矮鳶尾的親緣地理學研究
發(fā)布時間:2021-05-15 12:22
第四紀冰期時,氣候和環(huán)境的劇烈變化,對現(xiàn)今物種的分布格局產(chǎn)生了深遠的影響。隨著親緣地理學的興起和發(fā)展,為物種的譜系發(fā)育、冰期避難所等相關(guān)研究提供了更加便捷、高效的方法,對揭示現(xiàn)存物種的空間分布格局、群體遺傳結(jié)構(gòu)、多樣性的形成機制等問題提供了新的手段,開啟了嶄新的研究領(lǐng)域。矮鳶尾(Iris kobayashii Kitagawa)是隸屬于鳶尾科(Iridaceae)鳶尾屬(Iris)的多年生草本植物,為我國特有物種,主要分布在松嫩草原、遼東半島南端、山東半島等地區(qū)。為了解第四紀氣候波動對矮鳶尾種群進化歷史的影響,本研究基于10個葉綠體DNA(cpDNA)片段和11個核微衛(wèi)星(nSSR)位點,對采集于主要分布區(qū)的6個居群、65個矮鳶尾個體,開展了親緣地理學研究,以期揭示矮鳶尾的親緣地理模式、可能的遺傳多樣性中心,探究矮鳶尾的遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu),進而揭示不同分布區(qū)矮鳶尾的起源。cpDNA遺傳多樣性分析和基于nSSR數(shù)據(jù)的分析表明,在區(qū)域水平上,大連南關(guān)嶺地區(qū)的矮鳶尾居群具有最高的遺傳多樣性(NG:Hd=0.591,π=0.00086),所擁有的單倍型最多(H3、H...
【文章來源】:東北師范大學吉林省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:48 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 第四紀冰期
1.1.1 第四紀冰期對生物分布的影響
1.2 冰期避難所
1.3 親緣地理學
1.3.1 親緣地理學簡介
1.3.2 親緣地理學的發(fā)展歷史
1.3.3 概念模型
1.3.4 親緣地理學的研究方法
1.4 矮鳶尾概況
1.4.1 矮鳶尾的生物學特征
1.4.2 相關(guān)研究進展
1.5 研究目的及意義
第二章 實驗材料和方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.2.1 基因組DNA的提取
2.2.2 電泳檢測基因組DNA
第三章 基于cp DNA基因的矮鳶尾親緣地理學研究
3.1 cpDNA引物的篩選
3.1.1 篩選步驟
3.1.2 篩選結(jié)果
3.2 數(shù)據(jù)分析
3.2.1 數(shù)據(jù)比對和編輯
3.2.2 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 遺傳多樣性分析
3.3.2 群體動態(tài)歷史
3.3.3 遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.3.3.1 SAMOVA分析
3.3.3.2 單倍型和親緣地理關(guān)系分析
3.3.3.3 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
第四章 基于nSSR標記的矮鳶尾親緣地理學研究
4.1 矮鳶尾核微衛(wèi)星引物的開發(fā)
4.1.1 實驗材料
4.1.2 實驗方法
4.2 數(shù)據(jù)分析
4.2.1 數(shù)據(jù)判讀
4.2.2 數(shù)據(jù)分析
4.3 結(jié)果分析
4.3.1 遺傳多樣性分析
4.3.2 居群間的遺傳結(jié)構(gòu)分析
4.3.3 聚類分析
第五章 討論
5.1 矮鳶尾的遺傳多樣性
5.2 矮鳶尾的遺傳結(jié)構(gòu)
5.3 冰期避難所
5.4 矮鳶尾的保護策略
第六章 結(jié)論與展望
6.1 結(jié)論
6.2 展望
參考文獻
附錄
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鳶尾屬觀賞植物培養(yǎng)與園林造景利用探究[J]. 丁憲進,翁云峰. 現(xiàn)代園藝. 2017(04)
[2]濱海區(qū)黃花鳶尾的耐鹽堿性及氮磷去除效果[J]. 陳廣琳,陳友媛,孫萍,王翔宇,李勝玲,孫鵬鵬. 中國環(huán)境科學. 2015(11)
[3]基于SRAP的15種鳶尾的遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析[J]. 許玉鳳,閆小風,邵美妮,關(guān)萍,陳旭輝,曲波. 沈陽農(nóng)業(yè)大學學報. 2015(05)
[4]甘肅省鳶尾屬植物資源及開發(fā)利用[J]. 張德祥. 特種經(jīng)濟動植物. 2015(03)
[5]青藏高原及其毗鄰山區(qū)蒙古繡線菊譜系地理學研究[J]. 王久利,高慶波,付鵬程,GULZAR Khan,陳世龍,張發(fā)起. 西北植物學報. 2014(10)
[6]植物親緣地理學的研究現(xiàn)狀與發(fā)展趨勢[J]. 白偉寧,張大勇. 生命科學. 2014(02)
[7]南方紅豆杉譜系地理學研究[J]. 張雪梅,李德銖,高連明. 西北植物學報. 2012(10)
[8]中國大陸第四紀冰期潛在植物避難所研究進展[J]. 陳冬梅,康宏樟,劉春江. 植物研究. 2011(05)
[9]葉綠體基因組進化的速率和方式[J]. 唐萍,彭程. 生物學通報. 2010(06)
[10]SSR分子標記及其在植物遺傳分析中的應用[J]. 譚月萍,黃建安,劉仲華,尹鐘. 中國茶葉. 2009(03)
博士論文
[1]東北地區(qū)野生鳶尾屬植物的分類與評價研究[D]. 鄭洋.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2016
[2]東亞特有瀕危植物黃山梅的親緣地理學與群體遺傳學研究[D]. 孫逸.浙江大學 2012
[3]基于cpDNA單倍型和SSR分析的銀杏群體遺傳結(jié)構(gòu)和譜系地理學研究[D]. 閆小玲.浙江大學 2010
[4]馬藺繁殖生物學特性及遺傳多樣性研究[D]. 王育青.中國農(nóng)業(yè)科學院 2010
[5]孑遺植物銀杏的分子親緣地理學研究[D]. 龔維.浙江大學 2007
碩士論文
[1]基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒蘭群體遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性研究[D]. 江亞雯.南昌大學 2017
[2]基于葉綠體DNA的興安杜鵑遺傳結(jié)構(gòu)與親緣地理學研究[D]. 姜楠.東北師范大學 2016
[3]中國特有珍稀植物天目木姜子遺傳多樣性與親緣地理學研究[D]. 孫林.南京大學 2014
[4]東亞針刺菝葜的系統(tǒng)發(fā)育學及親緣地理學研究[D]. 馬煒煒.浙江大學 2012
[5]基于多基因組的鳶尾屬部分種的系統(tǒng)分類研究[D]. 仲軼.東北林業(yè)大學 2010
本文編號:3187624
【文章來源】:東北師范大學吉林省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:48 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 第四紀冰期
1.1.1 第四紀冰期對生物分布的影響
1.2 冰期避難所
1.3 親緣地理學
1.3.1 親緣地理學簡介
1.3.2 親緣地理學的發(fā)展歷史
1.3.3 概念模型
1.3.4 親緣地理學的研究方法
1.4 矮鳶尾概況
1.4.1 矮鳶尾的生物學特征
1.4.2 相關(guān)研究進展
1.5 研究目的及意義
第二章 實驗材料和方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.2.1 基因組DNA的提取
2.2.2 電泳檢測基因組DNA
第三章 基于cp DNA基因的矮鳶尾親緣地理學研究
3.1 cpDNA引物的篩選
3.1.1 篩選步驟
3.1.2 篩選結(jié)果
3.2 數(shù)據(jù)分析
3.2.1 數(shù)據(jù)比對和編輯
3.2.2 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 遺傳多樣性分析
3.3.2 群體動態(tài)歷史
3.3.3 遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.3.3.1 SAMOVA分析
3.3.3.2 單倍型和親緣地理關(guān)系分析
3.3.3.3 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
第四章 基于nSSR標記的矮鳶尾親緣地理學研究
4.1 矮鳶尾核微衛(wèi)星引物的開發(fā)
4.1.1 實驗材料
4.1.2 實驗方法
4.2 數(shù)據(jù)分析
4.2.1 數(shù)據(jù)判讀
4.2.2 數(shù)據(jù)分析
4.3 結(jié)果分析
4.3.1 遺傳多樣性分析
4.3.2 居群間的遺傳結(jié)構(gòu)分析
4.3.3 聚類分析
第五章 討論
5.1 矮鳶尾的遺傳多樣性
5.2 矮鳶尾的遺傳結(jié)構(gòu)
5.3 冰期避難所
5.4 矮鳶尾的保護策略
第六章 結(jié)論與展望
6.1 結(jié)論
6.2 展望
參考文獻
附錄
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鳶尾屬觀賞植物培養(yǎng)與園林造景利用探究[J]. 丁憲進,翁云峰. 現(xiàn)代園藝. 2017(04)
[2]濱海區(qū)黃花鳶尾的耐鹽堿性及氮磷去除效果[J]. 陳廣琳,陳友媛,孫萍,王翔宇,李勝玲,孫鵬鵬. 中國環(huán)境科學. 2015(11)
[3]基于SRAP的15種鳶尾的遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析[J]. 許玉鳳,閆小風,邵美妮,關(guān)萍,陳旭輝,曲波. 沈陽農(nóng)業(yè)大學學報. 2015(05)
[4]甘肅省鳶尾屬植物資源及開發(fā)利用[J]. 張德祥. 特種經(jīng)濟動植物. 2015(03)
[5]青藏高原及其毗鄰山區(qū)蒙古繡線菊譜系地理學研究[J]. 王久利,高慶波,付鵬程,GULZAR Khan,陳世龍,張發(fā)起. 西北植物學報. 2014(10)
[6]植物親緣地理學的研究現(xiàn)狀與發(fā)展趨勢[J]. 白偉寧,張大勇. 生命科學. 2014(02)
[7]南方紅豆杉譜系地理學研究[J]. 張雪梅,李德銖,高連明. 西北植物學報. 2012(10)
[8]中國大陸第四紀冰期潛在植物避難所研究進展[J]. 陳冬梅,康宏樟,劉春江. 植物研究. 2011(05)
[9]葉綠體基因組進化的速率和方式[J]. 唐萍,彭程. 生物學通報. 2010(06)
[10]SSR分子標記及其在植物遺傳分析中的應用[J]. 譚月萍,黃建安,劉仲華,尹鐘. 中國茶葉. 2009(03)
博士論文
[1]東北地區(qū)野生鳶尾屬植物的分類與評價研究[D]. 鄭洋.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2016
[2]東亞特有瀕危植物黃山梅的親緣地理學與群體遺傳學研究[D]. 孫逸.浙江大學 2012
[3]基于cpDNA單倍型和SSR分析的銀杏群體遺傳結(jié)構(gòu)和譜系地理學研究[D]. 閆小玲.浙江大學 2010
[4]馬藺繁殖生物學特性及遺傳多樣性研究[D]. 王育青.中國農(nóng)業(yè)科學院 2010
[5]孑遺植物銀杏的分子親緣地理學研究[D]. 龔維.浙江大學 2007
碩士論文
[1]基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒蘭群體遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性研究[D]. 江亞雯.南昌大學 2017
[2]基于葉綠體DNA的興安杜鵑遺傳結(jié)構(gòu)與親緣地理學研究[D]. 姜楠.東北師范大學 2016
[3]中國特有珍稀植物天目木姜子遺傳多樣性與親緣地理學研究[D]. 孫林.南京大學 2014
[4]東亞針刺菝葜的系統(tǒng)發(fā)育學及親緣地理學研究[D]. 馬煒煒.浙江大學 2012
[5]基于多基因組的鳶尾屬部分種的系統(tǒng)分類研究[D]. 仲軼.東北林業(yè)大學 2010
本文編號:3187624
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