為了更好地了解煙草葉綠體基因組中RNA編輯位點(diǎn)的數(shù)量及它們發(fā)揮的功能,本研究借助煙草3種器官（葉,花,根）的基因組測(cè)序數(shù)據(jù)及RNA測(cè)序數(shù)據(jù),對(duì)煙草葉綠體基因組里胞嘧啶（C）轉(zhuǎn)換為尿嘧啶（U）的RNA編輯位點(diǎn)進(jìn)行了鑒定。在煙草葉綠體基因組中,發(fā)現(xiàn)了1 002個(gè)RNA編輯位點(diǎn)。609個(gè)編輯位點(diǎn)位于63個(gè)蛋白編碼基因,占所有編輯位點(diǎn)的60.8%,其中無(wú)義突變的編輯位點(diǎn)46個(gè)。蛋白編碼基因中,rpoC2、ycf1和ndhD發(fā)生的編輯位點(diǎn)最多,RNA基因中trnG、trnfM和trnD有最多的編輯位點(diǎn)。對(duì)葉、花和根中的編輯位點(diǎn)進(jìn)行比較,根的RNA編輯位點(diǎn)最多,為652個(gè)。這些無(wú)義突變的RNA編輯位點(diǎn),在花、根中主要是影響參與光合作用的基因,而在葉中這些基因未受影響。表明RNA編輯作為轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的一種方式,對(duì)于維持不同器官的功能是非常重要的。本研究為進(jìn)一步研究煙草RNA編輯的生物學(xué)功能提供幫助。 

【文章來(lái)源】：分子植物育種. 2020,18(20)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 RNA編輯位點(diǎn)
    1.2 葉的編輯位點(diǎn)
    1.3 花的編輯位點(diǎn)
    1.4 根的編輯位點(diǎn)
    1.5 葉、花、根編輯位點(diǎn)比較
2 討論
3 材料與方法
    3.1 數(shù)據(jù)及實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
    3.2 數(shù)據(jù)質(zhì)控及比對(duì)到參考基因組
    3.3 鑒定RNA編輯位點(diǎn)
作者貢獻(xiàn)


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]蒙古扁桃nrDNA ITS和cpDNA trnH-psbA序列分子進(jìn)化特點(diǎn)研究[J]. 段義忠,王建武,亢福仁,李娟.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(07)
[2]RNA editing machinery in plant organelles[J]. Junjie Yan,Qunxia Zhang,Ping Yin.  Science China（Life Sciences）. 2018(02)
[3]大麥葉綠體基因RNA編輯位點(diǎn)的預(yù)測(cè)與鑒定[J]. 馬紅戰(zhàn),張保軍,樊虎玲.  麥類(lèi)作物學(xué)報(bào). 2013(06)
[4]煙草表達(dá)抗病基因同源物（RGA）的鑒定及RGA-SSR標(biāo)記的開(kāi)發(fā)[J]. 袁清華,謝銳鴻,張振臣,馬柱文,李集勤,李淑玲,陳俊標(biāo).  作物學(xué)報(bào). 2014(02)



本文編號(hào)：3159585