巴戟天MoDXR基因及其啟動子的克隆與分析
發(fā)布時間:2021-05-11 16:14
從巴戟天中克隆MEP途徑中的1-脫氧-D-木酮糖5-磷酸還原異構(gòu)酶基因MoDXR及其啟動子序列,并進行生物信息學分析、啟動子區(qū)順式作用元件分析,以及進行原核表達分析。根據(jù)巴戟天轉(zhuǎn)錄組中DXR基因原始序列和NCBI-ORFfinder分析,設計特異性引物,并進行RT-PCR擴增和生物信息學分析;采用染色體步移克隆MoDXR基因的5′端啟動子序列;通過亞細胞定位分析MoDXR基因在細胞中的位置;構(gòu)建原核表達載體pET-28a-MoDXR,導入BL21(DE3)表達感受態(tài)細胞后,在IPTG誘導下表達。從巴戟天中克隆的MoDXR基因,其cDNA全長2 015 bp,預測的閱讀框大小為1 425 bp,編碼474個氨基酸,分子質(zhì)量為51.27 kDa; BlastP序列比對分析表明MoDXR基因與其他植物的DXR基因具有高度同源性,如:咖啡樹DXR (CaDXR)、蘿芙木DXR (RvDXR);系統(tǒng)進化發(fā)育樹分析顯示,巴戟天MoDXR蛋白與小粒咖啡和梔子的DXR蛋白聚為一類,其親緣關(guān)系最近;由亞細胞定位可知MoDXR基因所編碼的蛋白定位于葉綠體上; MoDXR基因5′端啟動子序列長度為1 493...
【文章來源】:藥學學報. 2020,55(02)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
材料與方法
結(jié)果與分析
1 巴戟天MoDXR基因克隆
2 巴戟天MoDXR生物信息學分析
3 巴戟天MoDXR基因啟動子區(qū)順式作用元件分析
4 MoDXR亞細胞定位分析
5 巴戟天MoDXR蛋白原核表達分析
6 巴戟天MoDXR基因相對表達量分析
討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]茜草轉(zhuǎn)錄組分析及其蒽醌類化合物合成相關(guān)基因的挖掘[J]. 彭亮,張崗,顏永剛,孫濤,王媚,李潔,羅露,曹福麟,胡本祥,楊冰月. 中草藥. 2018(08)
[2]茜草科植物環(huán)烯醚萜類化合物的研究進展[J]. 廖鐵松,閔建新,潘玲玲,吳亞芬,萬娜,劉宏棟,李斌. 中草藥. 2018(06)
[3]地黃RgDXR基因的克隆及表達分析[J]. 朱畇昊,董誠明,俎夢航,李攀登,趙樂. 植物生理學報. 2017(04)
[4]香樟1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸還原異構(gòu)酶基因CcDXR1的克隆和表達分析[J]. 鄭漢,荊禮,姚娜,楊青山,彭華勝,申業(yè),黃璐琦. 藥學學報. 2016(09)
[5]基于CRISPR/Cas9技術(shù)的煙草NtDXR基因敲除及功能分析[J]. 聶夢云,高軍平,羅培,陳曉樂,易小慧,王根洪,夏慶友. 煙草科技. 2016(06)
[6]滇龍膽1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸還原異構(gòu)酶基因GrDXR的克隆、序列分析與原核表達[J]. 張曉東,趙靜,李彩霞,李濤,王元忠. 中草藥. 2014(16)
[7]高良姜1-脫氧-D-木酮糖5-磷酸還原異構(gòu)酶cDNA克隆與表達調(diào)控[J]. 張春榮,楊全,陳虎彪,龐玉新,唐曉敏,程軒軒,吳文雅,陳詩敏. 中國中藥雜志. 2012(21)
本文編號:3181711
【文章來源】:藥學學報. 2020,55(02)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
材料與方法
結(jié)果與分析
1 巴戟天MoDXR基因克隆
2 巴戟天MoDXR生物信息學分析
3 巴戟天MoDXR基因啟動子區(qū)順式作用元件分析
4 MoDXR亞細胞定位分析
5 巴戟天MoDXR蛋白原核表達分析
6 巴戟天MoDXR基因相對表達量分析
討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]茜草轉(zhuǎn)錄組分析及其蒽醌類化合物合成相關(guān)基因的挖掘[J]. 彭亮,張崗,顏永剛,孫濤,王媚,李潔,羅露,曹福麟,胡本祥,楊冰月. 中草藥. 2018(08)
[2]茜草科植物環(huán)烯醚萜類化合物的研究進展[J]. 廖鐵松,閔建新,潘玲玲,吳亞芬,萬娜,劉宏棟,李斌. 中草藥. 2018(06)
[3]地黃RgDXR基因的克隆及表達分析[J]. 朱畇昊,董誠明,俎夢航,李攀登,趙樂. 植物生理學報. 2017(04)
[4]香樟1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸還原異構(gòu)酶基因CcDXR1的克隆和表達分析[J]. 鄭漢,荊禮,姚娜,楊青山,彭華勝,申業(yè),黃璐琦. 藥學學報. 2016(09)
[5]基于CRISPR/Cas9技術(shù)的煙草NtDXR基因敲除及功能分析[J]. 聶夢云,高軍平,羅培,陳曉樂,易小慧,王根洪,夏慶友. 煙草科技. 2016(06)
[6]滇龍膽1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸還原異構(gòu)酶基因GrDXR的克隆、序列分析與原核表達[J]. 張曉東,趙靜,李彩霞,李濤,王元忠. 中草藥. 2014(16)
[7]高良姜1-脫氧-D-木酮糖5-磷酸還原異構(gòu)酶cDNA克隆與表達調(diào)控[J]. 張春榮,楊全,陳虎彪,龐玉新,唐曉敏,程軒軒,吳文雅,陳詩敏. 中國中藥雜志. 2012(21)
本文編號:3181711
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