重組表達(dá)、功能分析及C3-1基因的初步研究[D]. 向晉松.上海海洋大學(xué) 2015
本文編號(hào):3281507
【文章來源】:青島大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
半滑舌鰨MASP1cDNA序列和推測(cè)的氨基酸序列
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文氨基酸序列顯示在核苷酸序列下方,用大寫字母表示。方框所示為起始密碼子 (ATG)、為終止密碼子 TGA;實(shí)線所示為 CUB 結(jié)構(gòu)域;圓點(diǎn)線所示為 EGF-CA 結(jié)構(gòu)域;短劃線CP 結(jié)構(gòu)域;雙劃線所示為 Tryp-SPc 結(jié)構(gòu)域;波浪線所示為 polyA 結(jié)構(gòu)ted amino acid sequence was shown under the nucleotide sequence as uppercase. The iniaand termination codon were marked by a box and an asterisk, respectively; CUB domain in solid line; EGF-CA domain was shown in dot line; CCP domain was shown in dashed lPc domain was shown in double solid line; polyAwas shown in wavy line.
Translated amino acid sequence was shown under the nucleotide sequence as uppercase. Thcodon and termination codon were marked by a box and an asterisk, respectively; CUB doshown in solid line; EGF-CA domain was shown in dot line; CCP domain was shown in daTryp-SPc domain was shown in double solid line; polyAwas shown in wavy line.圖 1.2 半滑舌鰨 MASP1 蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)Fig 1.2 Domain structure prediction of C. semilaevis MASP1SMART 軟件在線預(yù)測(cè) CsMASP1 蛋白的結(jié)構(gòu)域,CsMASP1 包含 6 個(gè)結(jié)構(gòu)域,從 C 端到 是 CUB 結(jié)構(gòu)域 (47-168aa), EGF-CA 結(jié)構(gòu)域 (169-212aa), CUB 結(jié)構(gòu)域 (215-327aa), CCP(331-392aa), CCP 結(jié)構(gòu)域 (397-461aa), Tryp-SPc 結(jié)構(gòu)域 (478-752aa).SMART software predicts the domain of CsMASP1 protein online. CsMASP1 contains six domadomain (47-168aa), EGF-CA domain (169-212aa), CUB domain (215-327aa), CCP domain (33CCP domain (397-461aa), Tryp-SPc domain (478-752aa).
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]半滑舌鰨外周血T淋巴細(xì)胞的分離、鑒定及TCRβ基因免疫應(yīng)答分析[J]. 汪林慶,王航,陳亞東,楊光,白莉,孫璐明,沙珍霞. 水生生物學(xué)報(bào). 2018(03)
[2]甘露聚糖結(jié)合凝集素相關(guān)絲氨酸蛋白酶3的研究現(xiàn)狀[J]. 魏敏,邢國蘭. 中國免疫學(xué)雜志. 2018(02)
[3]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)c-Jun基因的克隆及免疫應(yīng)答分析[J]. 于孟君,孫璐明,陳亞東,陳學(xué)杰,楊光,劉洋,仇雪梅,沙珍霞. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2017(02)
[4]甘露聚糖結(jié)合凝集素相關(guān)蛋白19(MAp19)的研究現(xiàn)狀[J]. 李婷,李萍. 中國免疫學(xué)雜志. 2016(07)
[5]甘露聚糖結(jié)合凝集素的研究進(jìn)展[J]. 張喆. 山東化工. 2016(03)
[6]半滑舌鰨TRAF6基因和TAK1基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 陳燕,樊琳,劉田田,劉躍中,李贊,張全啟. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2015(05)
[7]斑點(diǎn)叉尾TLR20和TLR21基因在不同細(xì)菌和病毒感染后的表達(dá)特征[J]. 路飏,王啟龍,李敏,陳松林,沙珍霞. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2013(06)
[8]甘露糖結(jié)合凝集素相關(guān)的絲氨酸蛋白酶2研究進(jìn)展[J]. 王新菊,鞠志花,王長(zhǎng)法,李國榮. 中國畜牧獸醫(yī). 2012(03)
[9]甲狀腺腫瘤患者血清中MBL和MASP-2的表達(dá)及意義[J]. 石燕萍,劉閣玲,張慧芹,俞芳,項(xiàng)岫秀,路一芳. 廣東醫(yī)學(xué). 2012(02)
[10]甘露聚糖結(jié)合凝集素的絲氨酸蛋白酶結(jié)合位點(diǎn)初步研究[J]. 蔡學(xué)敏,趙娜,左大明,張麗蕓,陳政良. 現(xiàn)代免疫學(xué). 2009(03)
博士論文
[1]文昌魚體液和魚類血清補(bǔ)體溶血系統(tǒng)比較研究[D]. 王長(zhǎng)法.中國海洋大學(xué) 2003
碩士論文
[1]半滑舌鰨腸道微生物及C9基因在免疫反應(yīng)中的應(yīng)答特征[D]. 汪林慶.福州大學(xué) 2017
[2]半滑舌鰨補(bǔ)體調(diào)控因子I的鑒定、重組表達(dá)、功能分析及C3-1基因的初步研究[D]. 向晉松.上海海洋大學(xué) 2015
本文編號(hào):3281507
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3281507.html
最近更新
教材專著