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花花柴抗逆相關轉(zhuǎn)錄因子WRKY的鑒定及分析

發(fā)布時間:2021-06-08 16:41
  WRKY轉(zhuǎn)錄因子作為參與生物或非生物脅迫應答的重要基因家族,在植物逆境脅迫的響應過程中起著重要作用。花花柴作為沙漠植物,具有極強的廣譜抗逆性,發(fā)掘并應用花花柴的抗逆基因資源對研究植物逆境生物學及抗逆性分子育種具有重要意義。本研究通過對沙漠植物花花柴的轉(zhuǎn)錄組學分析,篩選出與高溫脅迫相關的15個差異表達的WRKY基因。并將這15個基因與擬南芥、水稻的WRKY基因構建系統(tǒng)發(fā)育樹,通過對同亞族同源性較高的基因功能及其順式作用元件的功能預測,推測花花柴WRKY基因可能參與了極端溫度、干旱、高鹽、病原菌等逆境脅迫響應,并對與高溫脅迫響應相關的2個花花柴WRKY基因進行表達模式分析。該結(jié)果將為荒漠植物及其基因資源的發(fā)掘利用提供一定的參考價值。 

【文章來源】:塔里木大學學報. 2020,32(01)

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

花花柴抗逆相關轉(zhuǎn)錄因子WRKY的鑒定及分析


花花柴與擬南芥、水稻W(wǎng)RKY基因系統(tǒng)發(fā)育樹

模式圖,模式,基因,處理時間


從15個差異表達的WRKY基因中篩選兩個表達趨勢相反的基因:CL4493.Contig1_All、CL4998.Contig1_All進行表達模式分析。由圖4可以看出基因CL4493.Contig1_All在未處理時有較少量的表達,高溫處理2 h后表達量降低,在處理4 h后表達量明顯升高,在處理8 h后表達量較4 h低,但較未處理時高,在處理12 h后表達量在整個處理時間中最高;駽L4998.Contig1_All在處理4 h前表達量均較低,在處理4 h后表達量增加,但是在8 h后表達量降低,在處理12 h后表達量增加在整個處理過程中達到最高。3 討論

序列,花花柴,學分,基因


通過MEME軟件比對分析(如圖2),發(fā)現(xiàn)15個WRKY蛋白均含有WRKY家族絕對保守的氨基酸殘基WRKYGQK,有時也可采用WRKYGKK的形式[9],該結(jié)構是WRKY結(jié)構域中的核心序列。除WRKYGQK(WRKYGKK)序列具有高保守性,在第5位的D(天冬氨酸Asp)、第24位的R(精氨酸Arg)、第26位的Y(酪氨酸Tyr)、第29位的C(半胱氨酸)同樣具有高保守性。圖2 花花柴WRKY家族保守結(jié)構域序列比對

【參考文獻】:
期刊論文
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[7]柑橘4個WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及其響應柑橘潰瘍病菌侵染的表達分析[J]. 周鵬飛,賈瑞瑞,陳善春,許蘭珍,彭愛紅,雷天剛,李強,陳敏,白曉晶,鄒修平,何永睿.  園藝學報. 2017(03)
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[10]水稻OsWRKY7基因的表達研究[J]. 李茹,周潔,李冬月,王栩鳴,楊勇,余初浪,程曄,嚴成其,陳劍平.  中國水稻科學. 2015(06)



本文編號:3218803

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