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引進(jìn)馴鹿種群的遺傳結(jié)構(gòu)及其多樣性分析

發(fā)布時間:2021-06-10 12:33
  馴鹿(Rangifr tarandus)是一種寒帶動物,廣泛分布于環(huán)北極圈地帶。在我國,馴鹿分布于大興安嶺西北部,由鄂溫克獵民所馴養(yǎng)。馴鹿是鄂溫克民族使鹿部落文化的重要載體,也是根河旅游產(chǎn)業(yè)的重要品牌,具有較高的經(jīng)濟(jì)價值和極其重要的生態(tài)價值。由于人類活動的干擾,長期的近親繁殖,粗放式的飼養(yǎng)管理,獸害及疾病的發(fā)生等,使種群數(shù)量一直徘徊在600頭左右,因此我國馴鹿的生存狀況與環(huán)境極其堪憂。針對此嚴(yán)峻狀況,基于恢復(fù)和改善我國馴鹿種群的考慮,根河林業(yè)局在內(nèi)蒙古自治區(qū)重大科技支撐項目的支持下,于2017年2月和2018年2月從芬蘭引進(jìn)馴鹿種群,旨在通過引進(jìn)來改良國內(nèi)馴鹿遺傳品質(zhì),豐富群體遺傳多樣性,從根本上擺脫我國馴鹿種群的瀕危狀況。但由于引進(jìn)馴鹿沒有系譜,親緣關(guān)系、群體遺傳結(jié)構(gòu)與多樣性也不清楚。因此,為了全面的科學(xué)評價所引進(jìn)馴鹿種群的遺傳結(jié)構(gòu)及其多樣性,本研究利用線粒體DNA D-Loop序列以及微衛(wèi)星技術(shù)分析了 129頭引進(jìn)馴鹿種群的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性,為今后合理利用所引進(jìn)的馴鹿種群資源提供了科學(xué)參考,研究結(jié)果如下:1.從19個微衛(wèi)星位點(diǎn)中篩選出14個擴(kuò)增效果良好且高度多態(tài)的位點(diǎn),共檢測出... 

【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:64 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

引進(jìn)馴鹿種群的遺傳結(jié)構(gòu)及其多樣性分析


圖3-1?Marker:?DL2000;?(A)引進(jìn)馴鹿種群部分血液樣品DNA提取結(jié)果;(B)糞便樣??DNA提取結(jié)果??

毛細(xì)管電泳,微衛(wèi)星位點(diǎn),基因分型,位點(diǎn)


進(jìn)行擴(kuò)增并分型。??微衛(wèi)星基因分型的結(jié)果顯示有14對微衛(wèi)星引物能夠在基因分型時有清晰明確的峰??圖(圖3-3),并且這14個位點(diǎn)的等位基因數(shù)均大于4,屬于多態(tài)位點(diǎn),故本試驗選取??這14個位點(diǎn)進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗。分別為:BM500、RT1、RT27、NVHRT01、NVHRT22、??NVHRT30、NVHRT31、NVHRT46、NVHRT48、T123、T156、T530、C143?和?C180。??06?21P?A(g?t?i???HOCa?it?;??it???r?[BBHSSBBBBBBBBB?BBI?'?■?■■?■:?'"?""ri:::' ̄?■??■?,》????J4£?tei????m?(????too??〇〇〇?I??〇i?*??????—??lj??jsz?J52.I6??#1?156(1)?j??sz?I56.3H???fat?2161?J????Q,8.05.?1P?H05A?.D07.丨HQM?钃;?級?i??i??1??1?.......’?v."????" ̄"1??n&-s?^s^A?;3?

序列,等位基因頻率分布


3.3.4多態(tài)位點(diǎn)及單核苷酸連鎖不平衡??在獲得的引進(jìn)馴鹿線粒體DNA?D-Loop序列中保守位點(diǎn)共448個,變異位點(diǎn)25??個,堿基C,T,A,G的基因頻率分別為23.57%,32.40%,?27.19%和丨6.84%?(圖3-6)。在??25個多態(tài)位點(diǎn)上發(fā)生了?26次突變,核苷酸的變異主要以轉(zhuǎn)換為主,包括23次轉(zhuǎn)換和3??次顛換,無插入和缺失,轉(zhuǎn)換/顛換的比值(R)為7.667。比值R越大,說明轉(zhuǎn)換發(fā)生??的概率越高,這與典型哺乳動物線粒體遺傳變異特點(diǎn)十分吻合[59]。利用DNAsp軟件計??算得到的核苷酸多樣度(Pi)為0.01022,平均核苷酸差異數(shù)(k)為4.834。??連鎖不平衡(linkage?disequilibrium;?LD)通常意義上是指兩個或多個基因座上的等??-25-??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]敖魯古雅馴鹿(Rangifer tarandus)食性及其棲息地容納量與種群生存力分析[D]. 殷亞杰.東北林業(yè)大學(xué) 2016

碩士論文
[1]使鹿部落馴鹿種群遺傳多樣性研究[D]. 翟健程.東北林業(yè)大學(xué) 2015
[2]豚鹿微衛(wèi)星位點(diǎn)的分離及其在親子鑒定中的應(yīng)用[D]. 連虹.浙江大學(xué) 2009
[3]黑龍江省完達(dá)山地區(qū)馬鹿的遺傳多樣性分析[D]. 尹君.東北林業(yè)大學(xué) 2007



本文編號:3222378

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