植物MADS盒基因蛋白是一類在生物發(fā)育過程中起著重要作用的轉(zhuǎn)錄因子家族。本研究在前期大豆花芽轉(zhuǎn)錄組測序分析的基礎(chǔ)上,利用RACE技術(shù)成功克隆了一個(gè)MADS-box基因的全長cDNA序列,利用生物信息學(xué)方法對它所編碼的氨基酸基本性質(zhì)和結(jié)構(gòu)進(jìn)行了系統(tǒng)分析。結(jié)果表明,該基因?qū)儆贛IKC家族,為親水性蛋白,穩(wěn)定性較好;二級結(jié)構(gòu)中同時(shí)含有α-螺旋、β-轉(zhuǎn)角、延伸鏈和無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu),其中α-螺旋和無規(guī)則卷曲所占比例均較高;亞細(xì)胞定位分析顯示其定位在細(xì)胞核上;聚類分析表明該基因?qū)儆贏P3亞家族,該基因編碼的氨基酸與擬南芥AP3蛋白的同源性為41.18%,與大豆中GmNMH7的同源性最高為97%,命名該基因?yàn)镚mAP3。本研究成功克隆出GmAP3基因,為該基因的進(jìn)一步研究提供實(shí)驗(yàn)材料,并通過生物信息學(xué)分析預(yù)測,為下一步該基因的功能研究提供依據(jù)。 

【文章來源】：分子植物育種. 2020,18(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

差異基因GmMADS NCBI BLASTn比對

大豆花芽總RNA提取的瓊脂糖凝膠電泳

差異基因中間片段RT-PCR擴(kuò)增及菌液PCR

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]銀杏MADS-box基因家族的表達(dá)及系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 董金金,劉偉,李萌,王俊燚,何崇單,蔡雨蒙,王啟業(yè),王義強(qiáng).  植物生理學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]梨兩個(gè)休眠相關(guān)MADS-box基因特征及在其休眠過程中的表達(dá)分析[J]. 劉國琴,鄭鵬華,Sayed Hussain,滕元文.  園藝學(xué)報(bào). 2013(04)
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本文編號：3216982