姜科植物的蛋白遺傳多樣性研究
發(fā)布時間:2021-06-11 17:36
[目的]了解不同姜科植物蛋白水平遺傳多樣性。[方法]分別采用TCA/丙酮法、Tris-HCl法和試劑盒法提取益智葉片蛋白并進行聚丙烯酰胺電泳(SDS-PAGE)分析,獲得最佳蛋白提取方法。采用最佳蛋白提取方法提取7種姜科植物的蛋白并進行SDS-PAGE分析和數(shù)據(jù)統(tǒng)計,用軟件NTSYS對姜科植物進行聚類分析。[結(jié)果]試劑盒法為最佳蛋白提取方法,SDS-PAGE結(jié)果表明,7種姜科植物中共檢出蛋白條帶52個,其中共有條帶14個和多態(tài)性條帶38個,平均多態(tài)性比率為73.1%。聚類分析結(jié)果表明,7種姜科植物可分為4類,聚類結(jié)果與姜科植物的種屬相關(guān)但并非嚴格一致。[結(jié)論]該研究建立了姜科植物的蛋白遺傳多樣性研究方法,表明姜科植物具有豐富的蛋白遺傳多樣性,為今后姜科植物的遺傳多樣性研究提供了理論依據(jù)。
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)科學. 2020,48(14)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
3種不同方法提取益智蛋白的電泳圖
7種姜科植物的蛋白經(jīng)SDS-PAGE電泳分析,結(jié)果如圖2所示。由圖2可見,其分子量均分布在66.2~14.4 kDa。7種姜科植物中共檢測出52個遷移率不同的蛋白條帶,其中共有條帶為14個,多態(tài)性條帶38個,平均多態(tài)性比率為73.1%(表2)。7種姜科植物的蛋白譜帶數(shù)因材料而異。其中,爪哇白豆蔻分離出的蛋白譜帶數(shù)最多,共有11條蛋白條帶,分別為6條明帶和5條暗帶;光葉山姜材料分離出的蛋白譜帶數(shù)最少,只有5條蛋白譜帶且均是暗帶;草豆蔻和高良姜的蛋白譜帶分布非常相似,主要蛋白譜帶均有7條,分別為2條明帶和5條暗帶;益智和砂仁的蛋白譜帶均有8條,其差異是益智在97.4 kDa的附近有1條蛋白暗帶,砂仁在22.0 kDa附近處有1條蛋白暗帶。表 2 7種姜科植物的蛋白條帶統(tǒng)計Table 2 The statistical analysis of protein bands in seven species of Zingiberaceae plants 樣品名稱Sample 條帶數(shù)Bands//個 多態(tài)性條帶Polymorphic strip//個 多態(tài)性比率Polymorphic ratio//% 光葉山姜Alpinia intermedia 5 3 60.0 陽荷Zingiber striolatum 6 4 66.7 爪哇白豆蔻 Amomum compactum 11 9 81.8 草豆蔻Alpinia katsumadai 7 5 71.4 益智Alpinia oxyphylla 8 6 75.0 高良姜Alpinia officinarum 7 5 71.4 砂仁Amomum longiligular 8 6 75.0 總計Total 52 38 73.1
海南島姜科資源豐富,探究姜科植物資源的蛋白遺傳多樣性,闡明不同姜科植物種質(zhì)資源的親緣關(guān)系,可為姜科植物品種鑒定和保護提供理論依據(jù),進而推動姜科資源更深層的開發(fā)利用[18]。該研究通過優(yōu)化蛋白提取方法,采用SDS-PAGE電泳技術(shù)對7種不同的姜科植物蛋白遺傳多樣性進行了初步研究。結(jié)果表明,試劑盒法提取的蛋白效果最佳,姜科植物在蛋白水平上具有豐富的遺傳多樣性,可作為評價姜科植物遺傳多樣性的生化標記。蛋白遺傳多樣性研究是以SDS-PAGE電泳的蛋白條帶數(shù)、遷移位置、條帶顏色深淺作為評價指標,受到蛋白提取方法的影響比較大[19]。為避免這種誤差的影響,該研究以益智為材料進行蛋白提取方法的優(yōu)化。結(jié)果表明,試劑盒法提取的蛋白電泳條帶更多且清晰,而TCA/丙酮法和Tris-HCl法提取的蛋白電泳條帶少且不清晰。BCA蛋白濃度測定結(jié)果表明,蛋白濃度依次從大到小為試劑盒法>Tris-HCl法>TCA/丙酮法。因此,選用試劑盒法提取姜科植物蛋白是比較切實可行的方法。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]砂仁中化學成分及其藥理作用的研究進展[J]. 李麗麗,田文倉,劉茵,李永杰,曹曉霞,張偉. 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2018(22)
[2]4種金柑葉片蛋白質(zhì)提取方法比較分析[J]. 張宇,唐志鵬,秦榮耀,焦丁華,王長江. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2018(10)
[3]南藥益智SRAP-PCR體系優(yōu)化及引物篩選[J]. 歐虹雅,韓冬苗,黃茲寶,張明康,周聰聰,高炳淼. 生物技術(shù)進展. 2018(04)
[4]基于ITS序列研究南藥益智遺傳多樣性[J]. 郭藝,高炳淼,潘坤,侯杰,李永輝,張俊清. 分子植物育種. 2018(03)
[5]中國姜科野生資源的收集繁育與應用[J]. 熊秉紅,禹玉華,李素文,劉春艷,李璟,林澤明,周悅,胡豐. 中國野生植物資源. 2017(05)
[6]紫蘇醇溶性種子蛋白遺傳多樣性分析[J]. 吳珊,舒曉霞,馬宗祥. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2017(10)
[7]基于ISSR標記的海南高良姜種質(zhì)資源遺傳多樣性分析[J]. 潘坤,高炳淼,王阿超,張俊清. 分子植物育種. 2016(08)
[8]不同地區(qū)板藍根蛋白SDS-PAGE分析[J]. 楊欣,王秋紅,王悅,郭慧,邢娜,匡海學. 中國中醫(yī)藥信息雜志. 2015(07)
[9]南藥益智AFLP-PCR體系的建立與優(yōu)化[J]. 高炳淼,潘坤,田建平,唐天樂,魏娜,張俊清. 生物技術(shù). 2015(03)
[10]貴州6個白刺花種群種子貯藏蛋白的遺傳多樣性[J]. 馬林,王普昶,姚紅艷,趙麗麗,陳超,盧立娜. 貴州農(nóng)業(yè)科學. 2015(03)
本文編號:3224982
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)科學. 2020,48(14)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
3種不同方法提取益智蛋白的電泳圖
7種姜科植物的蛋白經(jīng)SDS-PAGE電泳分析,結(jié)果如圖2所示。由圖2可見,其分子量均分布在66.2~14.4 kDa。7種姜科植物中共檢測出52個遷移率不同的蛋白條帶,其中共有條帶為14個,多態(tài)性條帶38個,平均多態(tài)性比率為73.1%(表2)。7種姜科植物的蛋白譜帶數(shù)因材料而異。其中,爪哇白豆蔻分離出的蛋白譜帶數(shù)最多,共有11條蛋白條帶,分別為6條明帶和5條暗帶;光葉山姜材料分離出的蛋白譜帶數(shù)最少,只有5條蛋白譜帶且均是暗帶;草豆蔻和高良姜的蛋白譜帶分布非常相似,主要蛋白譜帶均有7條,分別為2條明帶和5條暗帶;益智和砂仁的蛋白譜帶均有8條,其差異是益智在97.4 kDa的附近有1條蛋白暗帶,砂仁在22.0 kDa附近處有1條蛋白暗帶。表 2 7種姜科植物的蛋白條帶統(tǒng)計Table 2 The statistical analysis of protein bands in seven species of Zingiberaceae plants 樣品名稱Sample 條帶數(shù)Bands//個 多態(tài)性條帶Polymorphic strip//個 多態(tài)性比率Polymorphic ratio//% 光葉山姜Alpinia intermedia 5 3 60.0 陽荷Zingiber striolatum 6 4 66.7 爪哇白豆蔻 Amomum compactum 11 9 81.8 草豆蔻Alpinia katsumadai 7 5 71.4 益智Alpinia oxyphylla 8 6 75.0 高良姜Alpinia officinarum 7 5 71.4 砂仁Amomum longiligular 8 6 75.0 總計Total 52 38 73.1
海南島姜科資源豐富,探究姜科植物資源的蛋白遺傳多樣性,闡明不同姜科植物種質(zhì)資源的親緣關(guān)系,可為姜科植物品種鑒定和保護提供理論依據(jù),進而推動姜科資源更深層的開發(fā)利用[18]。該研究通過優(yōu)化蛋白提取方法,采用SDS-PAGE電泳技術(shù)對7種不同的姜科植物蛋白遺傳多樣性進行了初步研究。結(jié)果表明,試劑盒法提取的蛋白效果最佳,姜科植物在蛋白水平上具有豐富的遺傳多樣性,可作為評價姜科植物遺傳多樣性的生化標記。蛋白遺傳多樣性研究是以SDS-PAGE電泳的蛋白條帶數(shù)、遷移位置、條帶顏色深淺作為評價指標,受到蛋白提取方法的影響比較大[19]。為避免這種誤差的影響,該研究以益智為材料進行蛋白提取方法的優(yōu)化。結(jié)果表明,試劑盒法提取的蛋白電泳條帶更多且清晰,而TCA/丙酮法和Tris-HCl法提取的蛋白電泳條帶少且不清晰。BCA蛋白濃度測定結(jié)果表明,蛋白濃度依次從大到小為試劑盒法>Tris-HCl法>TCA/丙酮法。因此,選用試劑盒法提取姜科植物蛋白是比較切實可行的方法。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]砂仁中化學成分及其藥理作用的研究進展[J]. 李麗麗,田文倉,劉茵,李永杰,曹曉霞,張偉. 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2018(22)
[2]4種金柑葉片蛋白質(zhì)提取方法比較分析[J]. 張宇,唐志鵬,秦榮耀,焦丁華,王長江. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2018(10)
[3]南藥益智SRAP-PCR體系優(yōu)化及引物篩選[J]. 歐虹雅,韓冬苗,黃茲寶,張明康,周聰聰,高炳淼. 生物技術(shù)進展. 2018(04)
[4]基于ITS序列研究南藥益智遺傳多樣性[J]. 郭藝,高炳淼,潘坤,侯杰,李永輝,張俊清. 分子植物育種. 2018(03)
[5]中國姜科野生資源的收集繁育與應用[J]. 熊秉紅,禹玉華,李素文,劉春艷,李璟,林澤明,周悅,胡豐. 中國野生植物資源. 2017(05)
[6]紫蘇醇溶性種子蛋白遺傳多樣性分析[J]. 吳珊,舒曉霞,馬宗祥. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2017(10)
[7]基于ISSR標記的海南高良姜種質(zhì)資源遺傳多樣性分析[J]. 潘坤,高炳淼,王阿超,張俊清. 分子植物育種. 2016(08)
[8]不同地區(qū)板藍根蛋白SDS-PAGE分析[J]. 楊欣,王秋紅,王悅,郭慧,邢娜,匡海學. 中國中醫(yī)藥信息雜志. 2015(07)
[9]南藥益智AFLP-PCR體系的建立與優(yōu)化[J]. 高炳淼,潘坤,田建平,唐天樂,魏娜,張俊清. 生物技術(shù). 2015(03)
[10]貴州6個白刺花種群種子貯藏蛋白的遺傳多樣性[J]. 馬林,王普昶,姚紅艷,趙麗麗,陳超,盧立娜. 貴州農(nóng)業(yè)科學. 2015(03)
本文編號:3224982
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