花花柴抗逆相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子WRKY的鑒定及分析
發(fā)布時間:2021-06-08 16:41
WRKY轉(zhuǎn)錄因子作為參與生物或非生物脅迫應(yīng)答的重要基因家族,在植物逆境脅迫的響應(yīng)過程中起著重要作用;ɑú褡鳛樯衬参,具有極強(qiáng)的廣譜抗逆性,發(fā)掘并應(yīng)用花花柴的抗逆基因資源對研究植物逆境生物學(xué)及抗逆性分子育種具有重要意義。本研究通過對沙漠植物花花柴的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,篩選出與高溫脅迫相關(guān)的15個差異表達(dá)的WRKY基因。并將這15個基因與擬南芥、水稻的WRKY基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,通過對同亞族同源性較高的基因功能及其順式作用元件的功能預(yù)測,推測花花柴WRKY基因可能參與了極端溫度、干旱、高鹽、病原菌等逆境脅迫響應(yīng),并對與高溫脅迫響應(yīng)相關(guān)的2個花花柴WRKY基因進(jìn)行表達(dá)模式分析。該結(jié)果將為荒漠植物及其基因資源的發(fā)掘利用提供一定的參考價值。
【文章來源】:塔里木大學(xué)學(xué)報. 2020,32(01)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
花花柴與擬南芥、水稻W(wǎng)RKY基因系統(tǒng)發(fā)育樹
從15個差異表達(dá)的WRKY基因中篩選兩個表達(dá)趨勢相反的基因:CL4493.Contig1_All、CL4998.Contig1_All進(jìn)行表達(dá)模式分析。由圖4可以看出基因CL4493.Contig1_All在未處理時有較少量的表達(dá),高溫處理2 h后表達(dá)量降低,在處理4 h后表達(dá)量明顯升高,在處理8 h后表達(dá)量較4 h低,但較未處理時高,在處理12 h后表達(dá)量在整個處理時間中最高;駽L4998.Contig1_All在處理4 h前表達(dá)量均較低,在處理4 h后表達(dá)量增加,但是在8 h后表達(dá)量降低,在處理12 h后表達(dá)量增加在整個處理過程中達(dá)到最高。3 討論
通過MEME軟件比對分析(如圖2),發(fā)現(xiàn)15個WRKY蛋白均含有WRKY家族絕對保守的氨基酸殘基WRKYGQK,有時也可采用WRKYGKK的形式[9],該結(jié)構(gòu)是WRKY結(jié)構(gòu)域中的核心序列。除WRKYGQK(WRKYGKK)序列具有高保守性,在第5位的D(天冬氨酸Asp)、第24位的R(精氨酸Arg)、第26位的Y(酪氨酸Tyr)、第29位的C(半胱氨酸)同樣具有高保守性。圖2 花花柴WRKY家族保守結(jié)構(gòu)域序列比對
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]低溫脅迫下油棕WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因的表達(dá)特性分析[J]. 周麗霞,曹紅星. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(08)
[2]鹽脅迫下陸地棉耐鹽相關(guān)WRKY基因的表達(dá)分析[J]. 蔡繼鴻,徐鵬,張香桂,郭琪,徐珍珍,沈新蓮. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(18)
[3]鹽脅迫應(yīng)答基因GmWRKY6的克隆及轉(zhuǎn)基因百脈根的抗鹽分析[J]. 柯丹霞,彭昆鵬,夏遠(yuǎn)君,朱玉瑩,張丹丹. 草業(yè)學(xué)報. 2018(08)
[4]AtWRKY40參與擬南芥干旱脅迫響應(yīng)過程[J]. 車永梅,孫艷君,盧松沖,趙方貴,侯麗霞,劉新. 植物生理學(xué)報. 2018(03)
[5]干旱、高鹽及低溫脅迫下植物生理及轉(zhuǎn)錄因子的應(yīng)答調(diào)控[J]. 王冰,程憲國. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報. 2017(06)
[6]沙漠植物花花柴幼苗對高溫耐受性評價[J]. 王彥芹,石新建,李志軍. 生物技術(shù)通報. 2017(04)
[7]柑橘4個WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及其響應(yīng)柑橘潰瘍病菌侵染的表達(dá)分析[J]. 周鵬飛,賈瑞瑞,陳善春,許蘭珍,彭愛紅,雷天剛,李強(qiáng),陳敏,白曉晶,鄒修平,何永睿. 園藝學(xué)報. 2017(03)
[8]棉花逆境應(yīng)答GhWRKY2基因的結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測[J]. 司愛君,余渝,陳紅,田琴. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2017(02)
[9]WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族調(diào)控植物逆境脅迫響應(yīng)[J]. 孫淑豪,余迪求. 生物技術(shù)通報. 2016(10)
[10]水稻OsWRKY7基因的表達(dá)研究[J]. 李茹,周潔,李冬月,王栩鳴,楊勇,余初浪,程曄,嚴(yán)成其,陳劍平. 中國水稻科學(xué). 2015(06)
本文編號:3218803
【文章來源】:塔里木大學(xué)學(xué)報. 2020,32(01)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
花花柴與擬南芥、水稻W(wǎng)RKY基因系統(tǒng)發(fā)育樹
從15個差異表達(dá)的WRKY基因中篩選兩個表達(dá)趨勢相反的基因:CL4493.Contig1_All、CL4998.Contig1_All進(jìn)行表達(dá)模式分析。由圖4可以看出基因CL4493.Contig1_All在未處理時有較少量的表達(dá),高溫處理2 h后表達(dá)量降低,在處理4 h后表達(dá)量明顯升高,在處理8 h后表達(dá)量較4 h低,但較未處理時高,在處理12 h后表達(dá)量在整個處理時間中最高;駽L4998.Contig1_All在處理4 h前表達(dá)量均較低,在處理4 h后表達(dá)量增加,但是在8 h后表達(dá)量降低,在處理12 h后表達(dá)量增加在整個處理過程中達(dá)到最高。3 討論
通過MEME軟件比對分析(如圖2),發(fā)現(xiàn)15個WRKY蛋白均含有WRKY家族絕對保守的氨基酸殘基WRKYGQK,有時也可采用WRKYGKK的形式[9],該結(jié)構(gòu)是WRKY結(jié)構(gòu)域中的核心序列。除WRKYGQK(WRKYGKK)序列具有高保守性,在第5位的D(天冬氨酸Asp)、第24位的R(精氨酸Arg)、第26位的Y(酪氨酸Tyr)、第29位的C(半胱氨酸)同樣具有高保守性。圖2 花花柴WRKY家族保守結(jié)構(gòu)域序列比對
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]低溫脅迫下油棕WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因的表達(dá)特性分析[J]. 周麗霞,曹紅星. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(08)
[2]鹽脅迫下陸地棉耐鹽相關(guān)WRKY基因的表達(dá)分析[J]. 蔡繼鴻,徐鵬,張香桂,郭琪,徐珍珍,沈新蓮. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(18)
[3]鹽脅迫應(yīng)答基因GmWRKY6的克隆及轉(zhuǎn)基因百脈根的抗鹽分析[J]. 柯丹霞,彭昆鵬,夏遠(yuǎn)君,朱玉瑩,張丹丹. 草業(yè)學(xué)報. 2018(08)
[4]AtWRKY40參與擬南芥干旱脅迫響應(yīng)過程[J]. 車永梅,孫艷君,盧松沖,趙方貴,侯麗霞,劉新. 植物生理學(xué)報. 2018(03)
[5]干旱、高鹽及低溫脅迫下植物生理及轉(zhuǎn)錄因子的應(yīng)答調(diào)控[J]. 王冰,程憲國. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報. 2017(06)
[6]沙漠植物花花柴幼苗對高溫耐受性評價[J]. 王彥芹,石新建,李志軍. 生物技術(shù)通報. 2017(04)
[7]柑橘4個WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及其響應(yīng)柑橘潰瘍病菌侵染的表達(dá)分析[J]. 周鵬飛,賈瑞瑞,陳善春,許蘭珍,彭愛紅,雷天剛,李強(qiáng),陳敏,白曉晶,鄒修平,何永睿. 園藝學(xué)報. 2017(03)
[8]棉花逆境應(yīng)答GhWRKY2基因的結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測[J]. 司愛君,余渝,陳紅,田琴. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2017(02)
[9]WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族調(diào)控植物逆境脅迫響應(yīng)[J]. 孫淑豪,余迪求. 生物技術(shù)通報. 2016(10)
[10]水稻OsWRKY7基因的表達(dá)研究[J]. 李茹,周潔,李冬月,王栩鳴,楊勇,余初浪,程曄,嚴(yán)成其,陳劍平. 中國水稻科學(xué). 2015(06)
本文編號:3218803
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