植物MADS盒基因蛋白是一類在生物發(fā)育過程中起著重要作用的轉錄因子家族。本研究在前期大豆花芽轉錄組測序分析的基礎上,利用RACE技術成功克隆了一個MADS-box基因的全長cDNA序列,利用生物信息學方法對它所編碼的氨基酸基本性質和結構進行了系統(tǒng)分析。結果表明,該基因屬于MIKC家族,為親水性蛋白,穩(wěn)定性較好;二級結構中同時含有α-螺旋、β-轉角、延伸鏈和無規(guī)則卷曲結構,其中α-螺旋和無規(guī)則卷曲所占比例均較高;亞細胞定位分析顯示其定位在細胞核上;聚類分析表明該基因屬于AP3亞家族,該基因編碼的氨基酸與擬南芥AP3蛋白的同源性為41.18%,與大豆中GmNMH7的同源性最高為97%,命名該基因為GmAP3。本研究成功克隆出GmAP3基因,為該基因的進一步研究提供實驗材料,并通過生物信息學分析預測,為下一步該基因的功能研究提供依據。 

【文章來源】：分子植物育種. 2020,18(03)北大核心CSCD

【文章頁數】：8 頁

【部分圖文】：

差異基因GmMADS NCBI BLASTn比對

大豆花芽總RNA提取的瓊脂糖凝膠電泳

差異基因中間片段RT-PCR擴增及菌液PCR

【參考文獻】：
期刊論文
[1]銀杏MADS-box基因家族的表達及系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 董金金,劉偉,李萌,王俊燚,何崇單,蔡雨蒙,王啟業(yè),王義強.  植物生理學報. 2018(06)
[2]梨兩個休眠相關MADS-box基因特征及在其休眠過程中的表達分析[J]. 劉國琴,鄭鵬華,Sayed Hussain,滕元文.  園藝學報. 2013(04)
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本文編號：3216982