發(fā)布時間：2021-06-22 11:05

　　AP2基因作為一種調(diào)控植物花發(fā)育的功能基因,參與花分生特性建立。利用生物信息學(xué)方法對阿拉伯巖芥AP2蛋白的理化性質(zhì)、高級結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系等進(jìn)行了詳細(xì)的預(yù)測和分析。結(jié)果表明,除了成員AA40G00375、AA54G00162為穩(wěn)定蛋白,其余AP2蛋白均為不穩(wěn)定蛋白,且大多數(shù)蛋白定位在細(xì)胞核。只有成員AA8G00350屬于分泌蛋白,其余均為非分泌蛋白,且均不屬于跨膜蛋白。磷酸化位點(diǎn)分析表明AP2蛋白的生物功能主要是通過在絲氨酸（Ser）位點(diǎn)進(jìn)行磷酸化來實(shí)現(xiàn)的。AP2蛋白的二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲為主,各個成員的二級結(jié)構(gòu)元件組成含量大小排列順序?yàn)闊o規(guī)則卷曲>α-螺旋>延伸鏈>β-轉(zhuǎn)角。其中14個AP2蛋白成員有2個保守結(jié)構(gòu)域,其余均有1個保守結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進(jìn)化樹表明阿拉伯巖芥AP2基因家族與擬南芥、小麥有較近的親緣關(guān)系。這些結(jié)果可為進(jìn)一步研究其生物學(xué)功能提供一定的參考依據(jù)。 

【文章來源】：安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(08)

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 理化性質(zhì)分析及亞細(xì)胞定位。
        1.2.2 信號肽和跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測。
        1.2.3 磷酸化位點(diǎn)預(yù)測、親疏水性及保守結(jié)構(gòu)預(yù)測。
        1.2.4 二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析。
        1.2.5 保守基序和系統(tǒng)進(jìn)化樹建構(gòu)。
2 結(jié)果與分析
    2.1 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的理化性質(zhì)分析及亞細(xì)胞定位
    2.2 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的保守結(jié)構(gòu)域和疏水性/親水性預(yù)測
    2.3 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的信號肽分析
    2.4 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域分析
    2.5 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的磷酸化位點(diǎn)預(yù)測分析
    2.6 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
    2.7 阿拉伯巖芥AP2基因序列結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
    2.8 阿拉伯巖芥AP2基因系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
3 討論與結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]擬南芥AtDPBF4基因克隆及生物信息學(xué)分析與表達(dá)研究[D]. 劉金鴿.蘭州理工大學(xué) 2013



本文編號：3242723