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花花柴抗逆相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子WRKY的鑒定及分析

發(fā)布時間:2021-06-08 16:41
  WRKY轉(zhuǎn)錄因子作為參與生物或非生物脅迫應(yīng)答的重要基因家族,在植物逆境脅迫的響應(yīng)過程中起著重要作用;ɑú褡鳛樯衬参,具有極強(qiáng)的廣譜抗逆性,發(fā)掘并應(yīng)用花花柴的抗逆基因資源對研究植物逆境生物學(xué)及抗逆性分子育種具有重要意義。本研究通過對沙漠植物花花柴的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,篩選出與高溫脅迫相關(guān)的15個差異表達(dá)的WRKY基因。并將這15個基因與擬南芥、水稻的WRKY基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,通過對同亞族同源性較高的基因功能及其順式作用元件的功能預(yù)測,推測花花柴WRKY基因可能參與了極端溫度、干旱、高鹽、病原菌等逆境脅迫響應(yīng),并對與高溫脅迫響應(yīng)相關(guān)的2個花花柴WRKY基因進(jìn)行表達(dá)模式分析。該結(jié)果將為荒漠植物及其基因資源的發(fā)掘利用提供一定的參考價值。 

【文章來源】:塔里木大學(xué)學(xué)報. 2020,32(01)

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

花花柴抗逆相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子WRKY的鑒定及分析


花花柴與擬南芥、水稻W(wǎng)RKY基因系統(tǒng)發(fā)育樹

模式圖,模式,基因,處理時間


從15個差異表達(dá)的WRKY基因中篩選兩個表達(dá)趨勢相反的基因:CL4493.Contig1_All、CL4998.Contig1_All進(jìn)行表達(dá)模式分析。由圖4可以看出基因CL4493.Contig1_All在未處理時有較少量的表達(dá),高溫處理2 h后表達(dá)量降低,在處理4 h后表達(dá)量明顯升高,在處理8 h后表達(dá)量較4 h低,但較未處理時高,在處理12 h后表達(dá)量在整個處理時間中最高;駽L4998.Contig1_All在處理4 h前表達(dá)量均較低,在處理4 h后表達(dá)量增加,但是在8 h后表達(dá)量降低,在處理12 h后表達(dá)量增加在整個處理過程中達(dá)到最高。3 討論

序列,花花柴,學(xué)分,基因


通過MEME軟件比對分析(如圖2),發(fā)現(xiàn)15個WRKY蛋白均含有WRKY家族絕對保守的氨基酸殘基WRKYGQK,有時也可采用WRKYGKK的形式[9],該結(jié)構(gòu)是WRKY結(jié)構(gòu)域中的核心序列。除WRKYGQK(WRKYGKK)序列具有高保守性,在第5位的D(天冬氨酸Asp)、第24位的R(精氨酸Arg)、第26位的Y(酪氨酸Tyr)、第29位的C(半胱氨酸)同樣具有高保守性。圖2 花花柴WRKY家族保守結(jié)構(gòu)域序列比對

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3218803

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