AP2基因作為一種調(diào)控植物花發(fā)育的功能基因,參與花分生特性建立。利用生物信息學(xué)方法對(duì)阿拉伯巖芥AP2蛋白的理化性質(zhì)、高級(jí)結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系等進(jìn)行了詳細(xì)的預(yù)測(cè)和分析。結(jié)果表明,除了成員AA40G00375、AA54G00162為穩(wěn)定蛋白,其余AP2蛋白均為不穩(wěn)定蛋白,且大多數(shù)蛋白定位在細(xì)胞核。只有成員AA8G00350屬于分泌蛋白,其余均為非分泌蛋白,且均不屬于跨膜蛋白。磷酸化位點(diǎn)分析表明AP2蛋白的生物功能主要是通過(guò)在絲氨酸（Ser）位點(diǎn)進(jìn)行磷酸化來(lái)實(shí)現(xiàn)的。AP2蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)以無(wú)規(guī)則卷曲為主,各個(gè)成員的二級(jí)結(jié)構(gòu)元件組成含量大小排列順序?yàn)闊o(wú)規(guī)則卷曲>α-螺旋>延伸鏈>β-轉(zhuǎn)角。其中14個(gè)AP2蛋白成員有2個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,其余均有1個(gè)保守結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)表明阿拉伯巖芥AP2基因家族與擬南芥、小麥有較近的親緣關(guān)系。這些結(jié)果可為進(jìn)一步研究其生物學(xué)功能提供一定的參考依據(jù)。 

【文章來(lái)源】：安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(08)

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 理化性質(zhì)分析及亞細(xì)胞定位。
        1.2.2 信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)。
        1.2.3 磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)、親疏水性及保守結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。
        1.2.4 二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析。
        1.2.5 保守基序和系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)建構(gòu)。
2 結(jié)果與分析
    2.1 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的理化性質(zhì)分析及亞細(xì)胞定位
    2.2 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的保守結(jié)構(gòu)域和疏水性/親水性預(yù)測(cè)
    2.3 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的信號(hào)肽分析
    2.4 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域分析
    2.5 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)分析
    2.6 阿拉伯巖芥AP2基因編碼蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析
    2.7 阿拉伯巖芥AP2基因序列結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
    2.8 阿拉伯巖芥AP2基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
3 討論與結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]大白菜和甘藍(lán)型油菜AP2/ERF家族轉(zhuǎn)錄因子的克隆與分析[D]. 莊靜.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009

碩士論文
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本文編號(hào)：3242723