生物質(zhì)能是自然界中的一種可再生清潔能源,具有可獲取性強、污染極小、資源總量大等特點,隨著世界石油能源越來越匱乏和全球氣候的劇烈演變,提高生物質(zhì)能的生成速率,對能源體系的建立和發(fā)展有著十分重要的意義。光合生物藍細菌聚球藻作為唯一一種可以儲存和運輸?shù)目稍偕茉?可通過光合作用將光能轉(zhuǎn)化為儲存在生物體內(nèi)部的生物質(zhì)能。聚球藻所具有的分布極廣、易于存活、強固氮能力和全球碳循環(huán)的主要參與者的特點,使它成為近些年來的熱門研究對象。生物體將體內(nèi)各個組分和結(jié)構(gòu)單元相互聯(lián)系成為一個整體,從生物體細胞代謝全局的角度著手,可對生物體內(nèi)復(fù)雜的功能與作用進行研究。通過對生物體進行代謝網(wǎng)絡(luò)層面上的研究,可以了解生物體的代謝過程和網(wǎng)絡(luò)特性,為更好的認(rèn)識生物體生命演化、促進生物工程進一步發(fā)展和生產(chǎn)優(yōu)良目標(biāo)代謝物打下堅實的基礎(chǔ)。本文以聚球藻的iJB785模型為實驗對象,研究代謝網(wǎng)絡(luò)的特性和內(nèi)在聯(lián)系,并利用計算機進行模擬仿真實驗。建立基于約束的代謝網(wǎng)絡(luò)模型,利用通量平衡分析（FBA）敲除不同的反應(yīng),通過觀察分析這些被敲除的反應(yīng)對代謝網(wǎng)絡(luò)中其他反應(yīng)和重要代謝途徑的影響情況,找到影響較大的幾個反應(yīng),并觀察這些反應(yīng)對生物體目標(biāo)函... 

【文章來源】：貴州師范大學(xué)貴州省

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 代謝網(wǎng)絡(luò)研究背景及生物學(xué)意義
        1.1.1 系統(tǒng)生物學(xué)
        1.1.2 代謝網(wǎng)絡(luò)
    1.2 光合作用和光合生物聚球藻
    1.3 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    1.4 主要研究內(nèi)容
    1.5 論文的組織結(jié)構(gòu)
第二章 生物學(xué)數(shù)據(jù)及模型構(gòu)建
    2.1 分析生物學(xué)數(shù)據(jù)的工具及數(shù)據(jù)來源
        2.1.1 分析生物學(xué)數(shù)據(jù)的工具
        2.1.2 數(shù)據(jù)來源
    2.2 實驗環(huán)境
    2.3 模型的構(gòu)建
        2.3.1 模型的加載與初始化
        2.3.2 模型的調(diào)試
    2.4 小結(jié)
第三章 代謝網(wǎng)絡(luò)模型分析方法與應(yīng)用
    3.1 iJB785代謝網(wǎng)絡(luò)模型的特性
        3.1.1 代謝反應(yīng)和代謝物的區(qū)室劃分
        3.1.2 代謝途徑的劃分
        3.1.3 代謝網(wǎng)絡(luò)中重要的子系統(tǒng)
    3.2 基于約束的建模方法介紹
        3.2.1 通量平衡分析
        3.2.2 通量可變性分析
        3.2.3 均勻隨機取樣分析
    3.3 實驗結(jié)果與討論
        3.3.1 通量平衡分析結(jié)果與討論
        3.3.2 通量可變性分析結(jié)果與討論
        3.3.3 均勻隨機取樣分析結(jié)果與討論
    3.4 小結(jié)
第四章 多目標(biāo)優(yōu)化方法研究代謝網(wǎng)絡(luò)
    4.1 方法介紹
    4.2 實驗結(jié)果與討論
    4.3 小結(jié)
第五章 總結(jié)與展望
參考文獻
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間科研和論文情況


【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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[10]甘油代謝目標(biāo)函數(shù)計算問題的多層規(guī)劃模型與求解方法[D]. 張黎.渤海大學(xué) 2016



本文編號：3182322